基因页:PPP1R12B
概括?
基因 | 4660 |
象征 | PPP1R12B |
同义词 | mypt2 | pp1bp55 |
描述 | 蛋白质磷酸酶1调节亚基12B |
参考 | MIM:603768|HGNC:HGNC:7619|Ensembl:ENSG00000077157|HPRD:04794|Vega:Otthumg0000000041393 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q32.1 |
胎儿β | 0.85 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG08990198 | 1 | 202318195 | PPP1R12B | 6.81e-11 | -0.027 | 4.34e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPP1R12B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Zmym4 | 0.97 | 0.98 |
WDR3 | 0.97 | 0.97 |
KIAA1429 | 0.97 | 0.97 |
SMEK2 | 0.97 | 0.96 |
XRCC5 | 0.97 | 0.98 |
SRP72 | 0.96 | 0.96 |
CAND1 | 0.96 | 0.97 |
crnkl1 | 0.96 | 0.97 |
MATR3 | 0.96 | 0.97 |
WDR48 | 0.96 | 0.97 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.75 | -0.89 |
MT-CO2 | -0.75 | -0.88 |
AF347015.31 | -0.74 | -0.87 |
AF347015.33 | -0.73 | -0.86 |
ifi27 | -0.72 | -0.87 |
AF347015.27 | -0.72 | -0.85 |
AIFM3 | -0.72 | -0.79 |
HLA-F | -0.72 | -0.78 |
mt-cyb | -0.71 | -0.84 |
AF347015.8 | -0.71 | -0.87 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg血管平滑肌收缩 | 115 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta CCR3途径 | 23 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta整联蛋白途径 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡塔尔肌球蛋白途径 | 31 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Rac1途径 | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Rho途径 | 32 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta PAR1途径 | 37 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tomlins前列腺癌DN | 40 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯托西对雌二醇的反应 | 50 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM胃癌化学敏感性 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen Leomomyosarcoma CNN1 UP | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 | 125 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Duan PRDM5目标 | 79 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |