概括
基因 4669
象征 纳格鲁
同义词 cmt2v | mps-iiib | mps3b | nag | ufhsd
描述 N-乙酰氨基氨基氨基酶,α
参考 MIM:609701|HGNC:HGNC:7632|ENSEMBL:ENSG00000108784|HPRD:02017|Vega:Otthumg00000180240
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17Q21
Pascal P值 0.045
Sherlock P值 0.154
胎儿β -0.39
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG20623645 17 40687392 纳格鲁 3.8e-4 0.283 0.043 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6917535 CHR6 100345316 纳格鲁 4669 0.1 反式
RS16967268 CHR15 39012761 纳格鲁 4669 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
LSMD1 0.94 0.88
UQCRQ 0.94 0.90
Znhit1 0.93 0.83
C7orf59 0.93 0.83
NDUFB7 0.93 0.86
MRPL54 0.93 0.87
C19orf70 0.93 0.83
UQCR 0.92 0.84
C6orf125 0.92 0.80
NDUFA13 0.92 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIF16B -0.50 -0.55
MACF1 -0.49 -0.56
ZC3H13 -0.48 -0.49
BAT2D1 -0.48 -0.47
FNBP1 -0.47 -0.53
UPF2 -0.47 -0.44
MDN1 -0.47 -0.48
MAP4K4 -0.47 -0.56
myh9 -0.47 -0.41
Golgb1 -0.47 -0.47

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004561 α-N-乙酰葡萄糖氨基酶活性 塔斯 8650226
去:0016798 水解酶活性,作用于糖基键 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007399 神经系统的发展 塔斯 神经突(GO期限:5) 8650226
去:0008152 代谢过程 IEA -
去:0030203 糖胺聚糖代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005764 溶酶体 塔斯 8650226

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg糖胺聚糖降解 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg溶酶体 121 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HS堵嘴降解 20 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome硫酸乙酰肝素肝素HS GAG代谢 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖胺聚糖代谢 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues NTN1靶向DN 158 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDayakumar Med1靶向 135 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定DN 98 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制新皮层DN 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kayo卡路里限制肌肉 95 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bredemeyer抹布信令不是通过ATM DN 57 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan V1后期分化基因上升 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因