基因页：myt1

概括？
基因 4661
象征 myt1
同义词 c20orf36 | mtf1 | myti | nzf2 | plpb1 | zc2hc4a
描述 髓磷脂转录因子1
参考 MIM：600379|HGNC：HGNC：7622|ENSEMBL：ENSG00000196132|HPRD：02659|Vega：Otthumg00000149988
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20q13.33
Pascal P值 0.242
Sherlock P值 0.594
胎儿β 1.537
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达 基因表达的荟萃分析 p价值：1.735
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG21910489 20 62818388 myt1 1.51E-5 0.544 0.015 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6687849 CHR1 175904808 myt1 4661 0.09 反式
RS2481653 CHR1 176044120 myt1 4661 0.12 反式
RS2502827 CHR1 176044216 myt1 4661 0 反式
RS17572651 CHR1 218943612 myt1 4661 0.14 反式
RS16829545 CHR2 151977407 myt1 4661 1.62E-16 反式
RS16841750 CHR2 158288461 myt1 4661 0.06 反式
RS3845734 CHR2 171125572 myt1 4661 1.358E-4 反式
RS7584986 CHR2 184111432 myt1 4661 1.121E-9 反式
RS16889813 CHR4 14196540 myt1 4661 0.17 反式
RS2183142 CHR4 159232695 myt1 4661 0.09 反式
RS1396222 CHR4 173279496 myt1 4661 0.15 反式
RS335980 CHR4 173329784 myt1 4661 0.14 反式
RS337984 CHR4 173411662 myt1 4661 0.16 反式
RS17762315 CHR5 76807576 myt1 4661 0.02 反式
RS16890367 CHR6 38078448 myt1 4661 0.17 反式
RS3118341 Chr9 25185518 myt1 4661 0.01 反式
RS11139334 Chr9 84209393 myt1 4661 0.13 反式
RS2393316 Chr10 59333070 myt1 4661 0.11 反式
RS17104720 CHR14 77127308 myt1 4661 0.18 反式
RS16955618 CHR15 29937543 myt1 4661 2.458e-29 反式
RS1041786 CHR21 22617710 myt1 4661 1.327E-5 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003700 转录因子活性 IEA -
去：0003700 转录因子活性 nas 1280325
去：0005515 蛋白质结合 IPI 9001210
去：0008270 锌离子结合 IEA -
去：0008270 锌离子结合 nas 1280325
GO：0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007399 神经系统的发展 IEA 神经突（GO期限：5） -
去：0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 IEA -
去：0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 nas 1280325
去：0006350 转录 IEA -
去：0007275 多细胞生物发育 IEA -
去：0030154 细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -
去：0005634 核 nas 1280325

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Biocarta G2途径 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta MPR途径 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta RB途径 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlesinger H3K27me3在正常状态下甲基化的癌症 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon 149 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫迪海马产前 42 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CCND1和CDK4的Molenaar靶标 67 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔内B 172 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周周内分泌祖细胞 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANASSE BCL2靶向 40 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卡mir302a目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dormoy Elavl1目标 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-125/351 308 315 1A，M8 HSA-MIR-125B脑 ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A脑 ucccugagacccuuaaccugug
mir-128 1708年 1714年 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-130/301 1052 1058 M8 HSA-MIR-130A脑 cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b脑 Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-144 1706年 1712年 M8 HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-146 305 311 1a HSA-MIR-146A ugagaacugaauuccaugggug
HSA-MIR-146B脑 ugagaacugaauuccauaggcu
mir-186 1360 1366 M8 HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
MiR-200BC/429 336 342 M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-27 1708年 1714年 M8 HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-329 1757年 1763年 M8 HSA-MIR-329脑 aacacaccugguaaccucuuu
mir-378 1725年 1731年 1a HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-410 1342 1348 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-495 1350 1356 1a HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu