基因页:myo1d
概括?
基因 | 4642 |
象征 | myo1d |
同义词 | ppp1r108 | myr4 |
描述 | 肌球蛋白ID |
参考 | MIM:606539|HGNC:HGNC:7598|ENSEMBL:ENSG00000176658|HPRD:07581|Vega:Otthumg00000179636 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q11.2 |
Pascal P值 | 0.05 |
支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MYO1D_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TM9SF1 | 0.83 | 0.79 |
HeaTr2 | 0.80 | 0.78 |
ERBB2 | 0.80 | 0.73 |
CMTM3 | 0.79 | 0.65 |
CHST14 | 0.79 | 0.76 |
莫斯特 | 0.79 | 0.73 |
TCTN3 | 0.78 | 0.71 |
MMP2 | 0.78 | 0.73 |
DDR1 | 0.78 | 0.72 |
GLB1 | 0.77 | 0.76 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.48 | -0.55 |
MT-CO2 | -0.47 | -0.53 |
AF347015.27 | -0.46 | -0.51 |
AF347015.8 | -0.44 | -0.50 |
AF347015.31 | -0.44 | -0.49 |
AF347015.33 | -0.44 | -0.48 |
C5orf53 | -0.43 | -0.45 |
mt-cyb | -0.42 | -0.48 |
AC098691.2 | -0.41 | -0.45 |
AF347015.2 | -0.39 | -0.46 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0003779 | 肌动蛋白结合 | IEA | - | |
去:0003774 | 运动活动 | IEA | - | |
去:0005516 | 钙调蛋白结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016459 | 肌球蛋白复合物 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房正常导管与小叶 | 68 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Corre多发性骨髓瘤 | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 77 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冷吉非替尼抵抗DN | 230 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向DN | 90 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
帕特森多西他赛电阻 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gottwein的KSHV Mir K12 11 | 63 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LE EGR2目标DN | 108 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasaki成人T细胞白血病 | 176 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
康(Kang)由tert dn永生 | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DASU IL6信号疤痕向上 | 30 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 142 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1靶向10小时 | 199 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-137 | 2129 | 2135 | 1a | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
mir-142-5p | 2092 | 2098 | M8 | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |
mir-155 | 2137 | 2144 | 1A,M8 | HSA-MIR-155 | uuaaugcuaaucgugauagggg |
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 1890年 | 1896年 | M8 | HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu |
HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
mir-182 | 1753年 | 1759年 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
mir-335 | 2028 | 2034 | 1a | HSA-MIR-335脑 | UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUAUGU |
mir-9 | 208 | 214 | 1a | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |
mir-96 | 1753年 | 1759年 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |