基因page:MYC
Summary?
基因 | 4609 |
象征 | MYC |
同义词 | mrtl | mycc | bhlhe39 | c-myc |
Description | V-Myc禽骨质体病毒病毒性癌基因同源 |
Reference | MIM:190080|HGNC:HGNC:7553|Ensembl:ENSG00000136997|HPRD:01818|Vega:Otthumg00000128475 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
Map location | 8q24.21 |
Pascal P值 | 3.014E-4 |
胎儿β | 2.211 |
DMG | 1(# studies) |
主持人 | Myers' cis & trans |
基因in Data Sources
基因set name | 基因组方法 | Description | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | High-throughput literature-search | Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
表达 | Meta-analysis of gene expression | p价值:1.408 | |
Literature | High-throughput literature-search | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias | 点击显示详细信息 |
Network | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | Contribution to shortest path in PPI network: 0.0359 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
probe | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | Beta (dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG16100135 | 8 | 128750586 | MYC | 3.48e-9 | -0.02 | 2.27E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs10094528 | CHR8 | 9740328 | MYC | 4609 | 0.08 | 反式 | ||
RS7107744 | Chr11 | 128268778 | MYC | 4609 | 0.1 | 反式 | ||
RS837543 | CHR16 | 55500411 | MYC | 4609 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MYC_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
tsku | 0.69 | 0.71 |
C3orf54 | 0.64 | 0.71 |
TTLL12 | 0.64 | 0.62 |
Neurod2 | 0.64 | 0.59 |
TP53I11 | 0.63 | 0.67 |
PTPN2 | 0.63 | 0.64 |
nkain1 | 0.63 | 0.68 |
NXPH3 | 0.63 | 0.47 |
DBN1 | 0.62 | 0.66 |
impdh2 | 0.62 | 0.69 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FBXO2 | -0.47 | -0.68 |
HLA-F | -0.46 | -0.66 |
AIFM3 | -0.46 | -0.64 |
C5orf53 | -0.45 | -0.63 |
ARHGAP22 | -0.45 | -0.65 |
LDHD | -0.45 | -0.63 |
aldoc | -0.44 | -0.62 |
克鲁 | -0.44 | -0.63 |
HEPN1 | -0.44 | -0.62 |
CSRP1 | -0.44 | -0.69 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | nas | 2834731 | |
GO:0003700 | 反式cription factor activity | TAS | 9924025 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 9308237|9708738|10597290 |12706874 |
|
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001836 | 从线粒体释放细胞色素C | IEA | - | |
GO:0001783 | B细胞凋亡 | IEA | - | |
去:0006309 | DNA fragmentation during apoptosis | IEA | - | |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | nas | 2834731 | |
去:0006357 | regulation of transcription from RNA polymerase II promoter | TAS | 9924025 | |
去:0007050 | cell cycle arrest | TAS | 10962037 | |
GO:0008284 | 细胞增殖的阳性调节 | 艾达 | 15994933 | |
去:0008629 | 通过细胞内信号诱导凋亡 | IEA | - | |
去:0008633 | activation of pro-apoptotic gene products | IEA | - | |
去:0008634 | 生存基因产物表达的负调节 | IEA | - | |
GO:0006919 | caspase激活 | IEA | - | |
去:0006879 | 细胞铁离子稳态 | TAS | 9924025 | |
去:0009314 | response to radiation | IEA | - | |
GO:0042981 | 调节凋亡 | IEA | - | |
GO:0016485 | 蛋白质加工 | IEA | - | |
GO:0042474 | 中耳形态发生 | IEA | - | |
GO:0043473 | pigmentation | IEA | - | |
GO:0043279 | 对生物碱的反应 | IEA | - | |
GO:0050910 | detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of sound | IEA | - | |
GO:0048705 | 骨骼系统形态发生 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0005819 | 主轴 | IEA | - | |
GO:0005634 | nucleus | 艾达 | 15994933 | |
GO:0005634 | nucleus | nas | 2834731 | |
GO:0016604 | 核体 | IEA | - |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
动作 | PS1TP5BP1 | Actin,Beta | 共纯化 | Biogrid | 11839798 |
actl6a | actl6 |arp4 |BAF53A |INO80K |MGC5382 | actin-like 6A | - | HPRD,BioGRID | 11839798 |
Arhgef2 | DKFZP547L106 |DKFZP547P1516 |GEF |GEF-H1 |gefh1 |KIAA0651 |LFP40 |P40 | rho/rac guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
BCL2 | Bcl-2 | B细胞CLL/淋巴瘤2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共定位 |
Biogrid | 15210690 |
BRCA1 | Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 | 乳腺癌1,早发 | - | HPRD,BioGRID | 9788437 |
BRCA1 | Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 | 乳腺癌1,早发 | BRCA1与C-MYC(一种与肿瘤发生,胚胎发育和凋亡有关的原始癌基因)的关联,抑制了其在细胞中的转录和转化活性。 | BIND | 9788437 |
CCNT1 | CCNT | CYCT1 | cyclin T1 | - | HPRD,BioGRID | 12944920 |
CD6 | FLJ44171 | TP120 | CD6 molecule | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10899308 |
CDC6 | cdc18l |HSCDC18 |HSCDC6 | 细胞分裂周期6同源物(S. cerevisiae) | - | HPRD,BioGRID | 10899308 |
CDK4 | CMM3 |MGC14458 |PSK-J3 | 细胞周期蛋白依赖性激酶4 | MYC(C-MYC)与CDK4启动子相互作用。 | BIND | 12857727 |
CDK9 | C-2K |cdc2l4 |CTK1 |pitalre |塔 | 细胞周期蛋白依赖性激酶9 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12944920 |
CDKN1A | CAP20 | CDKN1 | CIP1 | MDA-6 | P21 | SDI1 | WAF1 | p21CIP1 | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1a(P21,CIP1) | Myc interacts with CDKN1A promoter. | BIND | 15780936 |
CDKN1A | CAP20 | CDKN1 | CIP1 | MDA-6 | P21 | SDI1 | WAF1 | p21CIP1 | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1a(P21,CIP1) | c-Myc binds the proximal region of the p21Cip1 promoter. | BIND | 15084259 |
CDKN1A | CAP20 | CDKN1 | CIP1 | MDA-6 | P21 | SDI1 | WAF1 | p21CIP1 | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1a(P21,CIP1) | C-MYC与P21WAF1启动子相互作用。 | BIND | 15856024 |
CDKN2A | ARF | CDK4I | CDKN2 | CMM2 | INK4 | INK4a | MLM | MTS1 | TP16 | p14 | p14ARF | p16 | p16INK4 | p16INK4a | p19 | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2a(黑色素瘤,p16,抑制CDK4) | p14ARF interacts with c-Myc. | BIND | 15361884 |
宿雾 | C/EBP-Alpha |CEBP | CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),α | - | HPRD,BioGRID | 12873812 |
CEBPB | C/EBP-beta | CRP2 | IL6DBP | LAP | MGC32080 | NF-IL6 | TCF5 | CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta | - | HPRD,BioGRID | 12873812 |
楚克 | ikbka |ikk-alpha |ikk1 |ikka |nfkbika |TCF16 | 保守的螺旋环螺旋无处不在激酶 | IKK-Alpha与C-MYC启动子相互作用。 | BIND | 15808510 |
CSNK2A1 | CK2A1 | CKII | 酪蛋白激酶2,α1多肽 | CK2与C-MYC相互作用并磷酸化。这种相互作用是在小鼠CK2和人C-MYC之间证明的相互作用上建模的。 | BIND | 12149649 |
DDB2 | DDBB |FLJ34321 |UV-DDB2 | 损伤特异性DNA结合蛋白2,48KDA | C-MYC与DDB2启动子相互作用。 | BIND | 15856024 |
DDX24 | - | 死亡(ASP-GLU-ALA-ASP)盒多肽24 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
DNMT3A | DNMT3A2 | M.HsaIIIA | DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 alpha | MYC与DMNT3A互动。 | BIND | 15616584 |
DNMT3A | DNMT3A2 | M.HsaIIIA | DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 alpha | - | HPRD,BioGRID | 15616584 |
E2F1 | E2F-1 |RBAP1 |rbbp3 |rbp3 | E2F transcription factor 1 | E2F-1与MYC基因P2启动子区域相互作用。 | BIND | 7892279 |
E2F4 | E2F-4 | E2F转录因子4,P107/P130结合 | E2F-4与MYC基因P2启动子区域相互作用。 | BIND | 7892279 |
E2F5 | E2F-5 | E2F transcription factor 5, p130-binding | E2F-5与MYC基因P2启动子区域相互作用。 | BIND | 7892279 |
eftud2 | DKFZP686E24196 |FLJ44695 |KIAA0031 |SNRP116 |SNU114 |U5-116KD | 伸长因子TU GTP结合结构域包含2 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
EP400 | CAGH32 |DKFZP434I225 |FLJ42018 |FLJ45115 |P400 |TNRC12 | E1A binding protein p400 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 11509179 |
ESR1 | DKFZp686N23123 | ER | ESR | ESRA | Era | NR3A1 | estrogen receptor 1 | ER-Alpha与C-MYC启动子相互作用。 | BIND | 15808510 |
exoc4 | MGC27170 |rec8 |sec8 |sec8l1 |Sec8p | exocyst complex component 4 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
法奇 | FLJ10719 | KIAA1794 | Fanconi贫血,互补小组I | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
FBXW7 | 前|cdc4 |DKFZP686F23254 |fbw6 |fbw7 |FBX30 |FBXO30 |fbxw6 |FLJ16457 |SEL-10 | SEL10 | F-box和WD重复域包含7 | FBW7-Alpha与C-MYC相互作用。 | BIND | 16023596 |
FBXW7 | 前|cdc4 |DKFZP686F23254 |fbw6 |fbw7 |FBX30 |FBXO30 |fbxw6 |FLJ16457 |SEL-10 | SEL10 | F-box和WD重复域包含7 | FBW7-BETA与C-MYC相互作用。 | BIND | 16023596 |
FUBP1 | FBP | FUBP | 上游元素(保险丝)结合蛋白1 | FBP与保险丝相互作用。 | BIND | 15502847 |
GCN1L1 | GCN1 |GCN1L |KIAA0219 | GCN1氨基酸合成1类样1(酵母)的一般控制 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
GEMIN4 | DKFZP434B131 |DKFZP434D174 |HC56 |HCAP1 |HHRF-1 |P97 | gem (nuclear organelle) associated protein 4 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
GTF2B | TF2B | TFIIB | 通用转录因子IIB | 重构的复合物 | Biogrid | 12660246 |
GTF2F1 | BTF4 |Rap74 |TF2F1 |tfiif | 通用转录因子IIF,多肽1,74KDA | - | HPRD,BioGRID | 8755740 |
gtf2i | BAP-135 | BAP135 | BTKAP1 | DIWS | FLJ38776 | FLJ56355 | IB291 | SPIN | TFII-I | WBS | WBSCR6 | 一般转录因子II,I | - | HPRD,BioGRID | 8377829 |
GTF3C3 | tfiiic102 |tfiiicgamma |TFIIIC2-102 | 一般转录因子IIIC,多肽3,102KDA | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
heatr1 | BAP28 | FLJ10359 | MGC72083 | HEAT repeat containing 1 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
hnrnpc | C1 | C2 | HNRNP | HNRPC | MGC104306 | MGC105117 | MGC117353 | MGC131677 | SNRPC | 异质性核核糖核蛋白C(C1/C2) | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
HSP90AA1 | FLJ31884 |HSP86 |HSP89A |HSP90A |HSP90N |HSPC1 |HSPCA |HSPCAL1 |HSPCAL4 |HSPN | Hsp89 | Hsp90 | LAP2 | heat shock protein 90kDa alpha (cytosolic), class A member 1 | - | HPRD,BioGRID | 12644583 |
kat2a | GCN5 |GCN5L2 |MGC102791 |PCAF-B |HGCN5 | K(赖氨酸)乙酰转移酶2A | c-Myc interacts with GNC5L. | BIND | 12660246 |
kat2a | GCN5 |GCN5L2 |MGC102791 |PCAF-B |HGCN5 | K(赖氨酸)乙酰转移酶2A | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10611234 |
kat2b | CAF |P |P/CAF |PCAF | K(赖氨酸)乙酰转移酶2B | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 重构的复合物 |
Biogrid | 12660246 |
Kat5 | esa1 |htatip |htatip1 |plip |提示|TIP60 |CPLA2 | K(赖氨酸)乙酰转移酶5 | - | HPRD,BioGRID | 12776177 |
KIAA0859 | 5630401D24RIK |CGI-01 |FLJ10310 | KIAA0859 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
KIAA1967 | DBC-1 | DBC1 | KIAA1967 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
MAP2K1 | mapkk1 |MEK1 |MKK1 |prkmk1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶1 | - | HPRD | 7957875 |
MAPK1 | ERK | ERK2 | ERT1 | MAPK2 | P42MAPK | PRKM1 | PRKM2 | p38 | p40 | p41 | p41mapk | 有丝分裂原激活的蛋白激酶1 | 生化活动 重构的复合物 |
Biogrid | 7957875|9207092 |15210690 |
MAPK3 | ERK1 | HS44KDAP | HUMKER1A | MGC20180 | P44ERK1 | P44MAPK | PRKM3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶3 | 重构的复合物 | Biogrid | 15210690 |
MAPK3 | ERK1 | HS44KDAP | HUMKER1A | MGC20180 | P44ERK1 | P44MAPK | PRKM3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶3 | ERK1与C-MYC相互作用并磷酸化。 | BIND | 9155018 |
MAPK7 | BMK1 |ERK4 |ERK5 |PRKM7 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶7 | - | HPRD | 9461566 |
MAPK8 | jnk |JNK1 |JNK1A2 |JNK21B1/2 |prkm8 |SAPK1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶8 | - | HPRD,BioGRID | 10551811 |
最大限度 | MGC10775 | MGC11225 | MGC18164 | MGC34679 | MGC36767 | bHLHd4 | orf1 | MYC associated factor X | MYC与Max互动。这种相互作用是根据来自未指定来源的人MYC和MAX之间的相互作用建模的。 | BIND | 12584560 |
最大限度 | MGC10775 | MGC11225 | MGC18164 | MGC34679 | MGC36767 | bHLHd4 | orf1 | MYC associated factor X | Affinity Capture-MS 亲和力捕获 - 韦斯特恩 体外 体内 重构的复合物 Two-hybrid |
Biogrid | 2006410|9528857 |9708738|10229200 |10319872|10593926 |10611234|12391307 |12584560|17353931 |
最大限度 | MGC10775 | MGC11225 | MGC18164 | MGC34679 | MGC36767 | bHLHd4 | orf1 | MYC associated factor X | - | HPRD | 2006410|10229200 |
MCM7 | CDABP0042 | CDC47 | MCM2 | P1.1-MCM3 | P1CDC47 | P85MCM | PNAS-146 | 微型鲜体维护复杂组件7 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
Med12 | CAGH45 |霍普|KIAA0192 |OPA1 |TNRC11 |陷阱230 | 中介复杂单元12 | 重构的复合物 | Biogrid | 12660246 |
Med14 | CRSP150 |CRSP2 |CSRP |CXORF4 |滴150 |exlm1 |MGC104513 |RGR1 |陷阱170 | 中介复合体亚基14 | 重构的复合物 | Biogrid | 12660246 |
Mina | DKFZP762O1912 |FLJ14393 |mdig |Mina53 |No52 | MYC诱导的核抗原 | - | HPRD | 12091391 |
mirhg1 | C13orf25 |FLJ14178 |MGC126270 |mihg1 |mirh1 |NCRNA00048 | microRNA宿主基因1(非蛋白质编码) | MYC与miR-17集群基因座互动 | BIND | 15944709 |
mkln1 | FLJ11162 | TWA2 | 麝香素1,含有kelch图案的细胞内介体 | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
MLH1 | 可口可乐2 |FCC2 |HNPCC |HNPCC2 |MGC5172 |HMLH1 | MUTL同源物1,结肠癌,非型型2型(大肠杆菌) | - | HPRD,BioGRID | 12584560 |
MLH1 | 可口可乐2 |FCC2 |HNPCC |HNPCC2 |MGC5172 |HMLH1 | MUTL同源物1,结肠癌,非型型2型(大肠杆菌) | MLH1与MYC互动。 | BIND | 12584560 |
MSH2 | 可口可乐|FCC1 |HNPCC |HNPCC1 |LCFS2 | MUTS同源物2,结肠癌,非型型1型(大肠杆菌) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12584560 |
MSH6 | GTBP |HNPCC5 |HSAP | MUTS同源物6(大肠杆菌) | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
MXD1 | 疯狂|Mad1 |MGC104659 | 最大二聚化蛋白1 | - | HPRD,BioGRID | 11602341 |
mybbp1a | FLJ37886 |P160 |pap2 | MYB结合蛋白(P160)1A | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
mycbp | AMY-1 | C-MYC结合蛋白 | - | HPRD,BioGRID | 9797456 |
mycbp2 | DKFZP686M08244 |FLJ10106 |FLJ13826 |FLJ21597 |FLJ21646 |KIAA0916 |帕姆 | MYC结合蛋白2 | MYC与PAM互动。 | BIND | 9689053 |
mycbp2 | DKFZP686M08244 |FLJ10106 |FLJ13826 |FLJ21597 |FLJ21646 |KIAA0916 |帕姆 | MYC结合蛋白2 | - | HPRD,BioGRID | 9689053 |
myo1b | mor1 | myosin IB | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
NCL | C23 | FLJ45706 | 核苷 | Ncl (nucleolin) interacts with Myc (c-Myc). | BIND | 15674325 |
NCOA3 | Actr |AIB-1 |AIB1 |CAGH16 |CTG26 |kat13b |MGC141848 |Rac3 |src3 |TNRC14 | TNRC16 | TRAM-1 | pCIP | 核受体共激活因子3 | AIB1与C-MYC启动子相互作用。 | BIND | 15808510 |
NFYB | CBF-A | CBF-B | HAP3 | NF-YB | 核转录因子y,beta | - | HPRD,BioGRID | 11282029 |
NFYB | CBF-A | CBF-B | HAP3 | NF-YB | 核转录因子y,beta | MYC与NF-YB互动。这种相互作用是在人MYC和小鼠NF-YB之间的相互作用上建模的 | BIND | 11282029 |
NFYC | CBF-C |CBFC |DKFZP667G242 |FLJ45775 |H1TF2A |hap5 |HSM |NF-YC | 核转录因子Y,伽马 | MYC与NF-YC互动。 | BIND | 11282029 |
NFYC | CBF-C |CBFC |DKFZP667G242 |FLJ45775 |H1TF2A |hap5 |HSM |NF-YC | 核转录因子Y,伽马 | - | HPRD,BioGRID | 10446203 |
NMI | - | N-myc (and STAT) interactor | - | HPRD | 8668343 |
NMI | - | N-myc (and STAT) interactor | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 11916966 |
NMI | - | N-myc (and STAT) interactor | Myc interacts with Nmi | BIND | 11916966 |
NPM1 | B23 |MGC104254 |NPM | 核素蛋白(核酸磷酸蛋白B23,numatrin) | MYC与NPM1(B23)互动 | BIND | 15944709 |
NUP205 | C7orf14 | 核孔蛋白205KDA | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
NUP93 | KIAA0095 | MGC21106 | 核孔蛋白93KDA | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
ORC2L | ORC2 | 起源识别综合体,亚基2样(酵母) | OCR2与C-MYC起源相互作用。 | BIND | 15910003 |
PARP10 | FLJ14464 | 聚(ADP-核糖)聚合酶家族,成员10 | PARP10与MYC(C-MYC)互动 | BIND | 15674325 |
pDS5A | DKFZP686B19246 |FLJ41012 |KIAA0648 |MGC131948 |MGC161503 |Pig54 |SCC-112 | PDS5,凝聚力维护的调节剂,同源物A(S. cerevisiae) | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
pFDN5 | MGC5329 | MGC71907 | MM-1 | MM1 | PFD5 | prefoldin subunit 5 | 重构的复合物 Two-hybrid |
Biogrid | 9792694|11567024 |
PIAS2 | MGC102682 |Miz1 |piasx |piasx-alpha |piasx-beta |siz2 |zmiz4 |Miz | 活化统计的蛋白质抑制剂2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11283613 |
pMAIP1 | APR |noxa | phorbol-12-催眠13-乙酸盐诱导的蛋白质1 | C-MYC与NOXA启动子相互作用。 | BIND | 15856024 |
PML | myl |pp8675 |RNF71 |TRIM19 | Promyelocytic白血病 | MYC与PML互动。这种相互作用是在小鼠MYC和人PML之间证明的相互作用上建模的。 | BIND | 15735755 |
pOLE | DKFZP434F222 |FLJ21434 |极点1 | 聚合酶(指向DNA),epsilon | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
polr2a | MGC75453 | POLR2 | POLRA | RPB1 | RPBh1 | RPO2 | RPOL2 | RpIILS | hRPB220 | hsRPB1 | 聚合酶(RNA)II(定向DNA)多肽A,220KDA | POL II与C-MYC启动子相互作用。 | BIND | 15808510 |
polr2a | MGC75453 | POLR2 | POLRA | RPB1 | RPBh1 | RPO2 | RPOL2 | RpIILS | hRPB220 | hsRPB1 | 聚合酶(RNA)II(定向DNA)多肽A,220KDA | 重构的复合物 | Biogrid | 12660246 |
pRPF8 | HPRP8 | PRP8 | PRPC8 | RP13 | PRP8前MRNA处理因子8同源物(S. cerevisiae) | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
RAF1 | 克拉夫|NS5 |RAF-1 |C-Raf | V-RAF-1鼠白血病病毒癌基因同源1 | - | HPRD,BioGRID | 9315742 |
RAGE | mok |rage1 | renal tumor antigen | - | HPRD,BioGRID | 10421840 |
RB1 | OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 | 视网膜细胞瘤1 | - | HPRD,BioGRID | 7838535 |
RBL1 | CP107 | MGC40006 | PRB1 | p107 | 视网膜母细胞瘤状1(p107) | - | HPRD,BioGRID | 8076603 |
Rela | MGC131774 | NFKB3 | p65 | v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A (avian) | - | HPRD,BioGRID | 12027803 |
RIBIN | - | rRNA启动子结合蛋白 | C-MYC与rDNA相互作用。 | BIND | 15723054 |
RRM2B | DKFZP686M05248 |MGC102856 |MGC42116 |p53r2 | 核糖核苷酸还原酶M2 B(TP53诱导) | C-MYC与p53R2启动子相互作用。 | BIND | 15856024 |
ruvbl1 | ECP54 |ino80h |NMP238 |Pontin |Pontin52 |RVB1 |tih1 |TIP49 |TIP49A | ruvb样1(大肠杆菌) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 重构的复合物 |
Biogrid | 11509179|11839798 |
ruvbl2 | CGI-46 |ECP51 |ino80j |reptin |RVB2 |tih2 |TIP48 |TIP49B | RuvB-like 2 (E. coli) | 共纯化 | Biogrid | 11839798 |
SAP130 | FLJ12761 | Sin3A-associated protein, 130kDa | 共纯化 重构的复合物 |
Biogrid | 12660246 |
SMAD2 | JV18 | JV18-1 | MADH2 | MADR2 | MGC22139 | MGC34440 | hMAD-2 | hSMAD2 | SMAD family member 2 | - | HPRD,BioGRID | 11804592 |
SMAD3 | DKFZP586N0721 |DKFZP686J10186 |HSPC193 |HST17436 |JV15-2 |madh3 |MGC60396 | SMAD family member 3 | - | HPRD,BioGRID | 11804592 |
Smarca4 | BAF190 |BRG1 |FLJ39786 |SNF2 |snf2-beta |snf2l4 |SNF2LB |swi2 |HSNF2B | SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 4 | Affinity Capture-MS 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 11839798|17353931 |
Smarcb1 | BAF47 | INI1 | RDT | SNF5 | SNF5L1 | Sfh1p | Snr1 | hSNFS | SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily b, member 1 | - | HPRD,BioGRID | 10319872 |
SNRNP200 | ASCC3L1 |brr2 |Helic2 |U5-200KD | small nuclear ribonucleoprotein 200kDa (U5) | Affinity Capture-MS | Biogrid | 17353931 |
SP1 | - | SP1转录因子 | MYC与SP1互动。这种相互作用是建立在小鼠MYC和人SP-1之间的相互作用上的模型。 | BIND | 11274368 |
SP1 | - | SP1转录因子 | SP1与MYC互动。 | BIND | 15780936 |
SP1 | - | SP1转录因子 | - | HPRD,BioGRID | 11274368 |
意大利面9 | FLJ13450 |FLJ14006 |FLJ26141 |FLJ34602 |HLC4 |JLP |KIAA0516 |MGC117291 |MGC14967 |MGC74461 | PHET | PIG6 | 精子相关的抗原9 | - | HPRD | 12391307 |
SUPT3H | spt3 |SPT3L | Ty 3同源物的抑制剂(S. cerevisiae) | - | HPRD,BioGRID | 12660246 |
tada2l | ADA2 |ada2a |FLJ12705 |KL04P |hada2 | 反式criptional adaptor 2 (ADA2 homolog, yeast)-like | 共纯化 重构的复合物 |
Biogrid | 12660246 |
tada3l | ADA3 | FLJ20221 | FLJ21329 | hADA3 | 反式criptional adaptor 3 (NGG1 homolog, yeast)-like | 共纯化 | Biogrid | 12660246 |
TAF10 | taf2a |taf2h |TAFII30 | TAF10 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 30kDa | 共纯化 | Biogrid | 12660246 |
TAF12 | TAF2J | TAFII20 | TAF12 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 20kDa | 共纯化 | Biogrid | 12660246 |
TAF1A | MGC:17061 | RAFI48 | SL1 | TAFI48 | TATA盒结合蛋白(真沸点)相关的因素,RNA polymerase I, A, 48kDa | TAFI48 interacts with c-Myc. | BIND | 15723054 |
TAF1B | MGC:9349 |raf1b |Rafi63 |SL1 |TAFI63 | TATA盒结合蛋白(真沸点)相关的因素,RNA polymerase I, B, 63kDa | TAFI63interacts with c-Myc. | BIND | 15723054 |
TAF1C | MGC:39976 |SL1 |TAFI110 |TAFI95 | TATA盒结合蛋白(TBP)相关因子,RNA聚合酶I,C,110KDA | TAFI110与C-MYC相互作用。 | BIND | 15723054 |
TAF5 | TAF2D | TAFII100 | TAF5 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 100kDa | 重构的复合物 | Biogrid | 12660246 |
TAF5L | PAF65B | TAF5样RNA聚合酶II,P300/CBP相关因子(PCAF)相关因子,65KDA | 共纯化 | Biogrid | 12660246 |
taf6l | FLJ11136 | MGC4288 | PAF65A | TAF6样RNA聚合酶II,P300/CBP相关因子(PCAF)相关因子,65KDA | 共纯化 | Biogrid | 12660246 |
TAF9 | AD-004 | AK6 | CGI-137 | CINAP | CIP | MGC1603 | MGC3647 | MGC5067 | MGC:1603 | MGC:3647 | MGC:5067 | TAF2G | TAFII31 | TAFII32 | TAFIID32 | TAF9 RNA聚合酶II,TATA盒结合蛋白(TBP)相关因子,32KDA | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 重构的复合物 |
Biogrid | 12660246 |
TBP | gtf2d |GTF2D1 |MGC117320 |MGC126054 |MGC126055 |SCA17 |tfiid | 塔塔盒结合蛋白 | 重构的复合物 | Biogrid | 8755740 |
TBP | gtf2d |GTF2D1 |MGC117320 |MGC126054 |MGC126055 |SCA17 |tfiid | 塔塔盒结合蛋白 | TBP与C-MYC相互作用。 | BIND | 15723054 |
TFAP2A | AP-2 |ap-2alpha |AP2TF |bofs |TFAP2 | 转录因子AP-2α(激活增强子结合蛋白2α) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 7729426 |
TFAP2B | AP-2B |AP2-B |MGC21381 | 转录因子AP-2β(激活增强子结合蛋白2β) | - | HPRD | 7729426 |
提亚姆1 | FLJ36302 | T细胞淋巴瘤侵袭和转移1 | - | HPRD,BioGRID | 12446731 |
TP73 | p73 | tumor protein p73 | - | HPRD,BioGRID | 12080043 |
TRRAP | FLJ10671 |PAF350/400 |PAF400 |Staf40 |tr-ap |Tra1 | 转化/转录结构域相关蛋白 | - | HPRD,BioGRID | 9708738 |
TRRAP | FLJ10671 |PAF350/400 |PAF400 |Staf40 |tr-ap |Tra1 | 转化/转录结构域相关蛋白 | c-Myc interacts with TRRAP. | BIND | 12660246 |
tuba1a | B-ALPHA-1 | FLJ25113 | LIS3 | TUBA3 | tubulin, alpha 1a | - | HPRD | 7651436 |
tuba1b | K-Alpha-1 | tubulin, alpha 1b | - | HPRD | 7651436 |
tuba3c | TUBA2 | bA408E5.3 | tubulin, alpha 3c | - | HPRD | 7651436 |
tuba4a | FLJ30169 |H2-Alpha |tuba1 | tubulin, alpha 4a | - | HPRD | 7651436 |
tuba8 | TUBAL2 | 微管蛋白,α8 | - | HPRD | 7651436 |
XRCC5 | FLJ39089 |karp-1 |karp1 |ku80 |kub2 |ku86 |nfiv | X射线修复补充中国仓鼠细胞5(双链破裂的重新加入)中的缺陷修复 | KU80与C-MYC起源相互作用。 | BIND | 15910003 |
yy1 | DELTA | INO80S | NF-E1 | UCRBP | YIN-YANG-1 | yy1反式cription factor | - | HPRD,BioGRID | 8266081 |
ZBTB17 | Miz-1 |Znf151 |Znf60 |PHZ-67 | zinc finger and BTB domain containing 17 | - | HPRD,BioGRID | 9312026 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-34b | 138 | 144 | M8 | hsa-miR-34b | uaggcagugucauagcugauug |
miR-496 | 281 | 287 | 1a | hsa-miR-496 | Auuacauggccaaucuc |