概括
基因 4548
象征 mtr
同义词 HMAG | MS | CBLG
描述 5-甲基四氢叶酸 - 摩环甲基转移酶
参考 MIM:156570|HGNC:HGNC:7468|Ensembl:ENSG00000116984|HPRD:01136|Vega:Otthumg00000040060
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q43
Sherlock P值 0.691
胎儿β 1.049
主持人 小脑半球
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 1 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS350213 CHR16 12153373 mtr 4548 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008705 蛋氨酸合酶活性 经验 谷氨酸(GO期限:7) 8968737
去:0008705 蛋氨酸合酶活性 IEA 谷氨酸(GO期限:7) -
去:0004156 二氢蛋白酶合酶活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
去:0008898 同型半胱氨酸S-甲基转移酶活性 IEA -
去:0008168 甲基转移酶活性 IEA -
GO:0031419 钴胺素结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
GO:0050897 钴离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007399 神经系统的发展 塔斯 神经突(GO期限:5) 8968737
去:0009086 蛋氨酸生物合成过程 IEA -
去:0008652 氨基酸生物合成过程 IEA -
去:0009396 叶酸和衍生物生物合成过程 IEA -
GO:0044237 细胞代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 经验 8968737
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg半胱氨酸和蛋氨酸代谢 34 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg fule一个碳池 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组硫氨基酸代谢 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
氨基酸和衍生物的反应组代谢 200 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组生物氧化 139 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome II期结合 70 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 117 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔衰老肾脏无血DN 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由组蛋白乙酰化DN调节的玛丽亚达森 54 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏DN 145 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森平滑肌肉瘤 18 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 60 67 1A,M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC