概括
基因 4642
象征 myo1d
同义词 ppp1r108 | myr4
描述 肌球蛋白ID
参考 MIM:606539|HGNC:HGNC:7598|ENSEMBL:ENSG00000176658|HPRD:07581|Vega:Otthumg00000179636
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q11.2
Pascal P值 0.05
支持 g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TM9SF1 0.83 0.79
HeaTr2 0.80 0.78
ERBB2 0.80 0.73
CMTM3 0.79 0.65
CHST14 0.79 0.76
莫斯特 0.79 0.73
TCTN3 0.78 0.71
MMP2 0.78 0.73
DDR1 0.78 0.72
GLB1 0.77 0.76
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.48 -0.55
MT-CO2 -0.47 -0.53
AF347015.27 -0.46 -0.51
AF347015.8 -0.44 -0.50
AF347015.31 -0.44 -0.49
AF347015.33 -0.44 -0.48
C5orf53 -0.43 -0.45
mt-cyb -0.42 -0.48
AC098691.2 -0.41 -0.45
AF347015.2 -0.39 -0.46

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003779 肌动蛋白结合 IEA -
去:0003774 运动活动 IEA -
去:0005516 钙调蛋白结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016459 肌球蛋白复合物 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房正常导管与小叶 68 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Corre多发性骨髓瘤 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冷吉非替尼抵抗DN 230 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向DN 90 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
帕特森多西他赛电阻 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gottwein的KSHV Mir K12 11 63 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasaki成人T细胞白血病 176 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康(Kang)由tert dn永生 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DASU IL6信号疤痕向上 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kondo EZH2目标 245 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1靶向10小时 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-137 2129 2135 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-142-5p 2092 2098 M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-155 2137 2144 1A,M8 HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 1890年 1896年 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-182 1753年 1759年 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-335 2028 2034 1a HSA-MIR-335 UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUAUGU
mir-9 208 214 1a HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga
mir-96 1753年 1759年 1a HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc