基因页:NDUFA5
概括?
基因 | 4698 |
象征 | NDUFA5 |
同义词 | B13 | CI-13KD-B | CI-13KB | NUFM | UQOR13 |
描述 | NADH:泛氨基酮氧化还原酶亚基A5 |
参考 | MIM:601677|HGNC:HGNC:7688|ENSEMBL:ENSG00000128609|HPRD:03398|Vega:Otthumg00000157348 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q31.33 |
Pascal P值 | 0.388 |
Sherlock P值 | 0.722 |
胎儿β | -0.753 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG04437590 | 7 | 123198030 | NDUFA5 | -0.026 | 0.34 | DMG:Nishioka_2013 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS9882137 | CHR3 | 29494146 | NDUFA5 | 4698 | 0.12 | 反式 | ||
RS4491879 | CHR3 | 189373908 | NDUFA5 | 4698 | 0.04 | 反式 | ||
RS4505678 | CHR3 | 189374356 | NDUFA5 | 4698 | 0.04 | 反式 | ||
RS16894557 | CHR6 | 28999825 | NDUFA5 | 4698 | 0.18 | 反式 | ||
RS1503026 | CHR18 | 70842605 | NDUFA5 | 4698 | 0.13 | 反式 | ||
RS12326929 | CHR18 | 70864592 | NDUFA5 | 4698 | 0.05 | 反式 | ||
RS12327665 | CHR19 | 39622639 | NDUFA5 | 4698 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NDUFA5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ATP5O | 0.85 | 0.87 |
C11orf74 | 0.85 | 0.86 |
mettl5 | 0.85 | 0.84 |
MRPS36 | 0.85 | 0.87 |
ndufa6 | 0.84 | 0.83 |
UQCRH | 0.84 | 0.83 |
盛大 | 0.84 | 0.82 |
GTF3A | 0.83 | 0.85 |
PSMB1 | 0.83 | 0.86 |
LSM3 | 0.83 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FAM38A | -0.55 | -0.61 |
AF347015.26 | -0.55 | -0.56 |
EPAS1 | -0.53 | -0.59 |
AF347015.15 | -0.53 | -0.51 |
AF347015.2 | -0.52 | -0.51 |
梨1 | -0.51 | -0.55 |
myh9 | -0.51 | -0.53 |
tenc1 | -0.50 | -0.52 |
Caskin2 | -0.49 | -0.56 |
TNS1 | -0.49 | -0.56 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG氧化磷酸化 | 135 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg阿尔茨海默氏病 | 169 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg帕金森氏病 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Huntingtons病 | 185 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome TCA循环和呼吸电子传输 | 141 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome呼吸电子传输 | 79 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组呼吸电子传输ATP通过化学含量耦合和热量产生通过解偶联蛋白来合成 | 98 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Voxphos | 87 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成6 | 189 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄线粒体基因模块 | 217 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应13 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg KDM3A靶向缺氧 | 208 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |