基因页面:ASTN1

总结吗?
GeneID 460年
象征 ASTN1
同义词 ASTN
描述 astrotactin 1
参考 MIM: 600904|HGNC: HGNC: 773|运用:ENSG00000152092|HPRD: 09019|织女:OTTHUMG00000035041
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 1 q25.2
夏洛克假定值 0.279
胎儿β -0.894
DMG 1(#研究)
eGene 额叶皮质BA9
支持 结构可塑性
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 2
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg12268575 1 177133536 ASTN1 6.18平台以及 -0.018 9.22 e - DMG: Jaffe_2016
cg00319545 1 177133737 ASTN1 1.92 e-8 -0.009 6.76 e-6 DMG: Jaffe_2016


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZFHX4 0.83 0.70
ZNF521 0.81 0.54
IL28RA 0.81 0.45
SH2D3A 0.80 0.40
FAM83G 0.80 0.56
FOXP2基因 0.80 0.58
SCML4 0.79 0.33
碱性 0.76 0.42
CACNA2D2 0.75 0.69
NKD2 0.75 0.56
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
TMEM54 -0.29 -0.46
COX4I2 -0.28 -0.50
C5orf53 -0.28 -0.48
COPZ2 -0.28 -0.50
宽带运 -0.27 -0.44
AF347015.31 -0.27 -0.54
CHPT1 -0.27 -0.43
MYL3 -0.27 -0.56
CA4 -0.26 -0.45
HLA-F -0.26 -0.38

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005515 蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007158 神经元的附着力 NAS 神经元(术语层面:5) - - - - - -
去:0007155 细胞粘附 国际能源机构 - - - - - -
去:0016477 细胞迁移 NAS - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005575 cellular_component ND - - - - - -
去:0016020 膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0016021 不可或缺的膜 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
BENPORATH SUZ12目标 1038年 678年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH速度的目标 1062年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH ES与H3K27ME3 1118年 744年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH PRC2目标 652年 441年 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 1237年 837年 所有SZGR 2.0基因通路
近藤H3K27ME3前列腺癌 196年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
黄成人组织干细胞模块 721年 492年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 590年 403年 所有SZGR 2.0基因通路
肿瘤抑制SMAD1和穿SMAD5 DN 157年 106年 所有SZGR 2.0基因通路
GOBERT少突细胞分化DN 1080年 713年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-141/200a 983年 990年 1、m8 hsa - mir - 141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
hsa - mir - 200 a UAACACUGUCUGGUAACGAUGU
mir - 182 2845年 2851年 1 hsa - mir - 182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
mir - 335 2926年 2932年 1 hsa - mir - 335大脑 UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUGU
mir - 96 2845年 2851年 1 hsa - mir - 96大脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC