基因页:MPI
概括?
基因 | 4351 |
象征 | MPI |
同义词 | CDG1B | PMI | PMI1 |
描述 | 甘露糖磷酸异构酶 |
参考 | MIM:154550|HGNC:HGNC:7216|ENSEMBL:ENSG00000178802|HPRD:01108|Vega:Otthumg00000142826 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q24.1 |
Pascal P值 | 0.085 |
Sherlock P值 | 0.445 |
胎儿β | -1.211 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症的关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01182386 | 15 | 75182373 | MPI | 3.015E-4 | -0.211 | 0.04 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11072507 | 15 | 75054866 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.406E-6 | 0.01 | -127480 | gtex_brain_ba24 |
RS373715524 | 15 | 75057745 | MPI | ENSG00000178802.13 | 7.37E-7 | 0.01 | -124601 | gtex_brain_ba24 |
RS201618682 | 15 | 75057747 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.21E-6 | 0.01 | -124599 | gtex_brain_ba24 |
RS12903541 | 15 | 75059627 | MPI | ENSG00000178802.13 | 6.41E-7 | 0.01 | -122719 | gtex_brain_ba24 |
RS11632414 | 15 | 75061916 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.853E-7 | 0.01 | -120430 | gtex_brain_ba24 |
RS12909307 | 15 | 75061929 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.849E-7 | 0.01 | -120417 | gtex_brain_ba24 |
RS11072508 | 15 | 75062397 | MPI | ENSG00000178802.13 | 6.117E-7 | 0.01 | -119949 | gtex_brain_ba24 |
RS4886410 | 15 | 75065644 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.21E-6 | 0.01 | -116702 | gtex_brain_ba24 |
RS12905199 | 15 | 75070196 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.199E-6 | 0.01 | -112150 | gtex_brain_ba24 |
RS1378942 | 15 | 75077367 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.239E-6 | 0.01 | -104979 | gtex_brain_ba24 |
RS1378941 | 15 | 75080150 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.27E-6 | 0.01 | -102196 | gtex_brain_ba24 |
RS2168518 | 15 | 75081078 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.277E-6 | 0.01 | -101268 | gtex_brain_ba24 |
RS3784789 | 15 | 75082552 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.275E-6 | 0.01 | -99794 | gtex_brain_ba24 |
RS1378940 | 15 | 75083494 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.284E-6 | 0.01 | -98852 | gtex_brain_ba24 |
RS62006567 | 15 | 75086545 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.354E-6 | 0.01 | -95801 | gtex_brain_ba24 |
RS11635664 | 15 | 75088962 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.742e-7 | 0.01 | -93384 | gtex_brain_ba24 |
RS12898997 | 15 | 75090349 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.084e-7 | 0.01 | -91997 | gtex_brain_ba24 |
RS35206230 | 15 | 75097780 | MPI | ENSG00000178802.13 | 4.888e-7 | 0.01 | -84566 | gtex_brain_ba24 |
RS34862454 | 15 | 75101530 | MPI | ENSG00000178802.13 | 4.591E-7 | 0.01 | -80816 | gtex_brain_ba24 |
RS12591513 | 15 | 75102714 | MPI | ENSG00000178802.13 | 4.596E-7 | 0.01 | -79632 | gtex_brain_ba24 |
RS12594062 | 15 | 75102851 | MPI | ENSG00000178802.13 | 4.596E-7 | 0.01 | -79495 | gtex_brain_ba24 |
RS11630478 | 15 | 75102923 | MPI | ENSG00000178802.13 | 4.594E-7 | 0.01 | -79423 | gtex_brain_ba24 |
RS4886410 | 15 | 75065644 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.385e-6 | 0 | -116702 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12905199 | 15 | 75070196 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.012E-6 | 0 | -112150 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1378942 | 15 | 75077367 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.724E-6 | 0 | -104979 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1378941 | 15 | 75080150 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.619E-6 | 0 | -102196 | gtex_brain_putamen_basal |
RS8033381 | 15 | 75080685 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.004e-6 | 0 | -101661 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2168518 | 15 | 75081078 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.594E-6 | 0 | -101268 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3784790 | 15 | 75081745 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.965E-6 | 0 | -100601 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3784789 | 15 | 75082552 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.594E-6 | 0 | -99794 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1378940 | 15 | 75083494 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.616E-6 | 0 | -98852 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12442901 | 15 | 75083912 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.127E-6 | 0 | -98434 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1350193 | 15 | 75084281 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.017E-6 | 0 | -98065 | gtex_brain_putamen_basal |
RS62006565 | 15 | 75086504 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.798E-6 | 0 | -95842 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11635664 | 15 | 75088962 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.988E-6 | 0 | -93384 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12898997 | 15 | 75090349 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.465e-6 | 0 | -91997 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2301249 | 15 | 75092384 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.473E-7 | 0 | -89962 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7085 | 15 | 75095483 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.061E-7 | 0 | -86863 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1378938 | 15 | 75096443 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.473E-7 | 0 | -85903 | gtex_brain_putamen_basal |
RS35206230 | 15 | 75097780 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.718E-6 | 0 | -84566 | gtex_brain_putamen_basal |
RS34862454 | 15 | 75101530 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.424e-6 | 0 | -80816 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12591513 | 15 | 75102714 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.905E-6 | 0 | -79632 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12594062 | 15 | 75102851 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.419E-6 | 0 | -79495 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11630478 | 15 | 75102923 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.418e-6 | 0 | -79423 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4886619 | 15 | 75106138 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.062e-7 | 0 | -76208 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12441505 | 15 | 75107311 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.478e-7 | 0 | -75035 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7176022 | 15 | 75107880 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.346E-7 | 0 | -74466 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11636952 | 15 | 75114322 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.237E-6 | 0 | -68024 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11072509 | 15 | 75114374 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.473E-7 | 0 | -67972 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7180484 | 15 | 75115416 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.473E-7 | 0 | -66930 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7162232 | 15 | 75115895 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.061E-7 | 0 | -66451 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11634474 | 15 | 75116184 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.451E-7 | 0 | -66162 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3935077 | 15 | 75120211 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.841E-7 | 0 | -62135 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9210 | 15 | 75128501 | MPI | ENSG00000178802.13 | 4.443E-8 | 0 | -53845 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2290573 | 15 | 75129594 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.262E-6 | 0 | -52752 | gtex_brain_putamen_basal |
RS398078309 | 15 | 75130015 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.293E-6 | 0 | -52331 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4886615 | 15 | 75131661 | MPI | ENSG00000178802.13 | 4.443E-8 | 0 | -50685 | gtex_brain_putamen_basal |
RS936228 | 15 | 75132164 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.697E-7 | 0 | -50182 | gtex_brain_putamen_basal |
RS936229 | 15 | 75132319 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.697E-7 | 0 | -50027 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2290574 | 15 | 75135447 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.099E-7 | 0 | -46899 | gtex_brain_putamen_basal |
RS201476892 | 15 | 75136256 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.792E-6 | 0 | -46090 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6939 | 15 | 75136257 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.361E-8 | 0 | -46089 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6938 | 15 | 75136261 | MPI | ENSG00000178802.13 | 9.567E-7 | 0 | -46085 | gtex_brain_putamen_basal |
RS199548397 | 15 | 75138800 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.561E-7 | 0 | -43546 | gtex_brain_putamen_basal |
RS573746810 | 15 | 75138801 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.424e-7 | 0 | -43545 | gtex_brain_putamen_basal |
RS201449809 | 15 | 75138802 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.62E-7 | 0 | -43544 | gtex_brain_putamen_basal |
RS61367954 | 15 | 75138803 | MPI | ENSG00000178802.13 | 6.433e-8 | 0 | -43543 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12902690 | 15 | 75139696 | MPI | ENSG00000178802.13 | 9.445e-8 | 0 | -42650 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3765066 | 15 | 75140854 | MPI | ENSG00000178802.13 | 4.455e-8 | 0 | -41492 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4886613 | 15 | 75142040 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.024E-7 | 0 | -40306 | gtex_brain_putamen_basal |
RS936230 | 15 | 75145098 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.645E-8 | 0 | -37248 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1869959 | 15 | 75147332 | MPI | ENSG00000178802.13 | 6.884e-7 | 0 | -35014 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7180432 | 15 | 75148773 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.115E-7 | 0 | -33573 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12906946 | 15 | 75153140 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.174E-8 | 0 | -29206 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6495124 | 15 | 75154779 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.072E-8 | 0 | -27567 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12900662 | 15 | 75155662 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.838E-6 | 0 | -26684 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11630918 | 15 | 75155896 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.398E-6 | 0 | -26450 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4643278 | 15 | 75157582 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.026E-6 | 0 | -24764 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12911254 | 15 | 75166335 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.401E-6 | 0 | -16011 | gtex_brain_putamen_basal |
RS71411084 | 15 | 75167036 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.749E-7 | 0 | -15310 | gtex_brain_putamen_basal |
RS398078310 | 15 | 75170391 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.869e-8 | 0 | -11955 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4886632 | 15 | 75173925 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.735E-6 | 0 | -8421 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6495126 | 15 | 75175026 | MPI | ENSG00000178802.13 | 4.597E-8 | 0 | -7320 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7497393 | 15 | 75175457 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.4e-6 | 0 | -6889 | gtex_brain_putamen_basal |
RS71140107 | 15 | 75176097 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.826E-7 | 0 | -6249 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4886633 | 15 | 75178207 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.939E-8 | 0 | -4139 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9673065 | 15 | 75180892 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.361E-6 | 0 | -1454 | gtex_brain_putamen_basal |
RS8031937 | 15 | 75181121 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.939E-8 | 0 | -1225 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11638130 | 15 | 75183935 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.398E-6 | 0 | 1589年 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11633472 | 15 | 75184084 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.398E-6 | 0 | 1738年 | gtex_brain_putamen_basal |
RS71140108 | 15 | 75186448 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.822e-8 | 0 | 4102 | gtex_brain_putamen_basal |
RS67411922 | 15 | 75187612 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.686E-8 | 0 | 5266 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7497201 | 15 | 75190690 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.939E-8 | 0 | 8344 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1127796 | 15 | 75193004 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.733E-6 | 0 | 10658 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6495127 | 15 | 75194490 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.939E-8 | 0 | 12144 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11856413 | 15 | 75199892 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.398E-6 | 0 | 17546 | gtex_brain_putamen_basal |
RS68011760 | 15 | 75201601 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.736E-6 | 0 | 19255 | gtex_brain_putamen_basal |
RS57016684 | 15 | 75202205 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.393E-6 | 0 | 19859 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11072512 | 15 | 75204026 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.733E-6 | 0 | 21680 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12911781 | 15 | 75205405 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.979E-7 | 0 | 23059 | gtex_brain_putamen_basal |
RS200591247 | 15 | 75206224 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.816E-7 | 0 | 23878 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7495033 | 15 | 75206225 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.313E-7 | 0 | 23879 | gtex_brain_putamen_basal |
RS61454186 | 15 | 75206681 | MPI | ENSG00000178802.13 | 6.099E-7 | 0 | 24335 | gtex_brain_putamen_basal |
RS369179526 | 15 | 75206686 | MPI | ENSG00000178802.13 | 6.214E-7 | 0 | 24340 | gtex_brain_putamen_basal |
RS201118332 | 15 | 75206687 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.85e-7 | 0 | 24341 | gtex_brain_putamen_basal |
RS71140112 | 15 | 75206688 | MPI | ENSG00000178802.13 | 4.989E-7 | 0 | 24342 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7495664 | 15 | 75206970 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.398E-6 | 0 | 24624 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12907898 | 15 | 75207872 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.733E-6 | 0 | 25526 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12908365 | 15 | 75208146 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.99E-6 | 0 | 25800 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12914369 | 15 | 75209432 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.549E-7 | 0 | 27086 | gtex_brain_putamen_basal |
RS397690408 | 15 | 75211142 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.064e-8 | 0 | 28796 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1133323 | 15 | 75212225 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.398E-6 | 0 | 29879 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1133322 | 15 | 75212357 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.733E-6 | 0 | 30011 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12909335 | 15 | 75214789 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.396E-6 | 0 | 32443 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11072513 | 15 | 75220968 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.955E-6 | 0 | 38622 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11854704 | 15 | 75221015 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.063E-6 | 0 | 38669 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12912839 | 15 | 75221245 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.53E-6 | 0 | 38899 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11072514 | 15 | 75221865 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.39E-6 | 0 | 39519 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7174968 | 15 | 75222415 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.484e-8 | 0 | 40069 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12903370 | 15 | 75222752 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.389E-6 | 0 | 40406 | gtex_brain_putamen_basal |
RS8042694 | 15 | 75225415 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.654e-8 | 0 | 43069 | gtex_brain_putamen_basal |
RS142190767 | 15 | 75225749 | MPI | ENSG00000178802.13 | 4.062E-7 | 0 | 43403 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2044157 | 15 | 75225808 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.343E-6 | 0 | 43462 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4886639 | 15 | 75227949 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.62E-6 | 0 | 45603 | gtex_brain_putamen_basal |
RS62029167 | 15 | 75228350 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.714E-6 | 0 | 46004 | gtex_brain_putamen_basal |
RS59945415 | 15 | 75228427 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.712E-6 | 0 | 46081 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12898539 | 15 | 75229093 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.45e-6 | 0 | 46747 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12899430 | 15 | 75229100 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.091E-6 | 0 | 46754 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6495131 | 15 | 75230502 | MPI | ENSG00000178802.13 | 5.519E-7 | 0 | 48156 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12899787 | 15 | 75231309 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.688E-6 | 0 | 48963 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12901190 | 15 | 75231452 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.386E-6 | 0 | 49106 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11072517 | 15 | 75234256 | MPI | ENSG00000178802.13 | 6.582E-9 | 0 | 51910 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11072518 | 15 | 75234610 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.628E-8 | 0 | 52264 | gtex_brain_putamen_basal |
RS66529641 | 15 | 75236327 | MPI | ENSG00000178802.13 | 2.248e-6 | 0 | 53981 | gtex_brain_putamen_basal |
RS8025890 | 15 | 75237885 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.112E-8 | 0 | 55539 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7169261 | 15 | 75238663 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.215E-6 | 0 | 56317 | gtex_brain_putamen_basal |
RS200520096 | 15 | 75242039 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.493E-7 | 0 | 59693 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2415249 | 15 | 75242040 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.393E-6 | 0 | 59694 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2415251 | 15 | 75242155 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.398E-6 | 0 | 59809 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11639413 | 15 | 75243294 | MPI | ENSG00000178802.13 | 1.297E-6 | 0 | 60948 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11630592 | 15 | 75243826 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.83e-7 | 0 | 61480 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12912343 | 15 | 75251041 | MPI | ENSG00000178802.13 | 3.372E-6 | 0 | 68695 | gtex_brain_putamen_basal |
RS111829223 | 15 | 75261027 | MPI | ENSG00000178802.13 | 9.888e-7 | 0 | 78681 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MPI_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg果糖和甘露糖代谢 | 34 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG氨基糖和核苷酸糖代谢 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta喂食器途径 | 9 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
n糖生物合成中底物的反应组合成 | 14 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome天冬酰胺N连接的糖基化 | 81 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
N Glycan前体Dolichol脂质的寡糖LLO的Reactome生物合成并转移到新生蛋白 | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo卡路里限制肌肉DN | 87 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo衰老肌肉DN | 123 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 UP | 49 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠与直肠癌DN | 56 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冬季缺氧metagene | 242 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner ES ICP与H3K4Me3 | 34 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MEISSNER NPC ICP带有H3K4ME3 | 20 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain ICP带有H3K4ME3 | 32 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |