总结吗?
GeneID 4690年
象征 NCK1
同义词 NCK | NCKalpha | nck-1
描述 NCK适配器蛋白1
参考 MIM: 600508|HGNC: HGNC: 7664|HPRD: 02740|
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 3温度系数
帕斯卡假定值 1.628的军医
夏洛克假定值 0.832

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:1
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:0.6628

部分即遗传学和表观遗传学注释


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
C19orf53 0.90 0.83
USE1 0.89 0.80
MRPL27 0.89 0.83
MRPL20 0.88 0.85
MRPL24 0.88 0.85
FIS1 0.87 0.77
AURKAIP1 0.86 0.77
RNF181 0.86 0.77
GPX4 0.86 0.78
NDUFA2 0.86 0.81
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
BAT2D1 -0.42 -0.36
SLC6A6 -0.38 -0.32
TTN -0.37 -0.34
AC008740.1 -0.37 -0.35
MYH9 -0.36 -0.28
MACF1 -0.36 -0.31
BDP1 -0.36 -0.30
RNF213 -0.36 -0.32
CDH5 -0.35 -0.32
地铁 -0.35 -0.28

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005102 受体结合 新闻学会 神经递质(术语级别:4) 12110186
去:0008093 细胞骨架适配器活动 NAS 12110186
去:0030159 受体信号复杂脚手架的活动 NAS 12110186
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006417 监管的翻译 国际能源机构 - - - - - -
去:0007172 信号复杂的装配 NAS 12110186
去:0007015 肌动蛋白纤维组织 国际能源机构 - - - - - -
去:0016477 细胞迁移 国际能源机构 - - - - - -
去:0042110 T细胞激活 小鬼 12110186
去:0042102 积极的调控T细胞增殖 小鬼 12110186
去:0030838 积极的调节肌动蛋白丝聚合 小鬼 12110186
去:0030032 lamellipodium生源论 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0012506 泡膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0005737 细胞质 NAS 12110186
去:0005783 内质网 国际能源机构 - - - - - -

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 PubMed ID
ABI1 ABI-1 | E3B1 | NAP1BP | SSH3BP | SSH3BP1 abl-interactor 1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11418237
ABL1 ABL | JTK7 | bcr / ABL | c-ABL | p150 | v-abl c-abl致癌基因1受体酪氨酸激酶 - - - - - - HPRD, BioGRID 11494134
BCAR1 中科院| CAS1 | CASS1 | CRKAS | P130Cas 乳腺癌抗雌激素电阻1 - - - - - - HPRD, BioGRID 12135674
BLNK BASH | BLNK-S | LY57 | MGC111051 | slp - 65 | SLP65 b细胞链接器 - - - - - - HPRD, BioGRID 9697839|11487585
CAV2 骑兵| MGC12294 2窖蛋白 - - - - - - HPRD, BioGRID 12091389
CBL C-CBL | CBL2 | RNF55 Cas-Br-M(鼠)同向性逆转录病毒转换序列 亲和力Capture-Western BioGRID 10204582|11494134
CD3E FLJ18683 | T3E | TCRE CD3e分子,ε(CD3-TCR复杂) 重新组成复杂 BioGRID 12110186
CRK CRKII v-crk肉瘤病毒CT10致癌基因相同器官(禽流感) 重新组成复杂 BioGRID 8879209
DAG1 156年DAG | A3a | AGRNR | DAG dystroglycan 1 (dystrophin-associated糖蛋白1) 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 11724572
DCC CRC18 | CRCR1 删除在结直肠癌 - - - - - - HPRD, BioGRID 12149262
DNM1 认为 dynamin 1 - - - - - - HPRD, BioGRID 10206341
DNM2 CMTDI1 | CMTDIB | DI-CMTB | DYN2 | DYNII dynamin 2 Dyn2与Nck交互的一个未指明的同种型。这种交互是仿照人类Dyn2之间的交互和Nck从一个未指明的物种。 绑定 15696170
DOK1 MGC117395 | MGC138860 | P62DOK 对接蛋白质62 kda酪氨酸激酶1(下游) - - - - - - HPRD 12087092
DOK2 p56DOK | p56dok-2 对接蛋白质2 56 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 11689432
DRD3 D3DR | ETM1 | FET1 | MGC149204 | MGC149205 多巴胺D3受体 D3与Nck交互。 绑定 9843378
DRD4 D4DR 多巴胺D4受体 D4.7与Nck交互。 绑定 9843378
DRD4 D4DR 多巴胺D4受体 D4.2与Nck交互。 绑定 9843378
DRD4 D4DR 多巴胺D4受体 - - - - - - HPRD, BioGRID 9843378
DRD4 D4DR 多巴胺D4受体 D4.4与Nck交互。 绑定 9843378
表皮生长因子受体 ERBB | ERBB1 | HER1 | PIG61 |中东和北非地区 表皮生长因子受体(erythroblastic白血病病毒(v-erb-b)致癌基因相同器官,鸟类) - - - - - - HPRD, BioGRID 9362449
EIF2B2 EIF-2Bbeta | EIF2B 真核翻译起始因子2 b亚基2β,39 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 11959995
EIF2S2 DKFZp686L18198 | EIF2 | EIF2B | EIF2beta | MGC8508 真核翻译起始因子2,亚基2β,38 kda - - - - - - HPRD 11959995
EPHB1 麋鹿| EPHT2 | FLJ37986 | Hek6 |网 弗受体B1 - - - - - - HPRD, BioGRID 9430661
EPHB2 变动| DRT | EPHT3 | ERK | Hek5 | MGC87492 | PCBC | Tyro5 弗B2受体 - - - - - - HPRD 9233798
ERBB4 HER4 | MGC138404 | p180erbB4 v-erb-a erythroblastic白血病病毒致癌基因同族体4(禽流感) 亲和力Capture-MS BioGRID 16729043
FASLG APT1LG1 | CD178 | CD95L | FASL | TNFSF6 Fas配体(肿瘤坏死因子超家族成员,6) - - - - - - HPRD, BioGRID 11741599
FLT1 蒋春暄对于费马大定理| VEGFR1 fms-related酪氨酸激酶1(血管内皮生长因子/血管渗透因子受体) Flt-1与Nck交互。 绑定 9600074
GAB2 KIAA0571 GRB2-associated结合蛋白2 重新组成复杂 BioGRID 10391903
KHDRBS1 FLJ34027 | Sam68 | p62 KH域包含,RNA绑定,信号转导相关的1 - - - - - - HPRD, BioGRID 9010224|9362449
LCP2 slp - 76 | SLP76 淋巴细胞胞质蛋白2 (SH2域包含白细胞76 kda)的蛋白质 Nck与slp - 76。 绑定 15558067
LCP2 slp - 76 | SLP76 淋巴细胞胞质蛋白2 (SH2域包含白细胞76 kda)的蛋白质 - - - - - - HPRD, BioGRID 10229072
MAP4K1 HPK1 增殖蛋白激酶激酶激酶激酶1 重新组成复杂
2台混合动力
BioGRID 9346925|9891069
MAP4K4 FLH21957 | FLJ10410 | FLJ20373 | FLJ90111 | HGK | KIAA0687 |尼克 增殖蛋白激酶激酶激酶激酶4 - - - - - - HPRD, BioGRID 9135144
MINK1 B55 | MAP4K6 | MGC21111 |貂| YSK2 | ZC3 | hMINK | hMINKbeta misshapen-like激酶1(斑马鱼) hMINK-beta与Nck交互的一个未指明的同种型。这种交互是仿照人类hMINK-beta之间的交互和Nck从一个未指明的物种。 绑定 15469942
MINK1 B55 | MAP4K6 | MGC21111 |貂| YSK2 | ZC3 | hMINK | hMINKbeta misshapen-like激酶1(斑马鱼) - - - - - - HPRD, BioGRID 15469942
NCKAP1 FLJ11291 | HEM2 | KIAA0587 | MGC8981 | NAP1 | NAP125 NCK-associated蛋白1 - - - - - - HPRD 11418237
NCKIPSD 浸AF3P21 | | DIP1 | MGC23891 | ORF1 | SPIN90 | WASLBP |的愿望 NCK SH3域相互作用的蛋白质 - - - - - - HPRD, BioGRID 11278500
NEDD9 CAS-L | CAS2 | CASL | CASS2 | HEF1 | dJ49G10.2 | dJ761I2.1 神经前体细胞表达,发育抑制9 - - - - - - HPRD, BioGRID 8879209
NEDD9 CAS-L | CAS2 | CASL | CASS2 | HEF1 | dJ49G10.2 | dJ761I2.1 神经前体细胞表达,发育抑制9 - - - - - - HPRD 10808124
NTRK2 GP145-TrkB | TRKB 神经营养酪氨酸激酶受体2型 - - - - - - HPRD 12074588
PAK1 MGC130000 | MGC130001 | PAKalpha p21蛋白(Cdc42 / Rac)活化激酶1 - - - - - - HPRD 8824201|11278241
PAK1 MGC130000 | MGC130001 | PAKalpha p21蛋白(Cdc42 / Rac)活化激酶1 Nck与PAK1 绑定 8824201
PAK1 MGC130000 | MGC130001 | PAKalpha p21蛋白(Cdc42 / Rac)活化激酶1 - - - - - - HPRD, BioGRID 8824201
PAK2 PAK65 | PAKgamma p21蛋白(Cdc42 / Rac)活化激酶2 - - - - - - HPRD 11160719
PDGFRB CD140B | JTK12 | PDGF-R-beta | PDGFR | PDGFR1 血小板源生长因子受体β多肽 Autophosphorylated PDGFR与Nck交互。这种交互是仿照人类PDGFR之间的交互和Nck从一个未指明的物种。 绑定 8890167
PDGFRB CD140B | JTK12 | PDGF-R-beta | PDGFR | PDGFR1 血小板源生长因子受体β多肽 - - - - - - HPRD 9362449
PDGFRB CD140B | JTK12 | PDGF-R-beta | PDGFR | PDGFR1 血小板源生长因子受体β多肽 亲和力Capture-Western BioGRID 1333047|10026169
PFN1 - - - - - - profilin 1 重新组成复杂 BioGRID 9694849
PKN2 MGC150606 | MGC71074 | PAK2 | PRK2 | PRKCL2 | PRO2042 | Pak-2 蛋白激酶N2 - - - - - - HPRD, BioGRID 8910519
PTK2 FADK | FAK | FAK1 | pp125FAK PTK2蛋白质酪氨酸激酶2 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 8879209|11950595
PXN FLJ16691 桩蛋白 - - - - - - HPRD, BioGRID 10330411
RAC1 MGC111543 | MIG5 | TC-25 | p21-Rac1 ras-related C3肉毒杆菌毒素基质1(ρ的家庭,小三磷酸鸟苷结合蛋白Rac1) - - - - - - HPRD 10766742
RALGPS1 KIAA0351 | RALGEF2 | RALGPS1A GEF与PH值、域和SH3绑定主题1 亲和力Capture-Western BioGRID 10747847
RASA1 CM-AVM | CMAVM | DKFZp434N071 | |差距pkw |拉莎| RASGAP | p120GAP | p120RASGAP RAS p21蛋白激活剂(GTPase激活蛋白)1 - - - - - - HPRD 10508618
RASA1 CM-AVM | CMAVM | DKFZp434N071 | |差距pkw |拉莎| RASGAP | p120GAP | p120RASGAP RAS p21蛋白激活剂(GTPase激活蛋白)1 亲和力Capture-Western BioGRID 9233798
RHOU ARHU | CDC42L1 | DJ646B12.2 | FLJ10616 | WRCH1 | fJ646B12.2 | hG28K ras同族体基因家族成员 Wrch-1与Nck交互。这种交互建模在展示人类Wrch-1互动,和Nck从一个未指明的物种。 绑定 15556869
皇家特许测量师学会 GC-GAP | |毅力KIAA0712 | MGC1892 | p200RhoGAP | p250GAP ρGTPase-activating蛋白质 Nck与GC-GAP交互。之间的交互是仿照了交互从一个未指明的物种和人类GC-GAP Nck。 绑定 12819203
皇家特许测量师学会 GC-GAP | |毅力KIAA0712 | MGC1892 | p200RhoGAP | p250GAP ρGTPase-activating蛋白质 - - - - - - HPRD, BioGRID 12819203
基本 - - - - - - RAS相关病毒致癌基因相同器官(r-ras) - - - - - - HPRD, BioGRID 10671570
SOCS1 CIS1 | CISH1 |注射| SOCS-1 | SSI-1 | SSI1 |一句话 抑制细胞因子信号1 Socs1与Nck交互。这种交互建模在鼠标Socs1之间的交互和Nck从一个未指明的物种。 绑定 10022833
SOCS1 CIS1 | CISH1 |注射| SOCS-1 | SSI-1 | SSI1 |一句话 抑制细胞因子信号1 - - - - - - HPRD, BioGRID 10022833
SOCS7 NAP4 抑制细胞因子信号7 - - - - - - HPRD, BioGRID 9344857
SOS1 GF1 | GGF1 | GINGF | |胶质瘤NS4 的儿子sevenless同族体1(果蝇) NCK与SOS。这种交互是仿照人类NCK证明之间的交互和鼠标SOS或仓鼠SOS。 绑定 7862111
SOS1 GF1 | GGF1 | GINGF | |胶质瘤NS4 的儿子sevenless同族体1(果蝇) - - - - - - HPRD 7862111|10026169
|10206341
SOS1 GF1 | GGF1 | GINGF | |胶质瘤NS4 的儿子sevenless同族体1(果蝇) 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 7862111|8810325
|10026169|10206341
SYNJ2 INPP5H | KIAA0348 | MGC44422 synaptojanin 2 - - - - - - HPRD 10805734
TBK1 FLJ11330 | NAK | T2K TANK-binding激酶1 - - - - - - HPRD, BioGRID 7706279
TNIK - - - - - - TRAF2 NCK激酶相互作用 - - - - - - HPRD 10521462
TNK2 ACK | ACK1 | FLJ44758 | FLJ45547 | p21cdc42Hs 酪氨酸激酶,non-receptor 2 - - - - - - HPRD 11278436
IMD2 | THC |黄蜂 Wiskott-Aldrich综合征(eczema-thrombocytopenia) 亲和力Capture-Western
在体外
在活的有机体内
BioGRID 7565724|10747096
|12135674
IMD2 | THC |黄蜂 Wiskott-Aldrich综合征(eczema-thrombocytopenia) - - - - - - HPRD 7565724|11340081
IMD2 | THC |黄蜂 Wiskott-Aldrich综合征(eczema-thrombocytopenia) Nck与黄蜂。 绑定 15558067
瓦斯尔 DKFZp779G0847 | MGC48327 | N-WASP | NWASP Wiskott-Aldrich症状 - - - - - - HPRD, BioGRID 11340081
WIPF1 MGC111041 | PRPL-2 | WASPIP |在制品的数量 /瓦斯尔互动蛋白质家族,成员1 - - - - - - HPRD, BioGRID 9694849


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG ERBB信号通路 87年 71年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG轴突引导 129年 103年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG T细胞受体信号通路 108年 89年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG致病性大肠杆菌感染 59 36 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA ACTINY通路 20. 14 所有SZGR 2.0基因通路
ST T细胞信号转导 45 33 所有SZGR 2.0基因通路
PID胰岛素通路 45 32 所有SZGR 2.0基因通路
PID细胞通路 66年 51 所有SZGR 2.0基因通路
PID满足途径 80年 60 所有SZGR 2.0基因通路
PID EPHB FWD通路 40 38 所有SZGR 2.0基因通路
PID RET通路 39 29日 所有SZGR 2.0基因通路
PID ARF6通路 35 27 所有SZGR 2.0基因通路
PID检验受体途径 50 41 所有SZGR 2.0基因通路
PID NETRIN通路 32 27 所有SZGR 2.0基因通路
近端PID ERBB1受体途径 35 29日 所有SZGR 2.0基因通路
PID PDGFRB通路 129年 103年 所有SZGR 2.0基因通路
PID NEPHRIN NEPH1通路 31日 24 所有SZGR 2.0基因通路
PID VEGFR1通路 26 23 所有SZGR 2.0基因通路
PID ECADHERIN稳定途径 42 34 所有SZGR 2.0基因通路
PID VEGFR1 2通道 69年 57 所有SZGR 2.0基因通路
PID FAK通路 59 45 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME发育生物学 396年 292年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME细胞细胞通讯 120年 77年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME抗原激活B细胞受体导致一代的第二信使 29日 24 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME由B细胞受体BCR信号 126年 90年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME识别信号 54 46 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME代的第二信使分子 27 25 所有SZGR 2.0基因通路
由PDGF REACTOME信号 122年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME下游信号转导 95年 76年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME轴突引导 251年 188年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME激活RAC 14 11 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME无袖长衫受体的信号 30. 26 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME NETRIN1信号 41 30. 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME DCC信号介导的吸引力 13 11 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME NEPHRIN交互 20. 15 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME免疫系统 933年 616年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME适应性免疫系统 539年 350年 所有SZGR 2.0基因通路
中村肿瘤区周边与中央DN 634年 384年 所有SZGR 2.0基因通路
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 1382年 904年 所有SZGR 2.0基因通路
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS基本DN 455年 304年 所有SZGR 2.0基因通路
BORCZUK恶性间皮瘤起来 305年 185年 所有SZGR 2.0基因通路
TIEN肠道益生菌2小时DN 88年 53 所有SZGR 2.0基因通路
GRAESSMANN血清剥夺了细胞凋亡 552年 347年 所有SZGR 2.0基因通路
GRAESSMANN MC和血清剥夺 211年 136年 所有SZGR 2.0基因通路
GAUSSMANN MLL AF4融合目标C 170年 114年 所有SZGR 2.0基因通路
农民乳腺癌顶浆分泌和基底 330年 217年 所有SZGR 2.0基因通路
乳腺癌基底VS LULMINAL农民 330年 215年 所有SZGR 2.0基因通路
MEINHOLD卵巢癌低品位DN 20. 16 所有SZGR 2.0基因通路
通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 855年 609年 所有SZGR 2.0基因通路
滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN 483年 336年 所有SZGR 2.0基因通路
杨乳腺癌ESR1散装DN 23 15 所有SZGR 2.0基因通路
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN 584年 395年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA XPRSS INT网络 168年 103年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652年 1023年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA2 PCC网络 423年 265年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA ATM PCC网络 1442年 892年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA CHEK2 PCC网络 779年 480年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA为中心的网络 117年 72年 所有SZGR 2.0基因通路
NUYTTEN EZH2的目标了 1037年 673年 所有SZGR 2.0基因通路
张IKK抑制剂和肿瘤坏死因子 223年 140年 所有SZGR 2.0基因通路
霍夫曼细胞淋巴瘤了 50 35 所有SZGR 2.0基因通路
克罗默转移DN 81年 58 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病了布莱洛克的 1691年 1088年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染48小时血巨细胞病毒DN 504年 323年 所有SZGR 2.0基因通路
亚砷酸YIH应对C4 18 12 所有SZGR 2.0基因通路
犹太人的紫外响应集群D6 37 25 所有SZGR 2.0基因通路
外邦人紫外线高剂量DN 312年 203年 所有SZGR 2.0基因通路
DAZARD应对紫外线这些DN 318年 220年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒6小时DN 160年 101年 所有SZGR 2.0基因通路
桑塞姆APC MYC目标 217年 138年 所有SZGR 2.0基因通路
DN SARRIO上皮间充质转变 154年 101年 所有SZGR 2.0基因通路
VANTVEER乳腺癌ESR1 DN 240年 153年 所有SZGR 2.0基因通路
SHEDDEN肺癌生存A12好 317年 177年 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML和T 8 21易位 368年 247年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA乳腺癌与BRCA1突变 56 27 所有SZGR 2.0基因通路
酒井法子慢性肝炎和肝癌 83年 63年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PILON KLF1目标 1972年 1213年 所有SZGR 2.0基因通路
约翰斯通PARVB目标3 DN 918年 550年 所有SZGR 2.0基因通路
RAO受SALL4同种型B 517年 302年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 137 460年 466年 1 hsa - mir - 137 UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG