基因页：MYD88

概括?
基因ID 4615
Symbol MYD88
同义词 MYD88D
描述 髓样分化主要反应88
参考 MIM：602170|HGNC:HGNC:7562|Ensembl:ENSG00000172936|HPRD:03703|Vega：Otthumg00000131083
基因type protein-coding
地图位置 3p22
Pascal P值 0.205
Fetal beta 2.387
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统搜索PubMed的基因co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.006
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
RS2070396 chr21 30878751 MYD88 4615 0.12 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
SDC3 0.73 0.69
SLC7A5 0.72 0.69
TBC1D2B 0.71 0.73
RAB3IL1 0.70 0.71
DENND2A 0.69 0.66
ABLIM1 0.67 0.63
ITGA3 0.67 0.61
PCDHGB8P 0.66 0.65
KIAA1539 0.66 0.61
cuedc1 0.66 0.66
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
SCRG1 -0.53 -0.40
AL050337.1 -0.51 -0.42
COX7B -0.51 -0.49
SYCP3 -0.50 -0.42
MT3 -0.49 -0.36
AL138743.2 -0.49 -0.37
C1orf54 -0.49 -0.42
UQCRB -0.49 -0.48
MYL3 -0.48 -0.40
LY96 -0.48 -0.43

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0004888 transmembrane receptor activity IEA -
GO:0005123 death receptor binding 塔斯 9374458
GO:0005515 protein binding 新闻学会 10383454|10880445|11544529
|16286016|16365431
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0002755 MyD88依赖性电话样受体信号通路 IEA -
GO:0002238 对真菌起源分子的反应 IEA -
GO:0016064 immunoglobulin mediated immune response IEA -
GO:0009615 对病毒的反应 IEA -
GO:0006954 inflammatory response IEA -
GO:0051092 positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity IEA -
GO：0032496 response to lipopolysaccharide IEA -
GO:0032760 肿瘤坏死因子的阳性调节 IEA -
GO:0031663 脂多糖介导的信号通路 IEA -
GO:0043123 positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade IEP 12761501
GO:0045087 innate immune response IEA -
GO:0045080 positive regulation of chemokine biosynthetic process IEA -
GO：0045351 type I interferon biosynthetic process IEA -
去：0046330 positive regulation of JNK cascade IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005874 microtubule IEA -
GO:0005737 细胞质 IEA -
GO:0031315 extrinsic to mitochondrial outer membrane IEA -
GO:0031224 intrinsic to membrane IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
FADD Gig3 |MGC8528 |Mort1 FAS（TNFRSF6）通过死亡域关联 - HPRD，Biogrid 11828002
IL1R1 CD121A | D2S1473 | IL-1R-alpha | IL1R | IL1RA | P80 interleukin 1 receptor, type I Affinity Capture-Western BioGRID 10854325
IL1RAP C3orf13 | FLJ37788 | IL-1RAcP | IL1R3 interleukin 1 receptor accessory protein - HPRD，Biogrid 11880380
irak1 IRAK | pelle interleukin-1 receptor-associated kinase 1 IRAK does not interact with MyD88, whilst the kinase inactive mutant IRAK[Lys239Ser] does interact. BIND 10383454
irak1 IRAK | pelle interleukin-1 receptor-associated kinase 1 - HPRD 10854325
irak1 IRAK | pelle interleukin-1 receptor-associated kinase 1 Affinity Capture-Western BioGRID 10383454|11976320
irak2 IRAK-2 | MGC150550 interleukin-1 receptor-associated kinase 2 IRAK-2 interacts with MyD88. BIND 10383454
irak2 IRAK-2 | MGC150550 interleukin-1 receptor-associated kinase 2 - HPRD，Biogrid 9374458
irak3 ASRT5 |irak-m |irakm interleukin-1 receptor-associated kinase 3 IRAK-M interacts with MyD88. BIND 10383454
irak3 ASRT5 |irak-m |irakm interleukin-1 receptor-associated kinase 3 Affinity Capture-Western BioGRID 10383454
irak4 IPD1 |NY-REN-64 |Ren64 interleukin-1 receptor-associated kinase 4 - HPRD，Biogrid 11960013
IRF7 IRF-7H |IRF7A 干扰素调节因子7 IRF7interacts with MyD88. BIND 15361868
PELI2 - pellino homolog 2 (Drosophila) - HPRD 12860405
Rac1 MGC111543 |Mig5 |TC-25 |P21-RAC1 ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 (rho family, small GTP binding protein Rac1) Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex		 BioGRID 11416133
SPOP tef2 speckle-type POZ protein 两个杂交 BioGRID 16189514
TIRAP FLJ42305 | Mal | wyatt Toll-Interleukin 1受体（TIR）结构域含有衔接蛋白 - HPRD，Biogrid 11544529
TLR2 CD282 |til4 Toll样受体2 两个杂交 BioGRID 15107846
TLR3 CD283 Toll样受体3 - HPRD，Biogrid 12646618
TLR4 ARMD10 | CD284 | TOLL | hToll Toll样受体4 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 10952994|12646618
|15107846
TLR4 ARMD10 | CD284 | TOLL | hToll Toll样受体4 - HPRD 10952994|11743586
TLR5 FLJ10052 |MGC126430 |MGC126431 |sleb1 |til3 Toll样受体5 两个杂交 BioGRID 15107846
TLR9 CD289 Toll样受体9 两个杂交 BioGRID 15107846


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
kegg凋亡 88 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TOLL LIKE RECEPTOR SIGNALING PATHWAY 102 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Leishmania感染 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA GSK3 PATHWAY 27 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA NTHI PATHWAY 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NFKB途径 23 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL1R途径 33 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA TOLL PATHWAY 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL1途径 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P75 NTR PATHWAY 69 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TOLL内源性途径 25 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P75NTR招募信号复合物 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P75NTR信号通过NFKB 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME P75 NTR RECEPTOR MEDIATED SIGNALLING 81 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY ILS 107 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL1信号传导 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRAF6 MEDIATED INDUCTION OF NFKB AND MAP KINASES UPON TLR7 8 OR 9 ACTIVATION 77 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRAF6 MEDIATED IRF7 ACTIVATION IN TLR7 8 OR 9 SIGNALING 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MYD88 MAL CASCADE INITIATED ON PLASMA MEMBRANE 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INNATE IMMUNE SYSTEM 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ACTIVATED TLR4 SIGNALLING 93 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TOLL RECEPTOR CASCADES 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 267 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pramoonjago sox4靶向 52 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 117 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KLEIN TARGETS OF BCR ABL1 FUSION 45 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN METASTASIS DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER PBL KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 151 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER PBL KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE INTERFERON RESPONSIVE GENES 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 161 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C3 20 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏4NQO或UV 63 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向DN 108 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF DN 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 UP 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常衰老 93 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 8 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HIRSCH CELLULAR TRANSFORMATION SIGNATURE UP 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP B 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Duan PRDM5目标 79 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANLOO SP3 TARGETS DN 89 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 36HR 152 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDRIOLI MIR31 TARGETS DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RATTENBACHER BOUND BY CELF1 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROESSLER LIVER CANCER METASTASIS UP 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因