基因页:myo7b
概括?
基因 | 4648 |
象征 | myo7b |
同义词 | - |
描述 | 肌球蛋白VIIB |
参考 | MIM:606541|HGNC:HGNC:7607|ENSEMBL:ENSG00000169994|Vega:Otthumg00000153419 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q21.1 |
Pascal P值 | 0.431 |
胎儿β | -0.371 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.023 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00755 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00778928 | 2 | 128380062 | myo7b | 5.072E-4 | -0.301 | 0.047 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MYO7B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MOAP1 | 0.91 | 0.93 |
IDH3A | 0.91 | 0.93 |
NSF | 0.91 | 0.92 |
ATP1B1 | 0.90 | 0.94 |
SNX10 | 0.90 | 0.94 |
OXR1 | 0.90 | 0.93 |
MAPK9 | 0.90 | 0.92 |
ATP6V1B2 | 0.90 | 0.90 |
gabrg2 | 0.89 | 0.91 |
ATP6V1C1 | 0.89 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl7c | -0.54 | -0.59 |
NME4 | -0.53 | -0.62 |
透明2 | -0.50 | -0.50 |
IRF7 | -0.50 | -0.61 |
sigirr | -0.48 | -0.57 |
SH3BP2 | -0.47 | -0.46 |
AC006276.2 | -0.47 | -0.43 |
mutyh | -0.46 | -0.45 |
SEMA4B | -0.46 | -0.38 |
SMTN | -0.46 | -0.46 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0003779 | 肌动蛋白结合 | IEA | - | |
去:0003774 | 运动活动 | IEA | - | |
去:0005488 | 捆绑 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
GO:0016324 | 顶质膜 | IEA | - | |
GO:0016459 | 肌球蛋白复合物 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 | 153 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |