基因页：MSX2
概括？
| 基因 | 4488 |
| 象征 | MSX2 |
| 同义词 | CRS2 | FPP | HOX8 | MSH | PFM | PFM1 |
| 描述 | MSH HONEOBOX 2 |
| 参考 | MIM：123101|HGNC：HGNC：7392|ENSEMBL：ENSG00000120149|HPRD：00421|Vega：Otthumg00000130556 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q35.2 |
| Pascal P值 | 0.071 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.0276 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10994209 | Chr10 | 61877705 | MSX2 | 4488 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003700 | 转录因子活性 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 12145306 | |
| GO：0043565 | 序列特异性DNA结合 | 艾达 | 9073066 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001501 | 骨骼系统开发 | 塔斯 | 8968743 | |
| 去：0003007 | 心形形态发生 | IEA | - | |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0008285 | 细胞增殖的阴性调节 | IEA | - | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| 去：0043066 | 凋亡的负调节 | IEA | - | |
| 去：0030509 | BMP信号通路 | IEA | - | |
| 去：0030326 | 胚胎肢体发生 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 宿雾 | C/EBP-Alpha |CEBP | CCAAT/增强子结合蛋白（C/EBP），α | - | HPRD，Biogrid | 12925529 |
| DLX2 | TES-1 |TES1 | 无远端同源蛋黄2 | - | HPRD，Biogrid | 9111364 |
| DLX5 | - | 无远端同源物5 | - | HPRD，Biogrid | 9111364 |
| GTF2F1 | BTF4 |Rap74 |TF2F1 |tfiif | 通用转录因子IIF，多肽1，74KDA | - | HPRD，Biogrid | 9265625 |
| GTF2F2 | BTF4 |Rap30 |TF2F2 |tfiif | 通用转录因子IIF，多肽2，30KDA | - | HPRD，Biogrid | 9265625 |
| MAGED1 | DLXIN-1 |nrage | 黑色素瘤抗原家族D，1 | - | HPRD，Biogrid | 11084035|11959851 |
| MSX1 | HOX7 |HYD1 | MSH HONEOBOX 1 | - | HPRD，Biogrid | 9111364 |
| MSX2 | CRS2 |fpp |HOX8 |MSH |PFM |PFM1 | MSH HONEOBOX 2 | - | HPRD，Biogrid | 9111364 |
| PITX2 | arp1 |BRX1 |IDG2 |Igds |IGDS2 |ihg2 |irid2 |MGC111022 |MGC20144 |OTLX2 | PTX2 | RGS | RIEG | RIEG1 | RS | 成对的同源域2 | 表型抑制 | Biogrid | 11763998 |
| runx2 | AML3 |CBFA1 |CCD |CCD1 |MGC120022 |MGC120023 |OSF2 |pea2aa |PEBP2A1 |PEBP2A2 | PEBP2aA | PEBP2aA1 | 与Runt相关的转录因子2 | - | HPRD，Biogrid | 11683913 |
| spen | KIAA0929 |薄荷|RP1-134O19.1 |锋利的 | SPEN同源物，转录调节剂（果蝇） | - | HPRD | 10451362 |
| ZBTB17 | Miz-1 |Znf151 |Znf60 |PHZ-67 | 锌指和包含17的BTB结构域 | - | HPRD | 9256341 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Puiffe入侵被腹水DN抑制 | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌6小时DN | 167 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| sabates结直肠腺瘤 | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rodrigues NTN1和DCC目标 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌簇7 | 20 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YANG乳腺癌ESR1激光升高 | 34 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Willert Wnt信令 | 24 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Okumura炎症反应LPS | 183 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝克莫昔芬抵抗DN | 52 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 康（Kang）由tert dn永生 | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vietor ifrd1目标 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramaswamy转移 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krasnoselskaya ILF3靶向DN | 46 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染6小时DN | 160 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| su胎盘 | 30 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 | 88 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zaidi成骨细胞转录因子 | 14 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schraets MLL靶向 | 35 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Poola侵入性乳腺癌DN | 134 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nakayama软组织肿瘤PCA2 UP | 87 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schmidt Por目标在肢体芽dn中 | 8 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-135 | 1096 | 1102 | M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
| HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
| mir-217 | 1287 | 1293 | 1a | HSA-MIR-217 | uacugcaucagaacugauuggau |
| mir-329 | 1021 | 1027 | 1a | HSA-MIR-329脑 | aacacaccugguaaccucuuu |