基因页:CEACAM6
概括?
基因 | 4680 |
象征 | CEACAM6 |
同义词 | CD66C | CEAL | NCA |
描述 | 癌胚抗原相关的细胞粘附分子6 |
参考 | MIM:163980|HGNC:HGNC:1818|ENSEMBL:ENSG00000086548|HPRD:01233|Vega:Otthumg00000151064 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.2 |
Pascal P值 | 0.469 |
胎儿β | 0.369 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11682393 | CHR2 | 47804496 | CEACAM6 | 4680 | 0.2 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CEACAM6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
UQCRFSL1 | 0.92 | 0.91 |
C20ORF24 | 0.90 | 0.87 |
COX5A | 0.89 | 0.91 |
hax1 | 0.88 | 0.85 |
MRPS33 | 0.88 | 0.85 |
FAM58A | 0.87 | 0.83 |
Hint1 | 0.87 | 0.83 |
MGST3 | 0.87 | 0.82 |
MRPS7 | 0.87 | 0.84 |
C1orf43 | 0.87 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.48 | -0.34 |
AC010300.1 | -0.47 | -0.61 |
AC016705.1 | -0.45 | -0.39 |
GP1BA | -0.44 | -0.45 |
mtss1l | -0.44 | -0.41 |
myh9 | -0.44 | -0.36 |
Z83840.4 | -0.43 | -0.40 |
AP000769.2 | -0.43 | -0.50 |
C10orf108 | -0.43 | -0.44 |
EIF5B | -0.42 | -0.50 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
igarashi atf4靶向dn | 90 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌与LMP1 DN | 175 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Puiffe入侵被腹水抑制 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多恩乳腺癌课程 | 72 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Laiho结直肠癌锯齿状 | 112 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗伊伤口血管DN | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 | 205 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标 | 142 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 | 143 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AML1 MTG8融合的Dunne目标 | 52 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LI在肺癌中扩增 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
留置权乳腺癌化生型与导管DN | 114 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
h pilori的Murata毒力 | 24 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林被肿瘤微环境沉默 | 108 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JI转移受STK11抑制 | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标1 DN | 169 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标3 DN | 59 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜Kras靶向DN | 66 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cheok对汞和LD MTX DN的反应 | 21 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1突变DN的Verhaak AML | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染6小时 | 71 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂响应和XPC向上 | 202 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
恩格曼癌祖细胞dn | 70 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼中的Smid乳腺癌复发 | 97 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌ERBB2 UP | 147 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer肿瘤发生DN | 51 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hinata NFKB靶向角质形成细胞DN | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
croonquist nras发出信号 | 41 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
池子侵入性乳腺癌 | 288 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOSCO上皮分化模块 | 69 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |