概括
基因 4496
象征 MT1H
同义词 MT-0 | MT-1H | MT-IH | MT1
描述 金属硫蛋白1H
参考 MIM:156354|HGNC:HGNC:7400|Ensembl:ENSG00000205358|HPRD:01128|Vega:Otthumg00000133283
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16Q13
Pascal P值 0.131
Sherlock P值 0.574
胎儿β 0.088
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00448143 16 56703788 MT1H 3.062E-4 -0.294 0.04 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17668963 CHR6 84811128 MT1H 4496 0.03 反式
RS7741955 CHR6 84829621 MT1H 4496 0.07 反式
RS10943968 CHR6 84897932 MT1H 4496 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PARP1 0.92 0.89
NCAPD3 0.90 0.89
KPNB1 0.90 0.89
LSM14A 0.89 0.86
DPF2 0.89 0.87
RPA1 0.89 0.85
MCM4 0.89 0.89
SND1 0.88 0.90
DDB1 0.88 0.91
hnrnpk 0.88 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.72 -0.80
AF347015.21 -0.72 -0.84
MT-CO2 -0.72 -0.80
AF347015.8 -0.69 -0.79
AF347015.27 -0.69 -0.79
AF347015.33 -0.69 -0.78
ifi27 -0.67 -0.75
mt-cyb -0.67 -0.76
higd1b -0.66 -0.74
AF347015.2 -0.65 -0.76

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 275 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer PTHLH靶向DN 73 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Scibetta KDM5B靶向DN 81 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2A DN 141 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAN对砷三氧化物的反应 123 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Olsson E2F3靶向DN 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson对砷的回应 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TP73和TP63的Sasaki目标 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
瓦特自动甲状腺腺瘤 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应480 HELA 164 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
唱机转移基质DN 54 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
brocke凋亡由IL6逆转 144 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iizuka肝癌进展L1 G1 UP 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴与血液DN 162 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中岛肥大细胞 46 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时DN 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hendricks Smarca4靶向 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chuang氧化应激反应向上 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen lvad支持失败的心 103 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng对砷的反应 18 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏4NQO 38 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村掺杂早期 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MariaDason对丁酸姜黄素Sulindac TSA的反应1 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向低血清 100 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Tial1目标 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
因宗乳腺干细胞向上 146 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ghandhi直接辐照 110 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ghandhi旁观者辐照 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因