基因页面:MTRR
总结吗?
GeneID | 4552年 |
象征 | MTRR |
同义词 | MSR | cblE |
描述 | 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine甲基转移酶还原酶 |
参考 | MIM: 602568|HGNC: HGNC: 7473|运用:ENSG00000124275|HPRD: 03979|织女:OTTHUMG00000090477 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 5 p15.31 |
帕斯卡假定值 | 0.157 |
夏洛克假定值 | 0.539 |
胎儿β | -0.646 |
eGene | 尾状基底神经节 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs327588 | chr5 | 7908358 | MTRR | 4552年 | 0.04 | 独联体 | ||
rs17243407 | 5 | 7858121 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 1.732 e - | 0 | 1221年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs7716373 | 5 | 7860908 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 3.182 e - | 0 | 4008年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13154459 | 5 | 7861619 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 1.524 e - | 0 | 4719年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs17184211 | 5 | 7866106 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 3.556 e - | 0 | 9206年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1801394 | 5 | 7870973 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 8.361平台以及 | 0 | 14073年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13181011 | 5 | 7874424 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 3.509 e - | 0 | 17524年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs11949523 | 5 | 7881027 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 1.74 e - | 0 | 24127年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs62342527 | 5 | 7882211 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 1.556 e - | 0 | 25311年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs35035568 | 5 | 7886585 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 1.831 e - | 0 | 29685年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13189728 | 5 | 7887284 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 1.281 e - | 0 | 30384年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13190084 | 5 | 7887488 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 1.278 e - | 0 | 30588年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs144069526 | 5 | 7887847 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 1.271 e - | 0 | 30947年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs62342530 | 5 | 7888198 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 1.261 e - | 0 | 31298年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs17267737 | 5 | 7893808 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 1.137 e - | 0 | 36908年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs34966478 | 5 | 7896606 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 2.296 e-8 | 0 | 39706年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9282787 | 5 | 7900598 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 2.141 e - | 0 | 43698年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs12108985 | 5 | 7907309 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 2.141 e - | 0 | 50409年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs17245023 | 5 | 7909855 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 9.72 e-8 | 0 | 52955年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs2128266 | 5 | 7911470 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 2.141 e - | 0 | 54570年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13173919 | 5 | 7919212 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 4.759 e-8 | 0 | 62312年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13178414 | 5 | 7919602 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 4.495 e-8 | 0 | 62702年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs10462646 | 5 | 7920322 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 1.419 e-8 | 0 | 63422年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13170757 | 5 | 7922542 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 1.332 e - | 0 | 65642年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs16879466 | 5 | 7930195 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 3.206 e-8 | 0 | 73295年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs10440693 | 5 | 7930866 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 3.325 e-8 | 0 | 73966年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs999610 | 5 | 7931390 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 9.72 e-8 | 0 | 74490年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1968991 | 5 | 7932199 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 9.72 e-8 | 0 | 75299年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1493447 | 5 | 7935039 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 9.72 e-8 | 0 | 78139年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs34520786 | 5 | 7937555 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 8.592 e-9 | 0 | 80655年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1493446 | 5 | 7938528 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 1.556 e - | 0 | 81628年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs62358784 | 5 | 7946742 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 2.237 e-6 | 0 | 89842年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs767084 | 5 | 7947648 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 2.237 e-6 | 0 | 90748年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs78787612 | 5 | 7948112 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 2.234 e-6 | 0 | 91212年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1542781 | 5 | 7952536 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 2.272 e-6 | 0 | 95636年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs13157729 | 5 | 7953623 | MTRR | ENSG00000124275.10 | 3.11 e - | 0 | 96723年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MTRR_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005506 | 铁离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016740 | 转移酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008168 | 甲基转移酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0010181 | FMN绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0010181 | FMN绑定 | 助教 | 9501215 | |
去:0009055 | 电子载体活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016491 | 氧化还原酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0030586 | (蛋氨酸合成酶)还原酶的活动 | 助教 | 9501215 | |
去:0050660 | 时尚绑定 | 助教 | 9501215 | |
去:0050661 | 辅酶ii绑定 | 助教 | 9501215 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0009086 | 甲硫氨酸生物合成的过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008652 | 氨基酸生物合成的过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0055114 | 氧化还原 | 助教 | 9501215 | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005829 | 胞质 | 助教 | 9501215 | |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005739 | 线粒体 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
TIEN肠道益生菌6小时DN | 167年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TIEN肠道益生菌24小时 | 557年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
在肝癌MIDORIKAWA放大 | 55 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
洛克伍德在肺癌放大 | 214年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陆衰老的大脑了 | 262年 | 186年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
巴科洛德耐烷基化剂DN | 60 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LEIN少突细胞标记 | 74年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
黄线粒体基因模块 | 217年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陆EZH2 DN的目标 | 414年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACOSTA扩散独立MYC目标 | 84年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李BMP2 DN的目标 | 882年 | 538年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN FEVR CTNNB1目标 | 553年 | 343年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG EGF持续DN | 61年 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 361 | 538年 | 545年 | 1、m8 | hsa - mir - 361大脑 | UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC |