概括
基因 4698
象征 NDUFA5
同义词 B13 | CI-13KD-B | CI-13KB | NUFM | UQOR13
描述 NADH:泛氨基酮氧化还原酶亚基A5
参考 MIM:601677|HGNC:HGNC:7688|ENSEMBL:ENSG00000128609|HPRD:03398|Vega:Otthumg00000157348
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q31.33
Pascal P值 0.388
Sherlock P值 0.722
胎儿β -0.753
DMG 1(#研究)
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG04437590 7 123198030 NDUFA5 -0.026 0.34 DMG:Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9882137 CHR3 29494146 NDUFA5 4698 0.12 反式
RS4491879 CHR3 189373908 NDUFA5 4698 0.04 反式
RS4505678 CHR3 189374356 NDUFA5 4698 0.04 反式
RS16894557 CHR6 28999825 NDUFA5 4698 0.18 反式
RS1503026 CHR18 70842605 NDUFA5 4698 0.13 反式
RS12326929 CHR18 70864592 NDUFA5 4698 0.05 反式
RS12327665 CHR19 39622639 NDUFA5 4698 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ATP5O 0.85 0.87
C11orf74 0.85 0.86
mettl5 0.85 0.84
MRPS36 0.85 0.87
ndufa6 0.84 0.83
UQCRH 0.84 0.83
盛大 0.84 0.82
GTF3A 0.83 0.85
PSMB1 0.83 0.86
LSM3 0.83 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FAM38A -0.55 -0.61
AF347015.26 -0.55 -0.56
EPAS1 -0.53 -0.59
AF347015.15 -0.53 -0.51
AF347015.2 -0.52 -0.51
梨1 -0.51 -0.55
myh9 -0.51 -0.53
tenc1 -0.50 -0.52
Caskin2 -0.49 -0.56
TNS1 -0.49 -0.56

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG氧化磷酸化 135 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg阿尔茨海默氏病 169 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg帕金森氏病 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Huntingtons病 185 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome TCA循环和呼吸电子传输 141 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome呼吸电子传输 79 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组呼吸电子传输ATP通过化学含量耦合和热量产生通过解偶联蛋白来合成 98 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Voxphos 87 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 143 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成6 189 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄线粒体基因模块 217 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应13 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg KDM3A靶向缺氧 208 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因