基因页:猫
概括?
基因 | 4340 |
象征 | 猫 |
同义词 | btn6 | btnl11 | mogig2 | nrclp7 |
描述 | 髓磷脂少突胶质细胞糖蛋白 |
参考 | MIM:159465|HGNC:HGNC:7197|Ensembl:ENSG00000204655|HPRD:11831|Vega:Otthumg0000000031099 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p22.1 |
Pascal P值 | 5.276e-12 |
Sherlock P值 | 0.206 |
胎儿beta | -3.407 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | 细胞粘附和透射信号传导 G2CDB.HUMANNRC G2CDB.HUMANPSD G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 3 |
PMID:COOCCUR | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 一个组合比值比方法(Sun等。2008),协会研究 | 1 | 链接到Szgene |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG18488651 | 6 | 29633673 | 猫 | 5.2e-5 | -0.741 | 0.022 | DMG:Wockner_2014 |
CG16118803 | 6 | 29629716 | 猫 | 4.6e-4 | -0.389 | 0.046 | DMG:Wockner_2014 |
CG06061002 | 6 | 29638918 | 猫 | 5.144e-4 | -0.536 | 0.047 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MOG_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0007417 | 中枢神经系统发展 | tas | 大脑(GO期限:6) | 1373175 |
细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | nas | 8530032 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Ropero HDAC2目标 | 114 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿斯顿主要抑郁症DN | 160 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Neotex up | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein少突胶质细胞标记 | 74 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |