基因页:NDUFC2
概括?
基因 | 4718 |
象征 | NDUFC2 |
同义词 | B14.5B | CI-B14.5B | HLC-1 | NADHDH2 |
描述 | NADH:泛氨基酮氧化还原酶亚基C2 |
参考 | MIM:603845|HGNC:HGNC:7706|ENSEMBL:ENSG00000151366|HPRD:11960|Vega:Otthumg00000166614 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q14.1 |
Pascal P值 | 0.015 |
Sherlock P值 | 0.18 |
胎儿β | -1.281 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG26748758 | 11 | 77792715 | NDUFC2 | 3.97E-4 | 0.171 | 0.044 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2716734 | CHR2 | 39947720 | NDUFC2 | 4718 | 0.01 | 反式 | ||
RS2716736 | CHR2 | 39947946 | NDUFC2 | 4718 | 0.01 | 反式 | ||
SNP_A-2169623 | 0 | NDUFC2 | 4718 | 0.08 | 反式 | |||
RS1587434 | CHR6 | 66615354 | NDUFC2 | 4718 | 0 | 反式 | ||
RS10503771 | CHR8 | 25304019 | NDUFC2 | 4718 | 0.19 | 反式 | ||
RS2408301 | CHR13 | 51808915 | NDUFC2 | 4718 | 0.16 | 反式 | ||
RS16959803 | CHR13 | 88488982 | NDUFC2 | 4718 | 0.18 | 反式 | ||
RS1241940 | CHR14 | 84008851 | NDUFC2 | 4718 | 0.07 | 反式 | ||
RS349973 | CHR17 | 50642288 | NDUFC2 | 4718 | 0.07 | 反式 | ||
RS16952224 | CHR17 | 50868923 | NDUFC2 | 4718 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NDUFC2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
EPN3 | 0.83 | 0.64 |
SCN1A | 0.83 | 0.83 |
AGPAT9 | 0.81 | 0.77 |
NEFM | 0.81 | 0.66 |
Hapln4 | 0.81 | 0.75 |
HCN2 | 0.80 | 0.84 |
ret | 0.80 | 0.75 |
esyt1 | 0.79 | 0.65 |
myh7b | 0.79 | 0.69 |
SSTR3 | 0.78 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
WDR86 | -0.36 | -0.38 |
C9orf46 | -0.34 | -0.56 |
GTF3C6 | -0.33 | -0.48 |
exosc8 | -0.33 | -0.48 |
NR2C2AP | -0.33 | -0.31 |
AC006276.2 | -0.32 | -0.44 |
TBC1D10A | -0.32 | -0.27 |
RPL36 | -0.32 | -0.55 |
plekho1 | -0.32 | -0.29 |
C6orf48 | -0.32 | -0.40 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG氧化磷酸化 | 135 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg阿尔茨海默氏病 | 169 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg帕金森氏病 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Huntingtons病 | 185 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome TCA循环和呼吸电子传输 | 141 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome呼吸电子传输 | 79 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组呼吸电子传输ATP通过化学含量耦合和热量产生通过解偶联蛋白来合成 | 98 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon | 158 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Voxphos | 87 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄线粒体基因模块 | 217 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |