概括?
基因ID 4599
Symbol MX1
同义词 IFI-78K|IFI78|MX|MxA
描述 MX dynamin like GTPase 1
参考 MIM:147150|HGNC:HGNC:7532|Ensembl:ENSG00000157601|HPRD:00919|Vega:Otthumg00000086755
基因type protein-coding
地图位置 21q22.3
Pascal P值 0.066
Sherlock P值 0.941
Fetal beta -1.894
eGene 下丘脑
Nucleus accumbens basal ganglia
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
RS2815435 chr1 69725657 MX1 4599 0.15 trans
RS17092900 chr1 73003409 MX1 4599 0 trans
rs16857588 chr2 11675145 MX1 4599 0 trans
rs10495652 chr2 17139288 MX1 4599 0.09 trans
rs6531271 chr2 17139932 MX1 4599 0.09 trans
rs12620194 chr2 17148003 MX1 4599 0.09 trans
RS17018721 chr2 80385148 MX1 4599 0.15 trans
RS17043176 chr2 114025371 MX1 4599 0.03 trans
RS10186260 chr2 129538777 MX1 4599 0.13 trans
rs3108986 chr2 130360681 MX1 4599 0.01 trans
rs1859063 chr2 130363730 MX1 4599 0.01 trans
rs11897086 chr2 184596267 MX1 4599 0.13 trans
rs10187085 chr2 184614775 MX1 4599 0.03 trans
rs9989867 chr2 184628012 MX1 4599 0.03 trans
RS7637875 chr3 40594263 MX1 4599 0.08 trans
RS890527 chr3 140774852 MX1 4599 0.18 trans
RS7612673 chr3 154499328 MX1 4599 0.03 trans
RS10461085 chr4 30717743 MX1 4599 0.16 trans
rs17193303 chr4 181596595 MX1 4599 0.16 trans
rs1678893 chr5 31763244 MX1 4599 9.22E-5 trans
RS10516136 chr5 176381368 MX1 4599 0.11 trans
rs13176869 chr5 179203478 MX1 4599 0 trans
RS9396602 chr6 15766500 MX1 4599 0.06 trans
RS12524136 chr6 84935440 MX1 4599 0.01 trans
RS9397692 chr6 154487314 MX1 4599 1.782E-4 trans
RS10485060 chr6 154516100 MX1 4599 3.19e-4 trans
rs9384190 chr6 154524473 MX1 4599 4.312E-4 trans
RS17292544 chr6 154544809 MX1 4599 3.737E-4 trans
RS4591922 chr7 21612318 MX1 4599 0.11 trans
rs17171716 chr7 40505332 MX1 4599 0.05 trans
rs11974883 chr7 78068523 MX1 4599 0.19 trans
rs1358128 chr8 5268072 MX1 4599 0.05 trans
RS9298078 chr8 64906618 MX1 4599 0.04 trans
rs10283729 chr9 2981636 MX1 4599 0.08 trans
rs12253931 chr10 63343347 MX1 4599 0.19 trans
rs10509151 chr10 63358651 MX1 4599 0.02 trans
RS12781009 chr10 63437985 MX1 4599 0.12 trans
RS16916549 chr10 63495204 MX1 4599 0 trans
rs11038039 chr11 44530644 MX1 4599 0.03 trans
rs11038047 chr11 44543848 MX1 4599 0.01 trans
rs17061055 chr13 40835399 MX1 4599 3.153 e-5 trans
RS17066364 chr13 45515988 MX1 4599 1.407E-4 trans
RS3783149 chr13 45582764 MX1 4599 0.01 trans
RS7332969 chr13 45612902 MX1 4599 1.407E-4 trans
rs7982499 chr13 48397317 MX1 4599 0.14 trans
rs749951 chr14 96376252 MX1 4599 0.02 trans
RS16955413 chr15 29677652 MX1 4599 2.949E-4 trans
rs16955238 chr16 81415690 MX1 4599 0 trans
rs16955255 chr16 81420130 MX1 4599 0.01 trans
rs16955259 chr16 81420188 MX1 4599 0 trans
rs8105452 chr19 11854016 MX1 4599 0.03 trans
rs8104298 chr19 11867512 MX1 4599 0 trans
RS16979927 chr20 55019249 MX1 4599 1.824E-4 trans
RS2832206 chr21 30504653 MX1 4599 0.05 trans
RS17331284 chrX 6962964 MX1 4599 0.16 trans
rs17347454 chrX 23347700 MX1 4599 1.764E-5 trans
RS689365 chrX 97074769 MX1 4599 0.01 trans
rs10856133 0 MX1 4599 0.01 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
ACTC1 0.75 0.63
ALK 0.75 0.76
Prox1 0.74 0.69
ZIC2 0.74 0.30
KRT18P19 0.74 0.05
ZIC1 0.73 0.47
PGAM2 0.72 0.43
FZD10 0.71 0.34
羊羔3 0.71 0.73
ADAMTS16 0.71 0.42
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
GPR22 -0.28 -0.25
klhl1 -0.26 -0.10
SLC26A4 -0.26 -0.24
EMX1 -0.26 -0.28
NEUROD6 -0.25 -0.25
IER5L -0.25 -0.22
DPP4 -0.25 -0.23
SATB2 -0.25 -0.18
SLA -0.25 -0.07
mpped1 -0.24 -0.18

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
BLM BS | MGC126616 | MGC131618 | MGC131620 | RECQ2 | RECQL2 | RECQL3 Bloom syndrome - HPRD,Biogrid 11716541
DAXX BING2 | DAP6 | EAP1 | MGC126245 | MGC126246 死亡域相关蛋白 in vitro
两个杂交
BioGRID 11716541
FANCA FA | FA-H | FA1 | FAA | FACA | FAH | FANCH | MGC75158 Fanconi anemia, complementation group A 两个杂交 BioGRID 14499622
MX1 IFI-78K | IFI78 | MX | MxA 粘液病毒(流感病毒)抗性1,干扰素诱导蛋白P78(小鼠) - HPRD,Biogrid 9060610|9735310
TRPC1 HTRP-1 |MGC133334 |MGC133335 |TRP1 transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 1 MXA与TRPC1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类MXA和TRPC1之间的相互作用进行建模的。 BIND 15757897
TRPC3 TRP3 transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 3 MxA interacts with TRPC3. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human MxA and TRPC3 from unspecified species. BIND 15757897
TRPC4 HTRP4 | MGC119570 | MGC119571 | MGC119572 | MGC119573 | TRP4 transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 4 MXA与TRPC4相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类MXA和TRPC4之间的相互作用进行建模的。 BIND 15757897
TRPC5 TRP5 transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 5 MXA与TRPC5相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类MXA和TRPC5之间的相互作用进行建模的。 BIND 15757897
TRPC6 FLJ11098 | FLJ14863 | FSGS2 | TRP6 transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 6 MXA与TRPC6相互作用。 BIND 15757897
TRPC7 TRP7 瞬态受体电势阳离子通道,亚家族C,成员7 MXA与TRPC7相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类MXA和TRPC7之间的相互作用建模的。 BIND 15757897
TUBB2A TUBB | TUBB2 | dJ40E16.7 tubulin, beta 2A - HPRD 1629950


V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 66 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTERFERON ALPHA BETA SIGNALING 64 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTERFERON SIGNALING 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NOJIMA SFRP2 TARGETS DN 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 182 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 157 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 10D UP 194 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION MONOCYTE UP 204 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮增强 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 211 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEREZ TP53 TARGETS 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEREZ TP53 AND TP63 TARGETS 205 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌簇1 44 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bowie对细胞外基质的反应 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOWIE RESPONSE TO TAMOXIFEN 18 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU HGF目标由Akt1 6hr诱导 19 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU AKT1目标6小时 27 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EINAV INTERFERON SIGNATURE IN CANCER 27 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多尔STAT3 DN的目标 50 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEITZ NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY 8P DELETION UP 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kang lith pdgfra up 50 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALCALA APOPTOSIS 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN NIPP1 TARGETS UP 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROZANOV MMP14 TARGETS UP 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ASTON MAJOR DEPRESSIVE DISORDER DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DER IFN ALPHA RESPONSE UP 74 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST UP 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BECKER TAMOXIFEN RESISTANCE UP 50 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RADAEVA RESPONSE TO IFNA1 UP 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn beta响应 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROCKE APOPTOSIS REVERSED BY IL6 144 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
萨那对ifng的回应 78 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF SIGNALING UP 83 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROETH TERT TARGETS UP 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bennett系统性狼疮红斑 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERHAAK AML WITH NPM1 MUTATED DN 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang被甲基化2沉默2 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITESIDE CISPLATIN RESISTANCE UP 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG SMARCE1 TARGETS DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG IMMORTALIZED BY HPV31 DN 65 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE INTERFERON RESPONSIVE GENES 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRASNOSELSKAYA ILF3 TARGETS UP 38 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV ALL UP 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG ANTIVIRAL RESPONSE TO RIBAVIRIN UP 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JACKSON DNMT1 TARGETS UP 77 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV 24 HR UP 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 6HR UP 71 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 8小时 47 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER SILENCED BY METHYLATION UP 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WALLACE PROSTATE CANCER RACE UP 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Moserle IFNA响应 31 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HONMA DOCETAXEL RESISTANCE 34 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在肿瘤血管生成期间沉默的Hellebrekers 80 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG INTERFERON RESPONSE 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAN SATB1 TARGETS DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JISON SICKLE CELL DISEASE UP 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UROSEVIC RESPONSE TO IMIQUIMOD 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gutierrez多发性骨髓瘤 35 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIARETTI T ALL REFRACTORY TO THERAPY 30 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANDRAN METASTASIS DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
突变的TP53 DN的Stambolsky靶标 50 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERIBELLI PROMOTERS INACTIVE AND BOUND BY NFY 44 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERIBELLI GENES INACTIVE AND BOUND BY NFY 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AZARE NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY STAT3 UP 121 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDRIOLI MIR31 TARGETS DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER KDM1A TARGETS UP 266 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO INTERFERON INDUCED ANTIVIRAL MODULE 78 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hecker IFNB1目标 95 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因