基因页面:DDX12P
总结吗?
| GeneID | 440081年 |
| 象征 | DDX12P |
| 同义词 | CHLR2 | DDX12 |
| 描述 | 死/氢箱解旋酶12,假基因 |
| 参考 | MIM: 601151|HGNC: HGNC: 2737| |
| 基因型 | 伪 |
| 地图上的位置 | 12 p13.31 |
| 帕斯卡假定值 | 0.745 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马体 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 3 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg16514059 | 12 | 9600888 | DDX12P | 5.02平台以及 | -0.008 | 8.59 e - | DMG: Jaffe_2016 |
| cg07721440 | 12 | 9601161 | DDX12P | 3.8 e-9 | -0.02 | 2.4 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
| cg07909497 | 12 | 9600950 | DDX12P | 9.69 e-9 | -0.016 | 4.28 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs6487735 | 12 | 9431402 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 2.24 e-8 | 0 | 169423年 | gtex_brain_ba24 |
| rs5796344 | 12 | 9431770 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 7.09 e-9 | 0 | 169055年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10771463 | 12 | 9432789 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 5.315 e - | 0 | 168036年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10771464 | 12 | 9432850 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.488 e - | 0 | 167975年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10743632 | 12 | 9432903 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.065 e - | 0 | 167922年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10743633 | 12 | 9432952 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.065 e - | 0 | 167873年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10743634 | 12 | 9432988 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.488 e - | 0 | 167837年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2113900 | 12 | 9433426 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 2.872 e-9 | 0 | 167399年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2113899 | 12 | 9433483 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 2.291 e-9 | 0 | 167342年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1549430 | 12 | 9433605 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.627 e-9 | 0 | 167220年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4514480 | 12 | 9433983 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.6 e-9 | 0 | 166842年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10743636 | 12 | 9434060 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 2.815 e-9 | 0 | 166765年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7300172 | 12 | 9434423 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.597 e-9 | 0 | 166402年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7300369 | 12 | 9434538 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 2.24 e-8 | 0 | 166287年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7135251 | 12 | 9434815 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.48 e-9 | 0 | 166010年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1549429 | 12 | 9434842 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.429 e-9 | 0 | 165983年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1549428 | 12 | 9434852 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.429 e-9 | 0 | 165973年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1549427 | 12 | 9434940 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.053 e-9 | 0 | 165885年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1549426 | 12 | 9435244 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.053 e-9 | 0 | 165581年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6487747 | 12 | 9435574 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.053 e-9 | 0 | 165251年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7960104 | 12 | 9435639 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.838 e-9 | 0 | 165186年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6487748 | 12 | 9435768 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.073 e-9 | 0 | 165057年 | gtex_brain_ba24 |
| rs61916194 | 12 | 9436083 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.603 e-8 | 0 | 164742年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7960183 | 12 | 9463357 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.644 e-6 | 0 | 137468年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12366847 | 12 | 9463968 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.378 e-6 | 0 | 136857年 | gtex_brain_ba24 |
| rs3825322 | 12 | 9465134 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.864 e-6 | 0 | 135691年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10771524 | 12 | 9472329 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.031 e-6 | 0 | 128496年 | gtex_brain_ba24 |
| rs71656520 | 12 | 9483965 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.684 e-6 | 0 | 116860年 | gtex_brain_ba24 |
| rs199636850 | 12 | 9485105 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 5.599 e - | 0 | 115720年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7958717 | 12 | 9485106 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.698 e - | 0 | 115719年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7974095 | 12 | 9485107 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.702 e - | 0 | 115718年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7959473 | 12 | 9485725 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.067 e-6 | 0 | 115100年 | gtex_brain_ba24 |
| rs11049781 | 12 | 9399888 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.165 e-6 | 0 | 200937年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12369816 | 12 | 9407282 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.165 e-6 | 0 | 193543年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs200038078 | 12 | 9411698 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 4.537 e - | 0 | 189127年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11049845 | 12 | 9413442 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.21 e-6 | 0 | 187383年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11049846 | 12 | 9413607 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.21 e-6 | 0 | 187218年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10843253 | 12 | 9415915 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 9.734 e - | 0 | 184910年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6487734 | 12 | 9427520 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 8.62 e - | 0 | 173305年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6487735 | 12 | 9431402 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 2.251 e-8 | 0 | 169423年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs5796344 | 12 | 9431770 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 2.16 e-9 | 0 | 169055年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10771463 | 12 | 9432789 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 5.612 e - | 0 | 168036年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10771464 | 12 | 9432850 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 5.586 e - | 0 | 167975年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10743632 | 12 | 9432903 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.681 e-6 | 0 | 167922年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10743633 | 12 | 9432952 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.672 e-6 | 0 | 167873年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10743634 | 12 | 9432988 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 2.396 e - | 0 | 167837年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2113900 | 12 | 9433426 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.117 e-8 | 0 | 167399年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2113899 | 12 | 9433483 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 5.628 e-8 | 0 | 167342年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1549430 | 12 | 9433605 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 4.858 e-8 | 0 | 167220年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4514480 | 12 | 9433983 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 4.837 e-8 | 0 | 166842年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10743636 | 12 | 9434060 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 4.569 e-9 | 0 | 166765年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7300172 | 12 | 9434423 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 4.83 e-8 | 0 | 166402年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7300369 | 12 | 9434538 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 2.251 e-8 | 0 | 166287年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7135251 | 12 | 9434815 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 4.375 e-8 | 0 | 166010年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1549429 | 12 | 9434842 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 4.287 e-8 | 0 | 165983年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1549428 | 12 | 9434852 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 4.287 e-8 | 0 | 165973年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1549427 | 12 | 9434940 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 3.67 e-8 | 0 | 165885年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1549426 | 12 | 9435244 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 3.67 e-8 | 0 | 165581年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6487747 | 12 | 9435574 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 3.67 e-8 | 0 | 165251年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7960104 | 12 | 9435639 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 7.956 e-9 | 0 | 165186年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6487748 | 12 | 9435768 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 3.686 e-8 | 0 | 165057年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs61916194 | 12 | 9436083 | DDX12P | ENSG00000214826.4 | 1.859 e - | 0 | 164742年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME糖尿病的途径 | 133年 | 91年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME XBP1S伴侣蛋白基因的激活 | 46 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME展开蛋白质反应 | 80年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 帕蒂尔肝癌 | 747年 | 453年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WHITFIELD细胞周期G1 | 147年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |