基因页：MT1A

概括？
基因 4489
象征 MT1A
同义词 mt1 | mt1s | mtc
描述 金属硫蛋白1a
参考 MIM：156350|HGNC：HGNC：7393|ENSEMBL：ENSG00000205362|HPRD：07035|Vega：Otthumg00000176919
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16Q13
Pascal P值 0.177
胎儿β -1.454
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG09137696 16 56672415 MT1A 7.45e-5 -0.399 0.025 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17541094 CHR2 66266798 MT1A 4489 5.281E-4 反式
RS4256179 CHR3 169628328 MT1A 4489 0 反式
RS9870311 CHR3 169641061 MT1A 4489 0 反式
RS432098 CHR5 13606809 MT1A 4489 0.12 反式
RS4516856 CHR5 43889206 MT1A 4489 0.17 反式
RS12344698 Chr9 16750142 MT1A 4489 0.01 反式
RS16909867 Chr9 25899226 MT1A 4489 0.02 反式
RS3802522 Chr10 28341865 MT1A 4489 0.01 反式
RS1240385 Chr10 88727329 MT1A 4489 0.09 反式
RS10743139 Chr11 10425326 MT1A 4489 0.03 反式
RS11833888 CHR12 59350152 MT1A 4489 0.02 反式
RS17076272 CHR13 22726361 MT1A 4489 0.04 反式
RS17076274 CHR13 22726381 MT1A 4489 0.04 反式
RS16968806 CHR15 39622447 MT1A 4489 0.01 反式
RS6047026 CHR20 20730673 MT1A 4489 0.18 反式
RS6075703 CHR20 20736750 MT1A 4489 0.18 反式
RS7888404 Chrx 20508308 MT1A 4489 0.01 反式
RS17342476 Chrx 102243644 MT1A 4489 0.11 反式
RS17342483 Chrx 102250155 MT1A 4489 0.07 反式
RS17342504 Chrx 102272107 MT1A 4489 0.11 反式
SNP_A-2138851 0 MT1A 4489 0.11 反式
SNP_A-2059928 0 MT1A 4489 0.11 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ankrd13a 0.36 0.36
BBS2 0.35 0.35
Inpp5b 0.34 0.37
mett11d1 0.34 0.35
pan2 0.34 0.37
SFRS6 0.34 0.37
NEK9 0.34 0.33
C15orf44 0.34 0.35
C9orf156 0.34 0.30
Agxt2L2 0.33 0.32
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CLEC3B -0.25 -0.30
卡16 -0.24 -0.26
IL32 -0.23 -0.29
GNG11 -0.22 -0.23
C16orf74 -0.21 -0.19
CXCL14 -0.21 -0.24
ifi27 -0.21 -0.24
AF347015.21 -0.21 -0.25
cdc42ep5 -0.20 -0.26
higd1b -0.19 -0.22

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Markey RB1急性lof 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa永远转变 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN 185 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低DN 165 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高 147 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌 146 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进展 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlesinger甲基化的癌症 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 110 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Houstis Ros 36 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL CBP融合的王目标 44 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nemeth炎症反应LPS 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴与血液DN 162 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中岛肥大细胞 46 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MA髓样差异化 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iglesias e2f目标dn 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlingemann皮肤致癌作用TPA 42 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向DN 215 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bacolod抗烷基化剂的抗性 26 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江式下丘脑老化 47 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
结肠癌中甲基化的甲基化 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein星形胶质细胞标记 42 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piontek PKD1靶向 38 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP 107 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病35D UP 131 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine卵泡甲状腺腺瘤 75 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine乳头状甲状腺癌DN 80 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤PCA3 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇7的时间反应7 76 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时DN 222 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向 112 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis Commd1目标2组 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Guillaumond KLF10靶向 51 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向 266 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Altemeier对LPS具有机械通气的反应 128 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ghandhi直接辐照 110 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因