概括
基因 4720
象征 ndufs2
同义词 CI-49
描述 NADH:泛氨基酮氧化还原酶核心亚基S2
参考 MIM:602985|HGNC:HGNC:7708|ENSEMBL:ENSG00000158864|HPRD:04285|Vega:Otthumg0000000034344
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q23
Sherlock P值 4.026E-4
胎儿β -0.305
DMG 2(#研究)
主持人
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG08850169 1 161171469 ndufs2 4.339E-4 -0.375 0.045 DMG:Wockner_2014
CG16275967 1 161172255 ndufs2 9.34e-11 -0.015 4.49e-7 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003954 NADH脱氢酶活性 小鬼 14749350
去:0005506 铁离子结合 IEA -
去:0008137 NADH脱氢酶(泛氨基酮)活性 nas 9647766|9878551
去:0009055 电子载体活动 nas 9647766
GO:0051287 NAD结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
GO:0051539 4铁,4个硫簇结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006120 线粒体电子传输,NADH到泛氨基酮 nas 9647766|9878551
去:0006810 运输 IEA -
去:0006979 对氧化应激的反应 艾达 12857734
去:0022900 电子传输链 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005739 线粒体 艾达 9585441
去:0005739 线粒体 nas 9647766
去:0005747 线粒体呼吸链复合物I 艾达 17209039
去:0005747 线粒体呼吸链复合物I 小鬼 11112787
去:0005747 线粒体呼吸链复合物I nas 9878551
去:0016020 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG氧化磷酸化 135 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg阿尔茨海默氏病 169 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg帕金森氏病 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Huntingtons病 185 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P73Pathway 79 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome TCA循环和呼吸电子传输 141 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome呼吸电子传输 79 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组呼吸电子传输ATP通过化学含量耦合和热量产生通过解偶联蛋白来合成 98 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛克伍德在肺癌中放大 214 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans 185 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Voxphos 87 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫迪海马后产后 63 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄线粒体基因模块 217 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应13 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja Islet HNF1A靶向DN 109 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因