Gene Page:MYH10

Summary？
基因 4628
象征 MYH10
Synonyms NMMHC-IIB | NMMHCB
Description myosin, heavy chain 10, non-muscle
参考erence MIM:160776|HGNC：HGNC：7568|Ensembl:ENSG00000133026|HPRD：01178|织女:OTTHUMG00000108195
基因类型 蛋白质编码
Map location 17p13
Pascal p-value 0.02
Sherlock p-value 0.234
TADA P值 0.028
胎儿β -0.022
DMG 1(# studies)
Support 结构可塑性
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
G2CDB.HUMAN_CLATHRIN
g2cdb.human_synaptosom
G2CDB.HUMANNRC
CompositeSet
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标
潜在的突触基因

Gene in Data Sources
基因集名称 Method of gene set Description 信息
CV:PGCnp 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
DNM：XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变
PMID：cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias 点击显示详细信息
Network Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献：0.0044

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@DNM表

Gene 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 Mutation type 筛 CG46 特征 学习
MYH10 CHR17 8445550 G C NM_001256012
NM_001256095
NM_005964		 p.494q> e
p.493q> e
p.484q> e		 missense
missense
missense		 Schizophrenia DNM：XU_2012

@差异甲基化基因

Probe 染色体 位置 最近的基因 p（dis） Beta (dis) fdr（dis） 学习
CG00427296 17 8534932 MYH10 2.76E-8 -0.025 8.68e-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

No co-expressed genes in brain regions


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000146 微丝运动活动 艾达 15845534
去：0000166 nucleotide binding IEA -
去：0005516 钙调蛋白结合 IEA -
去：0005524 ATP binding nas 7782316
去：0051015 肌动蛋白丝结合 艾达 15845534
GO：0030898 actin-dependent atp酶的行为ivity 艾达 15845534
GO：0043531 ADP结合 艾达 15845534
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0000281 有丝分裂后的细胞因子 艾达 15774463
去：0008360 regulation of cell shape IEA -
去：0008150 biological_process nd -
GO:0030048 基于肌动蛋白的运动 艾达 15845534
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0001725 压力纤维 艾达 7699007
去：0005737 cytoplasm 艾达 7699007
GO:0005938 细胞皮质 艾达 7699007
GO：0016459 肌球蛋白复合物 nas 7499478
去：0030496 中体 艾达 11029059
GO:0032154 cleavage furrow 艾达 7699007|11029059

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
KEGG TIGHT JUNCTION 134 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 216 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG VIRAL MYOCARDITIS 73 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME DEVELOPMENTAL BIOLOGY 396 292 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Axon指导 251 188 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Semaphorin信号中的Reactome SemA4D 32 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Smaphorin相互作用 68 53 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME SEMA4D INDUCED CELL MIGRATION AND GROWTH CONE COLLAPSE 27 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过CD40 UP的Hollmann凋亡 201 125 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN 169 118 All SZGR 2.0 genes in this pathway
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 All SZGR 2.0 genes in this pathway
vecchi胃癌先进与早期 175 120 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 157 91 All SZGR 2.0 genes in this pathway
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1靶向DN 260 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 24HR UP 557 331 All SZGR 2.0 genes in this pathway
周的炎症反应FIMA DN 284 156 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim WT1靶向 214 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GRAHAM CML QUIESCENT VS NORMAL QUIESCENT UP 87 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN 199 124 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌 443 294 All SZGR 2.0 genes in this pathway
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 All SZGR 2.0 genes in this pathway
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gruetzmann胰腺癌 358 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mantovani病毒GPCR信号向上 86 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim生发中心T助手 66 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ROSS AML OF FAB M7 TYPE 68 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HADDAD T LYMPHOCYTE AND NK PROGENITOR UP 78 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yagi AML Fab标记 191 131 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sesto对UV C8的反应 72 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McClung Delta FOSB目标8WK 47 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kaab失败的心房DN 141 99 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mahajan对IL1A DN的反应 76 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GAJATE RESPONSE TO TRABECTEDIN UP 67 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WELCSH BRCA1 TARGETS UP 198 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KAYO CALORIE RESTRICTION MUSCLE UP 95 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 2 473 224 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Izadpanah干细胞脂肪与骨DN 108 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zembutsu对长春新碱的敏感性 19 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hirsch细胞转化特征dn 103 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1靶向衰老 572 352 All SZGR 2.0 genes in this pathway
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 DN 918 550 All SZGR 2.0 genes in this pathway
棕熊UVC响应迟到 1137 655 All SZGR 2.0 genes in this pathway
pasini suz12靶向DN 315 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ikeda mir30目标 116 87 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMIRNOV RESPONSE TO IR 6HR UP 166 97 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 1127 1133 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
miR-124/506 1126 1133 1A，M8 hsa-miR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124brain UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-141/200a 1059 1066 1A，M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
hsa-miR-200a uaacacugucuguguguguaaacgaugu
HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
hsa-miR-200a uaacacugucuguguguguaaacgaugu
miR-181 999 1005 M8 HSA-MIR-181Abrain AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181Cbrain AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
HSA-MIR-181Dbrain aacauucauuguugucggggguggguu
miR-194 1062 1068 1a HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga
mir-30-5p 1524 1530 M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
hsa-miR-30cbrain UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
hsa-miR-30dSZ UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
hsa-miR-30bSZ uguaaacauccuaccucucagcu
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir-320 1334 1340 1a hsa-miR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-330 900 907 1A，M8 hsa-miR-330brain GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA
mir-409-3p 1250 1256 1a HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-543 1000 1006 M8 hsa-miR-543 aaacauucgcggugcacuucu