基因页：neo1
概括？
| 基因 | 4756 |
| 象征 | neo1 |
| 同义词 | IGDCC2 | ngn | ntn1r2 |
| 描述 | 新生蛋白1 |
| 参考 | MIM：601907|HGNC：HGNC：7754|Ensembl：ENSG0000000067141|HPRD：03549|Vega：Otthumg00000133509 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 15Q22.3-Q23 |
| Pascal P值 | 0.057 |
| Sherlock P值 | 0.058 |
| DEG P值 | DEG：ZHAO_2015：P = 3.48E-04：Q = 0.0924 |
| 胎儿β | 1.224 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | 细胞粘附和透射信号传导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG：Zhao_2015 | RNA测序分析 | 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。 | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG24906202 | 15 | 73345212 | neo1 | -0.062 | 0.55 | DMG：Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ZBTB7A | 0.84 | 0.79 |
| SYT12 | 0.84 | 0.65 |
| SLC45A4 | 0.83 | 0.72 |
| stac2 | 0.83 | 0.71 |
| FAM78A | 0.82 | 0.74 |
| AC011676.2 | 0.82 | 0.69 |
| KCNAB2 | 0.81 | 0.66 |
| ppard | 0.81 | 0.81 |
| LGI3 | 0.80 | 0.60 |
| iqsec1 | 0.80 | 0.70 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C9orf46 | -0.48 | -0.57 |
| PFDN5 | -0.45 | -0.58 |
| RPL35 | -0.45 | -0.58 |
| AC008073.1 | -0.44 | -0.52 |
| ST20 | -0.44 | -0.61 |
| COX16 | -0.44 | -0.52 |
| RPL12 | -0.43 | -0.57 |
| RPL31 | -0.43 | -0.56 |
| AL358333.1 | -0.43 | -0.50 |
| HEBP2 | -0.43 | -0.58 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg细胞粘附分子凸轮 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组肌发生 | 28 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Netrin1信号传导 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合目标E DN | 22 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由EWS FLT1融合绑定的Siligan | 47 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hasina NOL7目标 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼肿瘤区分良好，而不是很差 | 236 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fab M7类型的Ross Aml | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vantveer乳腺癌转移 | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia延迟对TGFB1的响应 | 39 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染24小时 | 148 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hillion HMGA1目标 | 90 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gavin Foxp3目标集群P3 | 160 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ambrosini Flavopiridol处理TP53 | 109 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝脏开发 | 166 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia对TGFB1 C6的反应 | 5 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1通过NFIC 1HR DN信号传导 | 106 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |