基因页:纳格鲁
概括?
基因 | 4669 |
象征 | 纳格鲁 |
同义词 | cmt2v | mps-iiib | mps3b | nag | ufhsd |
描述 | N-乙酰氨基氨基氨基酶,α |
参考 | MIM:609701|HGNC:HGNC:7632|ENSEMBL:ENSG00000108784|HPRD:02017|Vega:Otthumg00000180240 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17Q21 |
Pascal P值 | 0.045 |
Sherlock P值 | 0.154 |
胎儿β | -0.39 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG20623645 | 17 | 40687392 | 纳格鲁 | 3.8e-4 | 0.283 | 0.043 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6917535 | CHR6 | 100345316 | 纳格鲁 | 4669 | 0.1 | 反式 | ||
RS16967268 | CHR15 | 39012761 | 纳格鲁 | 4669 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NAGLU_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
LSMD1 | 0.94 | 0.88 |
UQCRQ | 0.94 | 0.90 |
Znhit1 | 0.93 | 0.83 |
C7orf59 | 0.93 | 0.83 |
NDUFB7 | 0.93 | 0.86 |
MRPL54 | 0.93 | 0.87 |
C19orf70 | 0.93 | 0.83 |
UQCR | 0.92 | 0.84 |
C6orf125 | 0.92 | 0.80 |
NDUFA13 | 0.92 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIF16B | -0.50 | -0.55 |
MACF1 | -0.49 | -0.56 |
ZC3H13 | -0.48 | -0.49 |
BAT2D1 | -0.48 | -0.47 |
FNBP1 | -0.47 | -0.53 |
UPF2 | -0.47 | -0.44 |
MDN1 | -0.47 | -0.48 |
MAP4K4 | -0.47 | -0.56 |
myh9 | -0.47 | -0.41 |
Golgb1 | -0.47 | -0.47 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004561 | α-N-乙酰葡萄糖氨基酶活性 | 塔斯 | 8650226 | |
去:0016798 | 水解酶活性,作用于糖基键 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突(GO期限:5) | 8650226 |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
去:0030203 | 糖胺聚糖代谢过程 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005764 | 溶酶体 | 塔斯 | 8650226 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg糖胺聚糖降解 | 21 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg溶酶体 | 121 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HS堵嘴降解 | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome硫酸乙酰肝素肝素HS GAG代谢 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖胺聚糖代谢 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rodrigues NTN1靶向DN | 158 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDayakumar Med1靶向 | 135 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定DN | 98 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制新皮层DN | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kayo卡路里限制肌肉 | 95 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bredemeyer抹布信令不是通过ATM DN | 57 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan V1后期分化基因上升 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |