基因页面:MYO1E
总结吗?
GeneID | 4643年 |
象征 | MYO1E |
同义词 | FSGS6 | HuncM-IC | MYO1C |
描述 | 肌凝蛋白即 |
参考 | MIM: 601479|HGNC: HGNC: 7599|HPRD: 03281| |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 15 q22.2 |
帕斯卡假定值 | 0.028 |
胎儿β | -0.459 |
DMG | 2(#研究) |
eGene | 额叶皮质BA9 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg07684353 | 15 | 59664799 | MYO1E | -0.024 | 0.85 | DMG: Nishioka_2013 | |
cg07684353 | 15 | 59664799 | MYO1E | 1.33 e-9 | -0.021 | 1.35 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MYO1E_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZFP41 | 0.79 | 0.81 |
TESK1 | 0.78 | 0.75 |
SHARPIN | 0.78 | 0.84 |
板条箱 | 0.78 | 0.78 |
PPDPF | 0.77 | 0.78 |
C22orf36 | 0.77 | 0.81 |
FHL3 | 0.77 | 0.72 |
ITFG3 | 0.77 | 0.78 |
CLN3 | 0.76 | 0.79 |
GPR172A | 0.76 | 0.74 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.50 | -0.48 |
AF347015.8 | -0.48 | -0.49 |
AF347015.21 | -0.48 | -0.52 |
MT-CO2 | -0.47 | -0.48 |
AF347015.31 | -0.47 | -0.46 |
MT-CYB | -0.47 | -0.47 |
MT-ATP8 | -0.45 | -0.54 |
AF347015.33 | -0.45 | -0.45 |
SEC62 | -0.45 | -0.50 |
AF347015.15 | -0.44 | -0.45 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
通过CD40 HOLLMANN细胞凋亡 | 201年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DAVICIONI分子武器VS erm | 332年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 | 579年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS基本DN | 455年 | 304年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1目标了 | 214年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
APPIERTO FENRETINIDE反应 | 38 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
EBAUER目标PAX3 FOXO1融合DN | 48 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日MYCN放大目标 | 92年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NUYTTEN EZH2的目标了 | 1037年 | 673年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里克曼转移DN | 261年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PETRETTO血压上升 | 12 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
不知道背景目标2 DN | 464年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿斯顿重度抑郁症DN | 160年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
松田自然杀伤细胞分化 | 475年 | 313年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阮NOTCH1 DN的目标 | 86年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陈PDGF的目标 | 19 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BAELDE糖尿病肾病DN | 434年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SAFFORD T淋巴细胞无力 | 87年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GAVIN FOXP3目标集群P3 | 160年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GAVIN集群P7 FOXP3目标 | 90年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
蒋介石肝癌子类CTNNB1 DN | 170年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
S3 HOSHIDA肝癌子类 | 266年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李诱导T自然杀伤 | 307年 | 182年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DUTERTRE雌二醇响应24小时DN | 505年 | 328年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
皮德森转移由ERBB2同种型7 | 403年 | 240年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG类1引起的暂时性的EGF | 516年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |