概括
基因 4660
象征 PPP1R12B
同义词 mypt2 | pp1bp55
描述 蛋白质磷酸酶1调节亚基12B
参考 MIM:603768|HGNC:HGNC:7619|Ensembl:ENSG00000077157|HPRD:04794|Vega:Otthumg0000000041393
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q32.1
胎儿β 0.85
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG08990198 1 202318195 PPP1R12B 6.81e-11 -0.027 4.34e-7 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Zmym4 0.97 0.98
WDR3 0.97 0.97
KIAA1429 0.97 0.97
SMEK2 0.97 0.96
XRCC5 0.97 0.98
SRP72 0.96 0.96
CAND1 0.96 0.97
crnkl1 0.96 0.97
MATR3 0.96 0.97
WDR48 0.96 0.97
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.75 -0.89
MT-CO2 -0.75 -0.88
AF347015.31 -0.74 -0.87
AF347015.33 -0.73 -0.86
ifi27 -0.72 -0.87
AF347015.27 -0.72 -0.85
AIFM3 -0.72 -0.79
HLA-F -0.72 -0.78
mt-cyb -0.71 -0.84
AF347015.8 -0.71 -0.87

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg血管平滑肌收缩 115 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CCR3途径 23 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta整联蛋白途径 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡塔尔肌球蛋白途径 31 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Rac1途径 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Rho途径 32 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta PAR1途径 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gal白血病干细胞DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tomlins前列腺癌DN 40 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯托西对雌二醇的反应 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM胃癌化学敏感性 103 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen Leomomyosarcoma CNN1 UP 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 125 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Duan PRDM5目标 79 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因