基因页:mtr
概括?
基因 | 4548 |
象征 | mtr |
同义词 | HMAG | MS | CBLG |
描述 | 5-甲基四氢叶酸 - 摩环甲基转移酶 |
参考 | MIM:156570|HGNC:HGNC:7468|Ensembl:ENSG00000116984|HPRD:01136|Vega:Otthumg00000040060 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q43 |
Sherlock P值 | 0.691 |
胎儿β | 1.049 |
主持人 | 小脑半球 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 1 | 链接到Szgene |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS350213 | CHR16 | 12153373 | mtr | 4548 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MTR_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008705 | 蛋氨酸合酶活性 | 经验 | 谷氨酸(GO期限:7) | 8968737 |
去:0008705 | 蛋氨酸合酶活性 | IEA | 谷氨酸(GO期限:7) | - |
去:0004156 | 二氢蛋白酶合酶活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
去:0008898 | 同型半胱氨酸S-甲基转移酶活性 | IEA | - | |
去:0008168 | 甲基转移酶活性 | IEA | - | |
GO:0031419 | 钴胺素结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
GO:0050897 | 钴离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突(GO期限:5) | 8968737 |
去:0009086 | 蛋氨酸生物合成过程 | IEA | - | |
去:0008652 | 氨基酸生物合成过程 | IEA | - | |
去:0009396 | 叶酸和衍生物生物合成过程 | IEA | - | |
GO:0044237 | 细胞代谢过程 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | 经验 | 8968737 | |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg半胱氨酸和蛋氨酸代谢 | 34 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg fule一个碳池 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组硫氨基酸代谢 | 24 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome II期结合 | 70 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 | 128 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 | 117 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔衰老肾脏无血DN | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由组蛋白乙酰化DN调节的玛丽亚达森 | 54 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏DN | 145 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼尔森平滑肌肉瘤 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124/506 | 60 | 67 | 1A,M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC |