基因页:鼻
概括?
基因 | 4703 |
象征 | 鼻 |
同义词 | NEB177D | NEM2 |
描述 | 树星 |
参考 | MIM:161650|HGNC:HGNC:7720|Ensembl:ENSG00000183091|HPRD:01196|Vega:Otthumg00000153784 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q22 |
Pascal P值 | 0.036 |
TADA P值 | 0.008 |
胎儿β | -0.642 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
DNM:Gulsuner_2013 | 整个外显子组测序分析 | 155 DNM通过外显子组对精神分裂症个体及其父母的三重奏测序确定。 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.02395 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
鼻 | CHR2 | 152548856 | 一个 | t | NM_001164507 NM_001164508 NM_001271208 NM_004543 |
p.639y>* p.639y>* p.639y>* p.639y>* |
废话 废话 废话 废话 |
精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 | ||
鼻 | CHR2 | 152362011 | G | 一个 | NM_001164507 NM_001164508 NM_001271208 NM_004543 |
p.7908t> m p.7908t> m p.7943t> m p.6195t> m |
错过 错过 错过 错过 |
精神分裂症 | DNM:Gulsuner_2013 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4854166 | CHR2 | 3297005 | 鼻 | 4703 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NEB_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TMEM126A | 0.89 | 0.85 |
MRPS15 | 0.88 | 0.87 |
MGST3 | 0.87 | 0.80 |
DNAJC19 | 0.87 | 0.85 |
UBL5 | 0.86 | 0.78 |
ndufs3 | 0.86 | 0.81 |
COX7B | 0.86 | 0.83 |
NDUFB6 | 0.86 | 0.79 |
CMC1 | 0.86 | 0.83 |
C14orf2 | 0.85 | 0.83 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
LRP1 | -0.52 | -0.50 |
mtss1l | -0.48 | -0.49 |
MAP4K4 | -0.48 | -0.50 |
PXN | -0.48 | -0.58 |
PHLDB1 | -0.47 | -0.48 |
SMTN | -0.47 | -0.58 |
SLC19A1 | -0.47 | -0.48 |
STK10 | -0.47 | -0.52 |
tnks1bp1 | -0.46 | -0.43 |
AC005035.1 | -0.46 | -0.47 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003779 | 肌动蛋白结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15967462 | |
去:0008307 | 肌肉的结构成分 | 塔斯 | 7739042 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007525 | 体肌发育 | nas | 7739042 | |
GO:0030832 | 肌动蛋白丝长度的调节 | nas | 7739042 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0030018 | Z光盘 | 艾达 | 9501083 | |
GO:0015629 | 肌动蛋白细胞骨架 | 塔斯 | 7739042 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
反应组横纹的肌肉收缩 | 27 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肌肉收缩 | 48 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX FOXO1融合DN的Davicioni目标DN | 68 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌F | 54 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤 | 64 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GHO ATF5靶向 | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P4 | 100 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌与H3K9me3 UP | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PYEON CANER CANCAR HEAD和NECK与宫颈DN | 29 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |