基因页:MSR1
概括?
基因 | 4481 |
象征 | MSR1 |
同义词 | CD204 | SCARA1 | SR-A | SRA | PHSR1 | PHSR2 |
描述 | 巨噬细胞清道夫受体1 |
参考 | MIM:153622|HGNC:HGNC:7376|Ensembl:ENSG0000000038945|HPRD:01092|Vega:Otthumg0000000094809 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8p22 |
Pascal P值 | 1.737E-5 |
主持人 | 皮质 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.00057 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.03086 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MSR1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
意大利面9 | 0.84 | 0.85 |
RPA1 | 0.82 | 0.79 |
ARHGAP19 | 0.82 | 0.79 |
ctnnd1 | 0.81 | 0.78 |
SP1 | 0.81 | 0.80 |
RCC2 | 0.80 | 0.77 |
CRKL | 0.80 | 0.81 |
DUSP16 | 0.80 | 0.81 |
PHF8 | 0.80 | 0.80 |
KIAA1958 | 0.80 | 0.83 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.54 | -0.61 |
ifi27 | -0.54 | -0.59 |
CXCL14 | -0.52 | -0.58 |
AF347015.31 | -0.52 | -0.56 |
MT-CO2 | -0.52 | -0.57 |
myl3 | -0.49 | -0.54 |
FXYD1 | -0.49 | -0.53 |
higd1b | -0.49 | -0.53 |
IL32 | -0.48 | -0.55 |
AF347015.8 | -0.48 | -0.53 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0005044 | 清道夫受体活性 | IEA | - | |
去:0005044 | 清道夫受体活性 | 塔斯 | 2251254 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17237231 | |
去:0005319 | 脂质转运蛋白活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0042953 | 脂蛋白运输 | IEA | - | |
去:0006898 | 受体介导的内吞作用 | IEA | - | |
去:0006898 | 受体介导的内吞作用 | 塔斯 | 2251254 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 8093617 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gal白血病干细胞向上 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌先进与早期 | 175 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1目标8小时DN | 129 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1慢性LOF DN | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍林青春期乳腺 | 69 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
liang造血细胞数量大与微小 | 44 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nemeth炎症反应LPS | 88 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 | 77 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
appel imatinib响应 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lian Lipa目标6m | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin Mgmt 24小时DN的响应 | 33 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lian Lipa目标3M | 59 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙齿龋齿DN | 245 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 | 222 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 | 161 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙科龋齿 | 253 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞 | 156 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
coates巨噬细胞M1 vs M2向上 | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Worschech肿瘤排斥 | 56 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sharma毛囊星形胶质细胞瘤位置 | 25 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP | 107 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ichiba移植与宿主疾病35D UP | 131 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
croonquist nras发出信号 | 41 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 | 216 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |