基因页：GADD45B
概括?
| 基因ID | 4616 |
| Symbol | GADD45B |
| 同义词 | gadd45beta | myd118 |
| 描述 | growth arrest and DNA damage inducible beta |
| 参考 | MIM:604948|HGNC:HGNC:4096|Ensembl：ENSG0000000099860|HPRD：05382|Vega:OTTHUMG00000180434 |
| 基因type | protein-coding |
| 地图位置 | 19p13.3 |
| Pascal P值 | 0.148 |
| Sherlock P值 | 0.49 |
| Fetal beta | -2.001 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | 系统搜索PubMed co-occ基因urring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | Click to show details |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | Chromosome | Position | eGene | 基因Entrez ID | PVALUE | qvalue | TSS distance | eQTL type |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SNP_A-2090942 | 0 | GADD45B | 4616 | 0.01 | trans | |||
| rs17014165 | chr1 | 206856485 | GADD45B | 4616 | 0.01 | trans | ||
| RS4242415 | chr8 | 24597175 | GADD45B | 4616 | 3.627E-4 | trans | ||
| rs1257282 | chr14 | 99828775 | GADD45B | 4616 | 0.18 | trans | ||
| rs1257280 | chr14 | 99829872 | GADD45B | 4616 | 0.18 | trans | ||
| RS7888404 | chrX | 20508308 | GADD45B | 4616 | 6.381E-4 | trans |
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
| NPC1 | 0.95 | 0.86 |
| PLD1 | 0.93 | 0.77 |
| UGT8 | 0.93 | 0.60 |
| ABCA8 | 0.93 | 0.64 |
| USP54 | 0.93 | 0.89 |
| TMC7 | 0.92 | 0.80 |
| GLDN | 0.92 | 0.62 |
| PIP5K2A | 0.92 | 0.82 |
| SLC12A2 | 0.92 | 0.83 |
| KIF13B | 0.92 | 0.84 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
| ST20 | -0.46 | -0.63 |
| AC006276.2 | -0.46 | -0.51 |
| TBC1D10A | -0.44 | -0.39 |
| RPL35 | -0.44 | -0.57 |
| SCNM1 | -0.43 | -0.46 |
| RPL12 | -0.43 | -0.51 |
| PFDN5 | -0.43 | -0.53 |
| PHPT1 | -0.42 | -0.53 |
| C9orf46 | -0.42 | -0.46 |
| Bcl7c | -0.42 | -0.46 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CCNB1 | CCNB | 细胞周期蛋白B1 | Cyclin B1与GADD45B相互作用。这种相互作用是根据未指定物种的人类细胞周期蛋白B1和GADD45B之间的相互作用进行建模的。 | BIND | 12124778 |
| CCNB1 | CCNB | 细胞周期蛋白B1 | - | HPRD，Biogrid | 12124778 |
| CDC2 | CDC28A | CDK1 | DKFZp686L20222 | MGC111195 | 细胞分裂周期2，G1至S和G2至M | - | HPRD | 10973963 |
| CDC2 | CDC28A | CDK1 | DKFZp686L20222 | MGC111195 | 细胞分裂周期2，G1至S和G2至M | CDK1与GADD45B相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类CDK1和GADD45B之间的相互作用进行建模的。 | BIND | 12124778 |
| CDKN1A | CAP20 | CDKN1 | CIP1 | MDA-6 | P21 | SDI1 | WAF1 | p21CIP1 | cyclin-dependent kinase inhibitor 1A (p21, Cip1) | - | HPRD | 8700517 |
| Egr1 | AT225 |G0S30 |KROX-24 |ngfi-a |tis8 |ZIF-268 |ZNF225 | early growth response 1 | Egr-1 interacts with Gadd45b promoter. | BIND | 15616591 |
| ESR1 | DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 | 雌激素受体1 | - | HPRD | 10872826 |
| GADD45A | ddit1 |GADD45 | growth arrest and DNA-damage-inducible, alpha | - | HPRD，Biogrid | 11498536 |
| GADD45GIP1 | CKBBP2 | CRIF1 | MGC4667 | MGC4758 | PLINP-1 | PRG6 | Plinp1 | growth arrest and DNA-damage-inducible, gamma interacting protein 1 | CRIF1 interacts with Gadd45beta. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between CRIF1 from human and Gadd45beta from mouse. | BIND | 12716909 |
| GADD45GIP1 | CKBBP2 | CRIF1 | MGC4667 | MGC4758 | PLINP-1 | PRG6 | Plinp1 | growth arrest and DNA-damage-inducible, gamma interacting protein 1 | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 12716909 |
| MAP2K7 | Jnkk2 | MAPKK7 | MKK7 | PRKMK7 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶7 | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 14743220 |
| MAP3K4 | FLJ42439 | KIAA0213 | MAPKKK4 | MEKK4 | MTK1 | PRO0412 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4 | - | HPRD，Biogrid | 9827804 |
| MAP3K5 | ASK1 | MAPKKK5 | MEKK5 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5 | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 14743220 |
| PCNA | MGC8367 | proliferating cell nuclear antigen | - | HPRD | 10828065 |
| PCNA | MGC8367 | proliferating cell nuclear antigen | MYD118 interacts with PCNA. | BIND | 10828065 |
| PCNA | MGC8367 | proliferating cell nuclear antigen | Gadd45b interacts with PCNA. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between Gadd45b from an unspecified species and human PCNA. | BIND | 12124778 |
| PPARA | MGC2237 |MGC2452 |NR1C1 |PPAR |hppar | peroxisome proliferator-activated receptor alpha | - | HPRD | 10872826 |
| PPARD | 法尔|MGC3931 |NR1C2 |nuc1 |nuci |nucii |ppar-beta |PPARB | 过氧化物酶体增殖物激活受体三角洲 | - | HPRD | 10872826 |
| PPARG | NR1C3 |PPARG1 |PPARG2 |ppargamma | 过氧化物酶体增殖物激活的受体伽玛 | - | HPRD | 10872826 |
V.途径注释
| Pathway name | Pathway size | ＃szgr 2.0基因 | Info |
|---|---|---|---|
| KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG CELL CYCLE | 128 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG P53 SIGNALING PATHWAY | 69 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID P38 MKK3 6 Pathway | 26 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL12 2PATHWAY | 63 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PICCALUGA ANGIOIMMUNOBLASTIC LYMPHOMA DN | 136 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨型性白血病DN | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DOANE RESPONSE TO ANDROGEN UP | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NOJIMA SFRP2 TARGETS UP | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL UP | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDAYAKUMAR MED1 TARGETS DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SENESE HDAC3 TARGETS DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NAGASHIMA NRG1 SIGNALING UP | 176 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KIM WT1 TARGETS DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 埃尔维奇缺氧 | 171 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graham CML静止与正常分裂 | 57 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| geserick tert目标dn | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vanharanta子宫肌瘤DN | 67 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nunoda对dasatinib imatinib的反应 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BEGUM TARGETS OF PAX3 FOXO1 FUSION DN | 45 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARKS HDAC TARGETS UP | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 | 207 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mahadevan对MP470 DN的响应 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DUTTA APOPTOSIS VIA NFKB | 33 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 悍马皮肤癌进展 | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MATTIOLI MGUS VS PCL | 116 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MATTIOLI MGUS VS MULTIPLE MYELOMA | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shi Sparc靶向 | 24 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dirmeier LMP1响应早期 | 66 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WANG HCP PROSTATE CANCER | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Simbulan UV响应正常DN | 33 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIANG HEMATOPOIESIS STEM CELL NUMBER SMALL VS HUGE DN | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LOPEZ MBD TARGETS | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SUH与ID1和ID2共同表达 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gotzmann上皮到间充质过渡 | 69 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amit EGF响应20 Hela | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AMIT SERUM RESPONSE 120 MCF10A | 65 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SHIN B CELL LYMPHOMA CLUSTER 2 | 30 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONDER CDH1 TARGETS 2 UP | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SHEPARD CRUSH AND BURN MUTANT UP | 197 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西葫芦转移DN | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UEDA中央时钟 | 88 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner PBL肾脏移植OK vs供体DN | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROCKE APOPTOSIS REVERSED BY IL6 | 144 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SWEET KRAS TARGETS UP | 84 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MANALO HYPOXIA UP | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Galindo对肠毒素的免疫反应 | 85 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RORIE TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION UP | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GERY CEBP目标 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nguyen Notch1靶向DN | 86 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IGLESIAS E2F TARGETS UP | 151 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Basso CD40信号向上 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JIANG AGING CEREBRAL CORTEX UP | 36 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯对trabectedin的反应 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROWNE HCMV INFECTION 48HR UP | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chen lvad支持失败的心 | 103 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard对紫外线nhek的反应 | 244 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard UV响应集群G4 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEEN RESPONSE TO ROSIGLITAZONE DN | 106 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IVANOVA HEMATOPOIESIS STEM CELL AND PROGENITOR | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JIANG HYPOXIA NORMAL | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WENG POR DOSAGE | 21 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VARELA ZMPSTE24 TARGETS UP | 40 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sato被胰腺癌中的脱乙酰化沉默 | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| safford t淋巴细胞厌食 | 87 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WENG POR TARGETS LIVER UP | 41 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gavin Foxp3目标集群P4 | 100 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Marson Foxp3核心直接目标 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Marzec IL2发出信号 | 115 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 恩格曼癌祖细胞dn | 70 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级结肠与直肠癌 | 38 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chen Hoxa5靶向6小时 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SEKI INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP | 77 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Goldrath抗原反应 | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RUTELLA RESPONSE TO HGF DN | 235 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 DN | 245 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SWEET LUNG CANCER KRAS DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHANG TLX TARGETS 36HR UP | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHANG TLX TARGETS UP | 108 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JISON SICKLE CELL DISEASE UP | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Coulouarn颞TGFB1签名DN | 138 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAMASHITA LIVER CANCER STEM CELL DN | 76 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARSON FOXP3 TARGETS DN | 54 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONO AML1 TARGETS UP | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ono foxp3目标 | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SCHOEN NFKB SIGNALING | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇1的时间反应1 | 68 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta EBNA1反相关 | 173 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村掺杂早期 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DAZARD UV RESPONSE CLUSTER G28 | 20 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr dn | 37 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| OHGUCHI LIVER HNF4A TARGETS UP | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHYLA CBFA2T3 TARGETS UP | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WIERENGA STAT5A TARGETS UP | 217 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wierenga Stat5a Targets Group2 | 60 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP D | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kasler HDAC7目标2 DN | 32 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Duan PRDM5目标 | 79 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DALESSIO TSA RESPONSE | 29 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KUWANO RNA STABILIZED BY NO | 7 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Servitja肝HNF1A靶向 | 135 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PLASARI TGFB1 TARGETS 1HR UP | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PLASARI TGFB1 TARGETS 10HR UP | 199 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |