基因页：NEK1
概括？
| 基因 | 4750 |
| 象征 | NEK1 |
| 同义词 | ny-ren-55 | srps2 | srps2a | srtd6 |
| 描述 | NIMA相关激酶1 |
| 参考 | MIM：604588|HGNC：HGNC：7744|ENSEMBL：ENSG00000137601|HPRD：06847|Vega：Otthumg00000160963 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 4Q33 |
| Pascal P值 | 2.514e-5 |
| Sherlock P值 | 0.909 |
| 胎儿β | 0.414 |
| 主持人 | 小脑半球 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6849558 | 4 | 170301682 | NEK1 | ENSG00000137601.11 | 2.65321E-6 | 0.05 | 232098 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PHF19 | 0.85 | 0.68 |
| smo | 0.84 | 0.75 |
| Notch1 | 0.84 | 0.69 |
| 六 | 0.84 | 0.80 |
| TGIF2 | 0.83 | 0.60 |
| FBXL7 | 0.83 | 0.72 |
| ASAP3 | 0.82 | 0.73 |
| CRB2 | 0.82 | 0.74 |
| jub | 0.82 | 0.67 |
| flna | 0.81 | 0.71 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FGF12 | -0.34 | -0.41 |
| FBXW7 | -0.34 | -0.40 |
| ralyl | -0.34 | -0.44 |
| Fabp3 | -0.33 | -0.35 |
| bex5 | -0.33 | -0.37 |
| serpini1 | -0.33 | -0.38 |
| Bend6 | -0.32 | -0.32 |
| PPEF1 | -0.32 | -0.42 |
| CALM2 | -0.32 | -0.41 |
| LNX1 | -0.32 | -0.40 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CSN2 | CASB | 酪蛋白beta | - | HPRD | 1382974 |
| ctnnal1 | Cllp |FLJ08121 |alpha-catu | Catenin（cadherin相关蛋白），α样1 | NEK1与α-catulin相互作用。 | 绑定 | 14690447 |
| exosc4 | FLJ20591 |RRP41 |RRP41A |RRP41P |Ski6 |Ski6p |HRRP41P |P12A | 外泌体组件4 | - | HPRD | 15231747 |
| Fez1 | - | 魅力和伸长蛋白Zeta 1（Zygin I） | NEK1与FEZ-1相互作用。 | 绑定 | 14690447 |
| Fez2 | hum3cl |MGC117372 | 魅力和伸长蛋白Zeta 2（Zygin II） | NEK1与FEZ-2相互作用。 | 绑定 | 14690447 |
| kif3a | - | 动机家庭成员3A | NEK1与KIF3A相互作用。 | 绑定 | 14690447 |
| mre11a | atld |HNGS1 |mre11 |mre11b | MRE11减数分裂重组11同源物A（S. cerevisiae） | NEK1与MRE11相互作用 | 绑定 | 14690447 |
| PPP2R5D | B56D |MGC2134 |MGC8949 | 蛋白质磷酸酶2，调节亚基B'，三角洲同工型 | NEK1与PP2A相互作用。 | 绑定 | 14690447 |
| TP53BP1 | 53bp1 |FLJ41424 |MGC138366 |P202 | 肿瘤蛋白p53结合蛋白1 | NEK1与53BP1相互作用。 | 绑定 | 14690447 |
| TSC2 | FLJ43106 |林|TSC4 | 结节硬化2 | NEK1与Tuberin相互作用。 | 绑定 | 14690447 |
| 是的 | ywha1 | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，ETA多肽 | NEK1与14-3-3相互作用。 | 绑定 | 14690447 |
| ZNF350 | ZBRK1 |ZFQR | 锌指蛋白350 | NEK1与ZBRK1相互作用 | 绑定 | 14690447 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| SA G2和M阶段 | 8 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 | 205 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU HGF靶向Akt1 DN抑制 | 95 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由EWS FLT1融合绑定的Siligan | 47 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Georges细胞周期miR192目标 | 62 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sakai肿瘤浸润单核细胞DN | 81 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans | 185 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BILD CTNNB1致癌特征 | 82 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Izadpanah干细胞脂肪与骨DN | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ehlers neuploidy up | 41 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| podar对Apaphostin的反应 | 147 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Qi缺氧 | 140 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |