概括
基因 4340
象征
同义词 btn6 | btnl11 | mogig2 | nrclp7
描述 髓磷脂少突胶质细胞糖蛋白
参考 MIM:159465|HGNC:HGNC:7197|Ensembl:ENSG00000204655|HPRD:11831|Vega:Otthumg0000000031099
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p22.1
Pascal P值 5.276e-12
Sherlock P值 0.206
胎儿beta -3.407
DMG 1(#研究)
支持 细胞粘附和透射信号传导
G2CDB.HUMANNRC
G2CDB.HUMANPSD
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3
PMID:COOCCUR 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 一个组合比值比方法(Sun等。2008),协会研究 1 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG18488651 6 29633673 5.2e-5 -0.741 0.022 DMG:Wockner_2014
CG16118803 6 29629716 4.6e-4 -0.389 0.046 DMG:Wockner_2014
CG06061002 6 29638918 5.144e-4 -0.536 0.047 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去:0007417 中枢神经系统发展 tas 大脑(GO期限:6) 1373175
细胞成分 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 nas 8530032

V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
Ropero HDAC2目标 114 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿斯顿主要抑郁症DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 293 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Neotex up 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein少突胶质细胞标记 74 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因