概括
基因 4343
象征 mov10
同义词 FSAP113 | GB110
描述 MOV10 RISC复合RNA解旋酶
参考 MIM:610742|HGNC:HGNC:7200|ENSEMBL:ENSG0000015536​​3|HPRD:14732|Vega:Otthumg00000011906
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p13.2
Pascal P值 3.413E-4
Sherlock P值 0.56
TADA P值 0.003
胎儿β -0.341
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0235

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
mov10 CHR1 113242568 一个 交流 NM_001130079
NM_020963

边框
边框
精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10126993 Chrx 35885796 mov10 4343 0.18 反式
RS4501739 Chrx 35960848 mov10 4343 0 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003674 Molecular_Function nd -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004386 解旋酶活性 IEA -
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008150 生物_Process nd -
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005575 cellular_component nd -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome PreNCH的转录和翻译 29 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Pre Notch表达和处理 44 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Notch的Reactome信号传导 103 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans 185 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 143 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向 112 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO干扰素诱导的抗病毒模块 78 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-138 24 30 M8 HSA-MIR-138 Agcugguuguguugaauc
mir-15/16/195/424/497 167 173 1a HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-153 223 230 1A,M8 HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-30-5p 112 118 1a HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-448 224 230 1a HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-503 167 173 1a HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag