基因页:MSN
概括?
基因 | 4478 |
象征 | MSN |
同义词 | HEL70 |
描述 | Moesin |
参考 | MIM:309845|HGNC:HGNC:7373|ENSEMBL:ENSG00000147065|HPRD:02399|Vega:Otthumg0000000021723 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XQ11.1 |
Sherlock P值 | 0.86 |
支持 | COMPOSITESET 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:3 | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.004 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MSN_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
增强 | 0.92 | 0.89 |
SCRG1 | 0.91 | 0.93 |
mt1e | 0.90 | 0.97 |
MT1G | 0.89 | 0.89 |
S100A13 | 0.88 | 0.92 |
C2ORF82 | 0.88 | 0.88 |
AC044839.2 | 0.87 | 0.91 |
PSMB8 | 0.87 | 0.90 |
TMEM219 | 0.86 | 0.79 |
CBR3 | 0.86 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MCM3AP | -0.72 | -0.84 |
PDXDC1 | -0.72 | -0.84 |
USP7 | -0.71 | -0.80 |
CKAP5 | -0.71 | -0.85 |
heatr5b | -0.71 | -0.85 |
gigyf2 | -0.71 | -0.81 |
RBM26 | -0.71 | -0.85 |
ABCF1 | -0.71 | -0.76 |
rnasen | -0.71 | -0.88 |
Ankrd17 | -0.71 | -0.81 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005102 | 受体结合 | IPI | 神经递质(GO期限:4) | 15819698 |
去:0005200 | 细胞骨架的结构成分 | 塔斯 | 1924289 | |
去:0008092 | 细胞骨架蛋白结合 | IEA | - | |
GO:0050839 | 细胞粘附分子结合 | IPI | 12082081 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0022614 | 膜到膜对接 | IEP | 12082081 | |
去:0006928 | 细胞运动 | 塔斯 | 16130169 | |
去:0007159 | 白细胞粘附 | IEP | 12082081 | |
去:0050900 | 白细胞迁移 | IEP | 12082081 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0030175 | 丝状 | 艾达 | 轴突(GO术语级别:5) | 12082081 |
去:0001931 | uropod | IEA | 突触(GO期限:5) | - |
去:0005856 | 细胞骨架 | 塔斯 | 16130169 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005902 | 微绒毛 | 艾达 | 12082081 | |
去:0005886 | 质膜 | 塔斯 | 1924289|8188263 | |
GO:0016323 | 基底外侧质膜 | IEA | - | |
GO:0016324 | 顶质膜 | IEA | - | |
GO:0019898 | 外膜到膜 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
Arhgdia | GDIA1 |MGC117248 |Rhogdi |Rhogdi-1 | RHO GDP解离抑制剂(GDI)alpha | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
出价 | FP497 |MGC15319 |MGC42355 | BH3互动域死亡激动剂 | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
CASP10 | Alps2 |flice2 |MCH4 | caspase 10,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
CASP8 | ALPS2B |cap4 |弗里斯|FLJ17672 |马赫|MCH5 |MGC78473 | caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
CD46 | MCP |MGC26544 |MIC10 |TLX |Tra2.10 | CD46分子,补体调节蛋白 | - | HPRD | 7884872 | 12082081 |
CD46 | MCP |MGC26544 |MIC10 |TLX |Tra2.10 | CD46分子,补体调节蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 7884872 |
CD93 | C1QR1 |C1QR(P)|C1QRP |CDW93 |mxra4 |DJ737E23.1 | CD93分子 | Moesin与CD93相互作用。 | 绑定 | 15819698 |
EZR | cvil |CVL |DKFZP762H157 |FLJ26216 |MGC1584 |vil2 | 埃兹林 | - | HPRD,Biogrid | 7579708|8248180 |
fadd | Gig3 |MGC8528 |Mort1 | FAS(TNFRSF6)通过死亡域关联 | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
fas | Alps1a |apo-1 |apt1 |CD95 |fas1 |FastM |TNFRSF6 | FAS(TNF受体超家族,成员6) | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
faslg | APT1LG1 |CD178 |CD95L |fasl |TNFSF6 | FAS配体(TNF超家族,成员6) | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
HLA-B | AS |HLA-B-7301 |HLA-B73 |hlab |HLAC |SPDA1 | 主要的组织相容性复合物,I类,B | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
ICAM1 | BB2 |CD54 |P3.58 | 细胞间粘附分子1 | - | HPRD | 12082081 |
ICAM2 | CD102 | 细胞间粘附分子2 | - | HPRD,Biogrid | 9472040 |
ICAM3 | CD50 |CDW50 |ICAM-R | 细胞间粘附分子3 | - | HPRD,Biogrid | 11784723 |
L1CAM | CAML1 |CD171 |HSAS |HSAS1 |Masa |麦克风5 |n-caml1 |S10 |SPG1 | L1细胞粘附分子 | - | HPRD | 12070130 |
MAPK8 | jnk |JNK1 |JNK1A2 |JNK21B1/2 |prkm8 |SAPK1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶8 | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
MSN | - | Moesin | - | HPRD,Biogrid | 10847681 |
NCF1 | FLJ79451 |NCF1A |noxo2 |SH3PXD1A |p47phox | 中性粒细胞胞质因子1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 11716484 |
NCF4 | MGC3810 |NCF |p40phox |SH3PXD4 | 中性粒细胞胞质因子4,40KDA | - | HPRD,Biogrid | 11716484 |
PLEC1 | EBS1 |EBSO |HD1 |PCN |PLEC1B |PLTN | PLECTIN 1,中间丝结合蛋白500KDA | - | HPRD,Biogrid | 11441066 |
Rhoa | ARH12 |arha |Rho12 |RHOH12 | RAS同源基因家族,成员 | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
卖 | CD62L |Lam-1 |LAM1 |lecam1 |lnhr |LSEL |lyam1 |Leu-8 |lyam-1 |plnhr | TQ1 | hLHRc | selectin l | 重构的复合物 | Biogrid | 11706008 |
selplg | CD162 |CLA |PSGL-1 |PSGL1 | Selectin P配体 | - | HPRD,Biogrid | 12115638 |
SLC9A3R1 | EBP50 |nherf |nherf1 |nphlop2 | 溶质载体家族9(钠/氢交换器),成员3调节器1 | Moesin与HNHE-RF相互作用。 | 绑定 | 9430655 |
SLC9A3R1 | EBP50 |nherf |nherf1 |nphlop2 | 溶质载体家族9(钠/氢交换器),成员3调节器1 | - | HPRD,Biogrid | 9430655 |
SPN | CD43 |GPL115 |LSN | 唾液磷脂 | - | HPRD,Biogrid | 9616160 |
Syk | dkfzp313n1010 |FLJ25043 |FLJ37489 | 脾酪氨酸激酶 | Syk与Moesin相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的Syk和Moesin之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 12387735 |
TNFRSF10B | CD262 |DR5 |杀手|杀手/DR5 |trail-r2 |TRAILR2 |技巧2 |Trick2a |trick2b |技巧| ZTNFR9 | 肿瘤坏死因子受体超家族,成员10b | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
tnfrsf1a | CD120A |FPF |MGC19588 |TBP1 |TNF-R |tnf-r-i |TNF-R55 |tnfar |TNFR1 |TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 | 肿瘤坏死因子受体超家族,成员1a | 共纯化 | Biogrid | 15659383 |
TSC1 | KIAA0243 |林|MGC86987 |TSC | 结节硬化症1 | - | HPRD,Biogrid | 12226091 |
TSC1 | KIAA0243 |林|MGC86987 |TSC | 结节硬化症1 | Hamartin与Moesin相互作用。这种相互作用是建立在鼠标鼠和人类Moesin之间证明的相互作用的基础上建模的。 | 绑定 | 10806479 |
VCAM1 | CD106 |DKFZP779G2333 |Incam-100 |MGC99561 | 血管细胞粘附分子1 | - | HPRD,Biogrid | 12082081 |
VCAM1 | CD106 |DKFZP779G2333 |Incam-100 |MGC99561 | 血管细胞粘附分子1 | - | HPRD | 7884872 | 12082081 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg白细胞跨内皮迁移 | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid rhoa途径 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ER非原始组途径 | 41 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome L1CAM相互作用 | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
L1的Reactome回收途径 | 27 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lang MyB家庭目标 | 29 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林格伦膀胱癌高复发 | 49 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
留置权乳腺癌化生型与导管 | 83 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WU细胞迁移 | 184 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
takao对UVB辐射的响应 | 86 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成8 | 86 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 | 163 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 | 132 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggins他莫昔芬抗性 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄达沙替尼的抵抗 | 81 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nutt GBM与AO胶质瘤 | 46 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 DN | 240 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dang myc针对DN | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karlsson TGFB1靶向 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Demagalhaes老化 | 55 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja Islet HNF1A靶向 | 163 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-122 | 48 | 54 | M8 | HSA-MIR-122A | uggagugugacaaugguuuugu |
mir-133 | 140 | 147 | 1A,M8 | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
mir-192/215 | 1601 | 1607年 | M8 | HSA-MIR-192 | cugaccuaugaauugacagcc |
HSA-MIR-215 | Augaccuaugaauugacagac | ||||
MiR-200BC/429 | 1574年 | 1581 | 1A,M8 | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
mir-217 | 1703 | 1709年 | M8 | HSA-MIR-217 | uacugcaucagaacugauuggau |
mir-27 | 1794年 | 1800 | 1a | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
mir-491 | 43 | 50 | 1A,M8 | HSA-MIR-491脑 | aguggggaacccuuccaugga |
mir-96 | 2012 | 2018 | M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |
HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |