基因页面:ASMT
总结吗?
GeneID | 438年 |
象征 | ASMT |
同义词 | ASMTY | HIOMT | HIOMTY |
描述 | acetylserotonin O-methyltransferase |
参考 | MIM: 300015|MIM: 402500|HGNC: HGNC: 750|运用:ENSG00000196433|HPRD: 02058|织女:OTTHUMG00000021065 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | Xp22.3或Yp11.3 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs6688662 | chr1 | 76842132 | ASMT | 438年 | 0.19 | 反式 | ||
rs512189 | chr1 | 182632586 | ASMT | 438年 | 0.15 | 反式 | ||
rs6666913 | chr1 | 237092144 | ASMT | 438年 | 0 | 反式 | ||
rs16865228 | chr2 | 6629622 | ASMT | 438年 | 0.1 | 反式 | ||
rs16865230 | chr2 | 6630187 | ASMT | 438年 | 0.1 | 反式 | ||
rs11691188 | chr2 | 6631799 | ASMT | 438年 | 0.1 | 反式 | ||
rs10209546 | chr2 | 53408320 | ASMT | 438年 | 0.04 | 反式 | ||
rs13403353 | chr2 | 144067716 | ASMT | 438年 | 0 | 反式 | ||
rs10195263 | chr2 | 151725791 | ASMT | 438年 | 0.01 | 反式 | ||
rs13413644 | chr2 | 189475948 | ASMT | 438年 | 0.19 | 反式 | ||
rs9855575 | chr3 | 15514062 | ASMT | 438年 | 0.14 | 反式 | ||
rs6548978 | chr3 | 68139529 | ASMT | 438年 | 0.09 | 反式 | ||
rs17011179 | chr3 | 73501887 | ASMT | 438年 | 0.18 | 反式 | ||
rs7609917 | chr3 | 76094301 | ASMT | 438年 | 8.87 e-5 | 反式 | ||
rs2324466 | chr3 | 76100753 | ASMT | 438年 | 8.242 e - | 反式 | ||
rs17013713 | chr3 | 76105150 | ASMT | 438年 | 4.063 e-6 | 反式 | ||
rs17013722 | chr3 | 76107656 | ASMT | 438年 | 8.242 e - | 反式 | ||
rs17013724 | chr3 | 76107684 | ASMT | 438年 | 8.242 e - | 反式 | ||
rs16831155 | chr3 | 173574763 | ASMT | 438年 | 0.1 | 反式 | ||
rs11734196 | chr4 | 102796071 | ASMT | 438年 | 0.04 | 反式 | ||
rs10212684 | chr4 | 102822506 | ASMT | 438年 | 0.01 | 反式 | ||
rs9986296 | chr5 | 3199318 | ASMT | 438年 | 0.02 | 反式 | ||
rs2895773 | chr5 | 148114635 | ASMT | 438年 | 0 | 反式 | ||
rs10059267 | chr5 | 168676624 | ASMT | 438年 | 0.17 | 反式 | ||
rs10078402 | chr5 | 168678851 | ASMT | 438年 | 0.17 | 反式 | ||
rs2281351 | chr6 | 187343年 | ASMT | 438年 | 0.12 | 反式 | ||
rs7740062 | chr6 | 27705597 | ASMT | 438年 | 0.15 | 反式 | ||
rs200470 | chr6 | 27762186 | ASMT | 438年 | 0.08 | 反式 | ||
rs201005 | chr6 | 27804159 | ASMT | 438年 | 0.13 | 反式 | ||
rs200955 | chr6 | 27839311 | ASMT | 438年 | 0.15 | 反式 | ||
rs200959 | chr6 | 27842046 | ASMT | 438年 | 0.15 | 反式 | ||
rs839777 | chr6 | 27909656 | ASMT | 438年 | 0.1 | 反式 | ||
rs149898 | chr6 | 27958071 | ASMT | 438年 | 0.1 | 反式 | ||
rs156742 | chr6 | 27963191 | ASMT | 438年 | 0.1 | 反式 | ||
rs175955 | chr6 | 28059733 | ASMT | 438年 | 0.1 | 反式 | ||
rs1225593 | chr6 | 28150518 | ASMT | 438年 | 0.1 | 反式 | ||
rs195749 | chr6 | 37253745 | ASMT | 438年 | 0.07 | 反式 | ||
rs16896683 | chr6 | 43687846 | ASMT | 438年 | 0.07 | 反式 | ||
rs16875134 | chr6 | 85489519 | ASMT | 438年 | 0.05 | 反式 | ||
rs16875178 | chr6 | 85516099 | ASMT | 438年 | 0.08 | 反式 | ||
rs7808764 | chr7 | 10297264 | ASMT | 438年 | 0.11 | 反式 | ||
rs17145334 | chr7 | 21808409 | ASMT | 438年 | 0.18 | 反式 | ||
rs992435 | chr7 | 97050802 | ASMT | 438年 | 0.08 | 反式 | ||
rs8190856 | chr8 | 18079123 | ASMT | 438年 | 0.1 | 反式 | ||
rs16920368 | chr8 | 55392852 | ASMT | 438年 | 0.08 | 反式 | ||
rs16927318 | chr8 | 62365911 | ASMT | 438年 | 0.01 | 反式 | ||
rs348150 | chr8 | 73371619 | ASMT | 438年 | 0.04 | 反式 | ||
rs16938220 | chr8 | 73377940 | ASMT | 438年 | 0.03 | 反式 | ||
rs4545144 | chr8 | 139689307 | ASMT | 438年 | 0.16 | 反式 | ||
rs10815658 | chr9 | 7709422 | ASMT | 438年 | 0.02 | 反式 | ||
rs17775722 | chr9 | 26199256 | ASMT | 438年 | 0.13 | 反式 | ||
rs180038 | chr9 | 101514415 | ASMT | 438年 | 0.01 | 反式 | ||
rs4742740 | chr9 | 101524552 | ASMT | 438年 | 0.01 | 反式 | ||
rs4743277 | chr9 | 101557528 | ASMT | 438年 | 0.02 | 反式 | ||
rs11190152 | chr10 | 101325914 | ASMT | 438年 | 0.17 | 反式 | ||
rs2069410 | chr12 | 56364644 | ASMT | 438年 | 1.604的军医 | 反式 | ||
rs7979024 | chr12 | 84506011 | ASMT | 438年 | 0.06 | 反式 | ||
rs11105124 | chr12 | 89375908 | ASMT | 438年 | 0.05 | 反式 | ||
rs17834315 | chr13 | 37991091 | ASMT | 438年 | 0 | 反式 | ||
rs9542625 | chr13 | 71811344 | ASMT | 438年 | 0.13 | 反式 | ||
rs17091014 | chr14 | 56562713 | ASMT | 438年 | 0.07 | 反式 | ||
rs1743505 | chr14 | 96143407 | ASMT | 438年 | 0.16 | 反式 | ||
rs17142983 | chr16 | 7294508 | ASMT | 438年 | 0.11 | 反式 | ||
rs6499075 | chr16 | 66387395 | ASMT | 438年 | 0.13 | 反式 | ||
rs8051077 | chr16 | 75036432 | ASMT | 438年 | 0.18 | 反式 | ||
rs17798004 | chr18 | 70665382 | ASMT | 438年 | 0.11 | 反式 | ||
rs17736134 | chr18 | 70665805 | ASMT | 438年 | 0.09 | 反式 | ||
rs2469060 | chr18 | 70673106 | ASMT | 438年 | 0.09 | 反式 | ||
rs2469009 | chr18 | 70713334 | ASMT | 438年 | 0.16 | 反式 | ||
rs6514759 | 0 | ASMT | 438年 | 0.01 | 反式 | |||
rs409642 | chr20 | 54250273 | ASMT | 438年 | 0.02 | 反式 | ||
rs7290732 | chr22 | 46691902 | ASMT | 438年 | 0.16 | 反式 | ||
rs5920627 | chrX | 97385064 | ASMT | 438年 | 0.03 | 反式 | ||
snp_a - 2027825 | 0 | ASMT | 438年 | 0.02 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ASMT_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005184 | 神经肽激素活动 | 国际能源机构 | 轴突,Synap、脑、神经递质(术语层面:6) | - - - - - - |
去:0017096 | acetylserotonin O-methyltransferase活动 | 国际能源机构 | 5 -羟色胺(术语层面:7) | - - - - - - |
去:0016740 | 转移酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006412 | 翻译 | 助教 | 8397829 | |
去:0030187 | 褪黑激素生物合成的过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0048511 | 有节奏的过程 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
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KEGG色氨酸代谢 | 40 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
挞挞VS PLASMABLAST浆细胞 | 398年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TAVAZOIE转移 | 108年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |