基因页:MX1
概括?
基因ID | 4599 |
Symbol | MX1 |
同义词 | IFI-78K|IFI78|MX|MxA |
描述 | MX dynamin like GTPase 1 |
参考 | MIM:147150|HGNC:HGNC:7532|Ensembl:ENSG00000157601|HPRD:00919|Vega:Otthumg00000086755 |
基因type | protein-coding |
地图位置 | 21q22.3 |
Pascal P值 | 0.066 |
Sherlock P值 | 0.941 |
Fetal beta | -1.894 |
eGene | 下丘脑 Nucleus accumbens basal ganglia 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | Click to show details |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | Chromosome | Position | eGene | 基因Entrez ID | PVALUE | qvalue | TSS distance | eQTL type |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2815435 | chr1 | 69725657 | MX1 | 4599 | 0.15 | trans | ||
RS17092900 | chr1 | 73003409 | MX1 | 4599 | 0 | trans | ||
rs16857588 | chr2 | 11675145 | MX1 | 4599 | 0 | trans | ||
rs10495652 | chr2 | 17139288 | MX1 | 4599 | 0.09 | trans | ||
rs6531271 | chr2 | 17139932 | MX1 | 4599 | 0.09 | trans | ||
rs12620194 | chr2 | 17148003 | MX1 | 4599 | 0.09 | trans | ||
RS17018721 | chr2 | 80385148 | MX1 | 4599 | 0.15 | trans | ||
RS17043176 | chr2 | 114025371 | MX1 | 4599 | 0.03 | trans | ||
RS10186260 | chr2 | 129538777 | MX1 | 4599 | 0.13 | trans | ||
rs3108986 | chr2 | 130360681 | MX1 | 4599 | 0.01 | trans | ||
rs1859063 | chr2 | 130363730 | MX1 | 4599 | 0.01 | trans | ||
rs11897086 | chr2 | 184596267 | MX1 | 4599 | 0.13 | trans | ||
rs10187085 | chr2 | 184614775 | MX1 | 4599 | 0.03 | trans | ||
rs9989867 | chr2 | 184628012 | MX1 | 4599 | 0.03 | trans | ||
RS7637875 | chr3 | 40594263 | MX1 | 4599 | 0.08 | trans | ||
RS890527 | chr3 | 140774852 | MX1 | 4599 | 0.18 | trans | ||
RS7612673 | chr3 | 154499328 | MX1 | 4599 | 0.03 | trans | ||
RS10461085 | chr4 | 30717743 | MX1 | 4599 | 0.16 | trans | ||
rs17193303 | chr4 | 181596595 | MX1 | 4599 | 0.16 | trans | ||
rs1678893 | chr5 | 31763244 | MX1 | 4599 | 9.22E-5 | trans | ||
RS10516136 | chr5 | 176381368 | MX1 | 4599 | 0.11 | trans | ||
rs13176869 | chr5 | 179203478 | MX1 | 4599 | 0 | trans | ||
RS9396602 | chr6 | 15766500 | MX1 | 4599 | 0.06 | trans | ||
RS12524136 | chr6 | 84935440 | MX1 | 4599 | 0.01 | trans | ||
RS9397692 | chr6 | 154487314 | MX1 | 4599 | 1.782E-4 | trans | ||
RS10485060 | chr6 | 154516100 | MX1 | 4599 | 3.19e-4 | trans | ||
rs9384190 | chr6 | 154524473 | MX1 | 4599 | 4.312E-4 | trans | ||
RS17292544 | chr6 | 154544809 | MX1 | 4599 | 3.737E-4 | trans | ||
RS4591922 | chr7 | 21612318 | MX1 | 4599 | 0.11 | trans | ||
rs17171716 | chr7 | 40505332 | MX1 | 4599 | 0.05 | trans | ||
rs11974883 | chr7 | 78068523 | MX1 | 4599 | 0.19 | trans | ||
rs1358128 | chr8 | 5268072 | MX1 | 4599 | 0.05 | trans | ||
RS9298078 | chr8 | 64906618 | MX1 | 4599 | 0.04 | trans | ||
rs10283729 | chr9 | 2981636 | MX1 | 4599 | 0.08 | trans | ||
rs12253931 | chr10 | 63343347 | MX1 | 4599 | 0.19 | trans | ||
rs10509151 | chr10 | 63358651 | MX1 | 4599 | 0.02 | trans | ||
RS12781009 | chr10 | 63437985 | MX1 | 4599 | 0.12 | trans | ||
RS16916549 | chr10 | 63495204 | MX1 | 4599 | 0 | trans | ||
rs11038039 | chr11 | 44530644 | MX1 | 4599 | 0.03 | trans | ||
rs11038047 | chr11 | 44543848 | MX1 | 4599 | 0.01 | trans | ||
rs17061055 | chr13 | 40835399 | MX1 | 4599 | 3.153 e-5 | trans | ||
RS17066364 | chr13 | 45515988 | MX1 | 4599 | 1.407E-4 | trans | ||
RS3783149 | chr13 | 45582764 | MX1 | 4599 | 0.01 | trans | ||
RS7332969 | chr13 | 45612902 | MX1 | 4599 | 1.407E-4 | trans | ||
rs7982499 | chr13 | 48397317 | MX1 | 4599 | 0.14 | trans | ||
rs749951 | chr14 | 96376252 | MX1 | 4599 | 0.02 | trans | ||
RS16955413 | chr15 | 29677652 | MX1 | 4599 | 2.949E-4 | trans | ||
rs16955238 | chr16 | 81415690 | MX1 | 4599 | 0 | trans | ||
rs16955255 | chr16 | 81420130 | MX1 | 4599 | 0.01 | trans | ||
rs16955259 | chr16 | 81420188 | MX1 | 4599 | 0 | trans | ||
rs8105452 | chr19 | 11854016 | MX1 | 4599 | 0.03 | trans | ||
rs8104298 | chr19 | 11867512 | MX1 | 4599 | 0 | trans | ||
RS16979927 | chr20 | 55019249 | MX1 | 4599 | 1.824E-4 | trans | ||
RS2832206 | chr21 | 30504653 | MX1 | 4599 | 0.05 | trans | ||
RS17331284 | chrX | 6962964 | MX1 | 4599 | 0.16 | trans | ||
rs17347454 | chrX | 23347700 | MX1 | 4599 | 1.764E-5 | trans | ||
RS689365 | chrX | 97074769 | MX1 | 4599 | 0.01 | trans | ||
rs10856133 | 0 | MX1 | 4599 | 0.01 | trans |
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MX1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
ACTC1 | 0.75 | 0.63 |
ALK | 0.75 | 0.76 |
Prox1 | 0.74 | 0.69 |
ZIC2 | 0.74 | 0.30 |
KRT18P19 | 0.74 | 0.05 |
ZIC1 | 0.73 | 0.47 |
PGAM2 | 0.72 | 0.43 |
FZD10 | 0.71 | 0.34 |
羊羔3 | 0.71 | 0.73 |
ADAMTS16 | 0.71 | 0.42 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
GPR22 | -0.28 | -0.25 |
klhl1 | -0.26 | -0.10 |
SLC26A4 | -0.26 | -0.24 |
EMX1 | -0.26 | -0.28 |
NEUROD6 | -0.25 | -0.25 |
IER5L | -0.25 | -0.22 |
DPP4 | -0.25 | -0.23 |
SATB2 | -0.25 | -0.18 |
SLA | -0.25 | -0.07 |
mpped1 | -0.24 | -0.18 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
BLM | BS | MGC126616 | MGC131618 | MGC131620 | RECQ2 | RECQL2 | RECQL3 | Bloom syndrome | - | HPRD,Biogrid | 11716541 |
DAXX | BING2 | DAP6 | EAP1 | MGC126245 | MGC126246 | 死亡域相关蛋白 | in vitro 两个杂交 |
BioGRID | 11716541 |
FANCA | FA | FA-H | FA1 | FAA | FACA | FAH | FANCH | MGC75158 | Fanconi anemia, complementation group A | 两个杂交 | BioGRID | 14499622 |
MX1 | IFI-78K | IFI78 | MX | MxA | 粘液病毒(流感病毒)抗性1,干扰素诱导蛋白P78(小鼠) | - | HPRD,Biogrid | 9060610|9735310 |
TRPC1 | HTRP-1 |MGC133334 |MGC133335 |TRP1 | transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 1 | MXA与TRPC1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类MXA和TRPC1之间的相互作用进行建模的。 | BIND | 15757897 |
TRPC3 | TRP3 | transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 3 | MxA interacts with TRPC3. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human MxA and TRPC3 from unspecified species. | BIND | 15757897 |
TRPC4 | HTRP4 | MGC119570 | MGC119571 | MGC119572 | MGC119573 | TRP4 | transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 4 | MXA与TRPC4相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类MXA和TRPC4之间的相互作用进行建模的。 | BIND | 15757897 |
TRPC5 | TRP5 | transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 5 | MXA与TRPC5相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类MXA和TRPC5之间的相互作用进行建模的。 | BIND | 15757897 |
TRPC6 | FLJ11098 | FLJ14863 | FSGS2 | TRP6 | transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 6 | MXA与TRPC6相互作用。 | BIND | 15757897 |
TRPC7 | TRP7 | 瞬态受体电势阳离子通道,亚家族C,成员7 | MXA与TRPC7相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类MXA和TRPC7之间的相互作用建模的。 | BIND | 15757897 |
TUBB2A | TUBB | TUBB2 | dJ40E16.7 | tubulin, beta 2A | - | HPRD | 1629950 |
V.途径注释
Pathway name | Pathway size | #szgr 2.0基因 | Info |
---|---|---|---|
IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 | 66 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME INTERFERON ALPHA BETA SIGNALING | 64 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME INTERFERON SIGNALING | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NOJIMA SFRP2 TARGETS DN | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 | 182 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 | 157 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 10D UP | 194 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 | 175 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION MONOCYTE UP | 204 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PEREZ TP53 TARGETS | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PEREZ TP53 AND TP63 TARGETS | 205 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌簇1 | 44 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bowie对细胞外基质的反应 | 17 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOWIE RESPONSE TO TAMOXIFEN | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU HGF目标由Akt1 6hr诱导 | 19 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU AKT1目标6小时 | 27 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EINAV INTERFERON SIGNATURE IN CANCER | 27 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多尔STAT3 DN的目标 | 50 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SEITZ NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY 8P DELETION UP | 73 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kang lith pdgfra up | 50 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ALCALA APOPTOSIS | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUYTTEN NIPP1 TARGETS UP | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ROZANOV MMP14 TARGETS UP | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ASTON MAJOR DEPRESSIVE DISORDER DN | 160 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DER IFN ALPHA RESPONSE UP | 74 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST UP | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BECKER TAMOXIFEN RESISTANCE UP | 50 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RADAEVA RESPONSE TO IFNA1 UP | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
der ifn beta响应 | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BROCKE APOPTOSIS REVERSED BY IL6 | 144 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
萨那对ifng的回应 | 78 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SANA TNF SIGNALING UP | 83 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ROETH TERT TARGETS UP | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bennett系统性狼疮红斑 | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VERHAAK AML WITH NPM1 MUTATED DN | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
liang被甲基化2沉默2 | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WHITESIDE CISPLATIN RESISTANCE UP | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WANG SMARCE1 TARGETS DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHANG IMMORTALIZED BY HPV31 DN | 65 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BROWNE INTERFERON RESPONSIVE GENES | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KRASNOSELSKAYA ILF3 TARGETS UP | 38 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHU CMV ALL UP | 120 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHANG ANTIVIRAL RESPONSE TO RIBAVIRIN UP | 30 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JACKSON DNMT1 TARGETS UP | 77 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHU CMV 24 HR UP | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BROWNE HCMV INFECTION 6HR UP | 71 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 8小时 | 47 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HELLER SILENCED BY METHYLATION UP | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WALLACE PROSTATE CANCER RACE UP | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Moserle IFNA响应 | 31 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HONMA DOCETAXEL RESISTANCE | 34 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在肿瘤血管生成期间沉默的Hellebrekers | 80 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHANG INTERFERON RESPONSE | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HAN SATB1 TARGETS DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JISON SICKLE CELL DISEASE UP | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UROSEVIC RESPONSE TO IMIQUIMOD | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gutierrez多发性骨髓瘤 | 35 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHIARETTI T ALL REFRACTORY TO THERAPY | 30 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHANDRAN METASTASIS DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
突变的TP53 DN的Stambolsky靶标 | 50 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CERIBELLI PROMOTERS INACTIVE AND BOUND BY NFY | 44 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CERIBELLI GENES INACTIVE AND BOUND BY NFY | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AZARE NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY STAT3 UP | 121 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PEDRIOLI MIR31 TARGETS DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FOSTER KDM1A TARGETS UP | 266 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOSCO INTERFERON INDUCED ANTIVIRAL MODULE | 78 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hecker IFNB1目标 | 95 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |