概括
基因 4674
象征 NAP1L2
同义词 BPX
描述 核小体组装蛋白1像2
参考 MIM:300026|HGNC:HGNC:7638|ENSEMBL:ENSG00000186462|HPRD:02066|Vega:Otthumg0000000021827
基因类型 蛋白质编码
地图位置 XQ13
Sherlock P值 0.96
TADA P值 9.98e-4
胎儿β -2.504
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
NAP1L2 Chrx 72434103..72434104 CT C NM_021963 边框 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7132043 CHR12 80968399 NAP1L2 4674 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Tomm5 0.89 0.87
CHCHD1 0.86 0.86
TXNDC17 0.86 0.85
UQCRH 0.85 0.82
polr2f 0.84 0.83
SNRPD2 0.84 0.83
NDUFS4 0.84 0.83
NDUFA12 0.82 0.82
MRPS21 0.82 0.82
MRPL27 0.82 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
梨1 -0.49 -0.55
tenc1 -0.48 -0.54
LRRC32 -0.46 -0.56
TNS1 -0.45 -0.53
sema3g -0.44 -0.50
FAM38A -0.44 -0.52
EPAS1 -0.44 -0.52
安纳克 -0.44 -0.54
NPR1 -0.43 -0.48
vwf -0.43 -0.48

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PYEON HPV阳性肿瘤DN 10 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合目标F DN 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化CCNE1 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌与H3K9me3 UP 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
podar对Apaphostin的反应 147 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因