总结吗?
GeneID 4552年
象征 MTRR
同义词 MSR | cblE
描述 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine甲基转移酶还原酶
参考 MIM: 602568|HGNC: HGNC: 7473|运用:ENSG00000124275|HPRD: 03979|织女:OTTHUMG00000090477
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 5 p15.31
帕斯卡假定值 0.157
夏洛克假定值 0.539
胎儿β -0.646
eGene 尾状基底神经节
皮质
额叶皮质BA9
伏隔核基底神经节
硬膜基底神经节
迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs327588 chr5 7908358 MTRR 4552年 0.04 独联体
rs17243407 5 7858121 MTRR ENSG00000124275.10 1.732 e - 0 1221年 gtex_brain_putamen_basal
rs7716373 5 7860908 MTRR ENSG00000124275.10 3.182 e - 0 4008年 gtex_brain_putamen_basal
rs13154459 5 7861619 MTRR ENSG00000124275.10 1.524 e - 0 4719年 gtex_brain_putamen_basal
rs17184211 5 7866106 MTRR ENSG00000124275.10 3.556 e - 0 9206年 gtex_brain_putamen_basal
rs1801394 5 7870973 MTRR ENSG00000124275.10 8.361平台以及 0 14073年 gtex_brain_putamen_basal
rs13181011 5 7874424 MTRR ENSG00000124275.10 3.509 e - 0 17524年 gtex_brain_putamen_basal
rs11949523 5 7881027 MTRR ENSG00000124275.10 1.74 e - 0 24127年 gtex_brain_putamen_basal
rs62342527 5 7882211 MTRR ENSG00000124275.10 1.556 e - 0 25311年 gtex_brain_putamen_basal
rs35035568 5 7886585 MTRR ENSG00000124275.10 1.831 e - 0 29685年 gtex_brain_putamen_basal
rs13189728 5 7887284 MTRR ENSG00000124275.10 1.281 e - 0 30384年 gtex_brain_putamen_basal
rs13190084 5 7887488 MTRR ENSG00000124275.10 1.278 e - 0 30588年 gtex_brain_putamen_basal
rs144069526 5 7887847 MTRR ENSG00000124275.10 1.271 e - 0 30947年 gtex_brain_putamen_basal
rs62342530 5 7888198 MTRR ENSG00000124275.10 1.261 e - 0 31298年 gtex_brain_putamen_basal
rs17267737 5 7893808 MTRR ENSG00000124275.10 1.137 e - 0 36908年 gtex_brain_putamen_basal
rs34966478 5 7896606 MTRR ENSG00000124275.10 2.296 e-8 0 39706年 gtex_brain_putamen_basal
rs9282787 5 7900598 MTRR ENSG00000124275.10 2.141 e - 0 43698年 gtex_brain_putamen_basal
rs12108985 5 7907309 MTRR ENSG00000124275.10 2.141 e - 0 50409年 gtex_brain_putamen_basal
rs17245023 5 7909855 MTRR ENSG00000124275.10 9.72 e-8 0 52955年 gtex_brain_putamen_basal
rs2128266 5 7911470 MTRR ENSG00000124275.10 2.141 e - 0 54570年 gtex_brain_putamen_basal
rs13173919 5 7919212 MTRR ENSG00000124275.10 4.759 e-8 0 62312年 gtex_brain_putamen_basal
rs13178414 5 7919602 MTRR ENSG00000124275.10 4.495 e-8 0 62702年 gtex_brain_putamen_basal
rs10462646 5 7920322 MTRR ENSG00000124275.10 1.419 e-8 0 63422年 gtex_brain_putamen_basal
rs13170757 5 7922542 MTRR ENSG00000124275.10 1.332 e - 0 65642年 gtex_brain_putamen_basal
rs16879466 5 7930195 MTRR ENSG00000124275.10 3.206 e-8 0 73295年 gtex_brain_putamen_basal
rs10440693 5 7930866 MTRR ENSG00000124275.10 3.325 e-8 0 73966年 gtex_brain_putamen_basal
rs999610 5 7931390 MTRR ENSG00000124275.10 9.72 e-8 0 74490年 gtex_brain_putamen_basal
rs1968991 5 7932199 MTRR ENSG00000124275.10 9.72 e-8 0 75299年 gtex_brain_putamen_basal
rs1493447 5 7935039 MTRR ENSG00000124275.10 9.72 e-8 0 78139年 gtex_brain_putamen_basal
rs34520786 5 7937555 MTRR ENSG00000124275.10 8.592 e-9 0 80655年 gtex_brain_putamen_basal
rs1493446 5 7938528 MTRR ENSG00000124275.10 1.556 e - 0 81628年 gtex_brain_putamen_basal
rs62358784 5 7946742 MTRR ENSG00000124275.10 2.237 e-6 0 89842年 gtex_brain_putamen_basal
rs767084 5 7947648 MTRR ENSG00000124275.10 2.237 e-6 0 90748年 gtex_brain_putamen_basal
rs78787612 5 7948112 MTRR ENSG00000124275.10 2.234 e-6 0 91212年 gtex_brain_putamen_basal
rs1542781 5 7952536 MTRR ENSG00000124275.10 2.272 e-6 0 95636年 gtex_brain_putamen_basal
rs13157729 5 7953623 MTRR ENSG00000124275.10 3.11 e - 0 96723年 gtex_brain_putamen_basal

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005506 铁离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0016740 转移酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0008168 甲基转移酶活性 国际能源机构 - - - - - -
去:0010181 FMN绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0010181 FMN绑定 助教 9501215
去:0009055 电子载体活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0016491 氧化还原酶活性 国际能源机构 - - - - - -
去:0030586 (蛋氨酸合成酶)还原酶的活动 助教 9501215
去:0050660 时尚绑定 助教 9501215
去:0050661 辅酶ii绑定 助教 9501215
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0009086 甲硫氨酸生物合成的过程 国际能源机构 - - - - - -
去:0008652 氨基酸生物合成的过程 国际能源机构 - - - - - -
去:0055114 氧化还原 助教 9501215
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005829 胞质 助教 9501215
去:0005737 细胞质 国际能源机构 - - - - - -
去:0005739 线粒体 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
TIEN肠道益生菌6小时DN 167年 One hundred. 所有SZGR 2.0基因通路
TIEN肠道益生菌24小时 557年 331年 所有SZGR 2.0基因通路
多德鼻咽癌DN 1375年 806年 所有SZGR 2.0基因通路
在肝癌MIDORIKAWA放大 55 38 所有SZGR 2.0基因通路
洛克伍德在肺癌放大 214年 139年 所有SZGR 2.0基因通路
陆衰老的大脑了 262年 186年 所有SZGR 2.0基因通路
巴科洛德耐烷基化剂DN 60 45 所有SZGR 2.0基因通路
LEIN少突细胞标记 74年 53 所有SZGR 2.0基因通路
黄线粒体基因模块 217年 122年 所有SZGR 2.0基因通路
陆EZH2 DN的目标 414年 237年 所有SZGR 2.0基因通路
ACOSTA扩散独立MYC目标 84年 51 所有SZGR 2.0基因通路
李BMP2 DN的目标 882年 538年 所有SZGR 2.0基因通路
DN FEVR CTNNB1目标 553年 343年 所有SZGR 2.0基因通路
ZWANG EGF持续DN 61年 36 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 361 538年 545年 1、m8 hsa - mir - 361大脑 UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC