概括
基因 4680
象征 CEACAM6
同义词 CD66C | CEAL | NCA
描述 癌胚抗原相关的细胞粘附分子6
参考 MIM:163980|HGNC:HGNC:1818|ENSEMBL:ENSG00000086548|HPRD:01233|Vega:Otthumg00000151064
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.2
Pascal P值 0.469
胎儿β 0.369
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11682393 CHR2 47804496 CEACAM6 4680 0.2 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
UQCRFSL1 0.92 0.91
C20ORF24 0.90 0.87
COX5A 0.89 0.91
hax1 0.88 0.85
MRPS33 0.88 0.85
FAM58A 0.87 0.83
Hint1 0.87 0.83
MGST3 0.87 0.82
MRPS7 0.87 0.84
C1orf43 0.87 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.18 -0.48 -0.34
AC010300.1 -0.47 -0.61
AC016705.1 -0.45 -0.39
GP1BA -0.44 -0.45
mtss1l -0.44 -0.41
myh9 -0.44 -0.36
Z83840.4 -0.43 -0.40
AP000769.2 -0.43 -0.50
C10orf108 -0.43 -0.44
EIF5B -0.42 -0.50

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
igarashi atf4靶向dn 90 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌与LMP1 DN 175 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Puiffe入侵被腹水抑制 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多恩乳腺癌课程 72 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Laiho结直肠癌锯齿状 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗伊伤口血管DN 22 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 205 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标 142 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 143 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AML1 MTG8融合的Dunne目标 52 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
留置权乳腺癌化生型与导管DN 114 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
h pilori的Murata毒力 24 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林被肿瘤微环境沉默 108 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JI转移受STK11抑制 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标1 DN 169 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标3 DN 59 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜Kras靶向DN 66 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheok对汞和LD MTX DN的反应 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时 71 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂响应和XPC向上 202 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
恩格曼癌祖细胞dn 70 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼中的Smid乳腺癌复发 97 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌ERBB2 UP 147 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer肿瘤发生DN 51 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向角质形成细胞DN 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
croonquist nras发出信号 41 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
池子侵入性乳腺癌 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO上皮分化模块 69 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因