基因页：NEFM
概括？
| 基因 | 4741 |
| 象征 | NEFM |
| 同义词 | nef3 | nf-m | nfm |
| 描述 | 神经丝，中多肽 |
| 参考 | MIM：162250|HGNC：HGNC：7734|ENSEMBL：ENSG00000104722|HPRD：01205|Vega：Otthumg00000131990 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8p21 |
| Pascal P值 | 0.577 |
| Sherlock P值 | 0.791 |
| 胎儿β | -1.791 |
| 支持 | 结构可塑性 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMANNRC COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.031 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.00057 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.03086 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：5 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.0523 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005198 | 结构分子活性 | IEA | - | |
| 去：0005200 | 细胞骨架的结构成分 | 塔斯 | 3608989 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0031133 | 轴突直径的调节 | IEA | Axon（GO术语级别：14） | - |
| 去：0008088 | 轴突货运运输 | IEA | Axon（GO术语级别：8） | - |
| GO：0000226 | 微管细胞骨架组织 | IEA | - | |
| GO：0045110 | 中间细丝束组件 | IEA | - | |
| GO：0060052 | 神经丝细胞骨架组织 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0031594 | 神经肌肉接头 | IEA | 神经元，轴突，突触，神经递质（GO术语级别：3） | - |
| 去：0005883 | 神经丝 | IEA | 神经元，Axon（GO术语级别：11） | - |
| 去：0005883 | 神经丝 | 塔斯 | 神经元，Axon（GO术语级别：11） | 3608989 |
| GO：0030424 | 轴突 | 塔斯 | 神经元，轴突，神经递质（GO期限：6） | 14662745 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG肌萎缩性侧索硬化症ALS | 53 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni Pax Foxo1签名武器dn | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KIM对TSA和Decitabine的反应 | 129 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX FOXO1融合DN的Davicioni目标DN | 68 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee神经Crest干细胞向上 | 146 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发12小时DN | 57 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼头颈癌C | 113 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 费尔南德斯（Fernandez）由迈克（Myc）约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 史密斯·泰特（Smith Tert）目标DN | 87 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Basso CD40信号向上 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McClung Delta FOSB目标2WK | 48 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard对紫外线nhek的反应 | 244 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染12小时 | 111 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard UV响应集群G2 | 30 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| iwanaga癌变由Kras Pten Up | 181 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马洛尼对17aag的回应 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 142 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dazard UV响应集群G24 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ghandhi直接辐照 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| Let-7/98 | 353 | 359 | 1a | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
| HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
| HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
| HSA-LET-7D脑 | agagguaguagguugcauagu | ||||
| HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
| HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
| HSA-MIR-98脑 | ugagguaaguuguauuguu | ||||
| HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
| HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
| mir-124.1 | 320 | 326 | 1a | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| mir-125/351 | 144 | 150 | M8 | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
| HSA-MIR-125A脑 | ucccugagacccuuaaccugug | ||||
| mir-135 | 25 | 32 | 1A，M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
| HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
| mir-150 | 389 | 395 | 1a | HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug |
| mir-24 | 285 | 292 | 1A，M8 | HSA-MIR-24SZ | uggcucucagagcaggaagag |
| mir-25/32/92/363/367 | 117 | 124 | 1A，M8 | HSA-MIR-25脑 | Cauugcacuugucucggucuga |
| HSA-MIR-32 | uauugcacauacuaaguugc | ||||
| HSA-MIR-92 | uauugcacuugucccgcgcug | ||||
| HSA-MIR-367 | Aauugcacuuuagcaaugga | ||||
| HSA-MIR-92BSZ | uauugcacucgucccgcgcuc | ||||