基因页：9月2日
概括？
| 基因 | 4735 |
| 象征 | 9月2日 |
| 同义词 | diff6 | nedd-5 | nedd5 | pnutl3 | hnedd5 |
| 描述 | 9月2日 |
| 参考 | MIM：601506|HGNC：HGNC：7729|ENSEMBL：ENSG00000168385|HPRD：03297|Vega：Otthumg00000133394 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2Q37 |
| Pascal P值 | 0.123 |
| Sherlock P值 | 0.299 |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 下丘脑 伏隔核基底神经节 |
| 支持 | 蛋白质聚类 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS3755397 | 2 | 242294913 | 9月2日 | ENSG00000168385.13 | 4.16226E-9 | 0 | 39637 | gtex_brain_ba24 |
| RS141753202 | 2 | 242352633 | 9月2日 | ENSG00000168385.13 | 1.34629E-9 | 0 | 97357 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 提亚姆2 | 0.93 | 0.86 |
| EML1 | 0.92 | 0.82 |
| foxg1b | 0.92 | 0.91 |
| TMEM108 | 0.91 | 0.87 |
| TP53I11 | 0.90 | 0.88 |
| DAB1 | 0.90 | 0.89 |
| SEZ6 | 0.89 | 0.84 |
| NCK2 | 0.89 | 0.84 |
| Dact1 | 0.89 | 0.87 |
| ZNF238 | 0.89 | 0.93 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| serpinb6 | -0.64 | -0.70 |
| AP003117.1 | -0.61 | -0.62 |
| AIFM3 | -0.61 | -0.74 |
| hepn1 | -0.60 | -0.70 |
| C5orf53 | -0.60 | -0.65 |
| AC007405.8 | -0.60 | -0.67 |
| HLA-F | -0.60 | -0.68 |
| aldoc | -0.59 | -0.64 |
| FBXO2 | -0.59 | -0.57 |
| LDHD | -0.59 | -0.61 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 10321247 | |
| 去：0005525 | GTP结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007049 | 细胞周期 | IEA | - | |
| 去：0051301 | 细胞分裂 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 10942595 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 10942595 | |
| GO：0031105 | 9月复合体 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID CDC42途径 | 70 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Baris甲状腺癌DN | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Seiden满足信号 | 19 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 宁慢性阻塞性肺疾病DN | 121 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iglesias E2F目标 | 151 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sesto对UV C6的反应 | 39 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 村上紫外线响应6小时 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 非政府组织恶性神经胶质瘤1p loh | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-15/16/195/424/497 | 542 | 549 | 1A，M8 | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
| HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
| HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
| HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
| HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
| HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
| mir-485-3p | 171 | 178 | 1A，M8 | HSA-MIR-485-3P | gucauacgggcucucucucucucu |