基因页:MT1H
概括?
基因 | 4496 |
象征 | MT1H |
同义词 | MT-0 | MT-1H | MT-IH | MT1 |
描述 | 金属硫蛋白1H |
参考 | MIM:156354|HGNC:HGNC:7400|Ensembl:ENSG00000205358|HPRD:01128|Vega:Otthumg00000133283 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16Q13 |
Pascal P值 | 0.131 |
Sherlock P值 | 0.574 |
胎儿β | 0.088 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00448143 | 16 | 56703788 | MT1H | 3.062E-4 | -0.294 | 0.04 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17668963 | CHR6 | 84811128 | MT1H | 4496 | 0.03 | 反式 | ||
RS7741955 | CHR6 | 84829621 | MT1H | 4496 | 0.07 | 反式 | ||
RS10943968 | CHR6 | 84897932 | MT1H | 4496 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MT1H_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PARP1 | 0.92 | 0.89 |
NCAPD3 | 0.90 | 0.89 |
KPNB1 | 0.90 | 0.89 |
LSM14A | 0.89 | 0.86 |
DPF2 | 0.89 | 0.87 |
RPA1 | 0.89 | 0.85 |
MCM4 | 0.89 | 0.89 |
SND1 | 0.88 | 0.90 |
DDB1 | 0.88 | 0.91 |
hnrnpk | 0.88 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.72 | -0.80 |
AF347015.21 | -0.72 | -0.84 |
MT-CO2 | -0.72 | -0.80 |
AF347015.8 | -0.69 | -0.79 |
AF347015.27 | -0.69 | -0.79 |
AF347015.33 | -0.69 | -0.78 |
ifi27 | -0.67 | -0.75 |
mt-cyb | -0.67 | -0.76 |
higd1b | -0.66 | -0.74 |
AF347015.2 | -0.65 | -0.76 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘cmyb靶向 | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 | 275 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dittmer PTHLH靶向DN | 73 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Scibetta KDM5B靶向DN | 81 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2A DN | 141 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KAN对砷三氧化物的反应 | 123 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Olsson E2F3靶向DN | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TP73和TP63的Sasaki目标 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
瓦特自动甲状腺腺瘤 | 73 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应480 HELA | 164 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
唱机转移基质DN | 54 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
brocke凋亡由IL6逆转 | 144 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iizuka肝癌进展L1 G1 UP | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Petrova内皮淋巴与血液DN | 162 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中岛肥大细胞 | 46 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时DN | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hendricks Smarca4靶向 | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chuang氧化应激反应向上 | 28 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen lvad支持失败的心 | 103 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng对砷的反应 | 18 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏4NQO | 38 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村掺杂早期 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MariaDason对丁酸姜黄素Sulindac TSA的反应1 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向低血清 | 100 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Tial1目标 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
因宗乳腺干细胞向上 | 146 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ghandhi直接辐照 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ghandhi旁观者辐照 | 86 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |