基因页：ATP1A1

概括?
基因ID 476
Symbol ATP1A1
同义词 -
描述 ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 1
参考 MIM：182310|HGNC：HGNC：799|Ensembl:ENSG00000163399|HPRD：01662|Vega：Otthumg0000000012109
基因type protein-coding
地图位置 1p21
Pascal P值 0.251
Sherlock P值 0.966
Fetal beta -2.189
DMG 1（＃研究）
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 ION BALANCE
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.human_clathrin
G2CDB.HUMAN_MGLUR5
G2Cdb.human_Synaptosome
G2CDB.Humanarc
G2Cdb.humanNRC
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
Darnell FMRP targets
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 Psr: 0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） Psr: 0.00814

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position 最近的基因 P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg20309677 1 116925753 ATP1A1 4.477E-4 0.552 0.045 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs12123144 chr1 76550208 ATP1A1 476 0.17 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
ppl 0.66 0.59
AC110760.2 0.59 0.60
ESRRG 0.57 0.59
ECM1 0.57 0.48
FBLN7 0.56 0.56
GALR1 0.56 0.45
VSTM2A 0.54 0.65
RET 0.54 0.62
PKP1 0.54 0.40
KCNS2 0.54 0.58
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
IMPA2 -0.24 -0.36
AC098691.2 -0.22 -0.29
SIGIRR -0.22 -0.33
RPL37 -0.21 -0.28
税务1bp3 -0.21 -0.21
UXT -0.21 -0.19
anp32c -0.21 -0.25
EMX2 -0.21 -0.32
EIF4EBP1 -0.21 -0.18
MPST -0.20 -0.31

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000166 核苷酸结合 IEA -
GO:0000287 镁离子结合 IEA -
去：0003869 4-硝基苯磷酸酶活性 IEA -
GO:0005515 protein binding IEA -
GO:0005515 protein binding 新闻学会 11027149|15671290
GO:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0005391 sodium:potassium-exchanging ATPase activity IEA -
GO:0005391 sodium:potassium-exchanging ATPase activity 塔斯 1975705
GO:0016787 hydrolase activity IEA -
GO：0016820 hydrolase activity, acting on acid anhydrides, catalyzing transmembrane movement of substances IEA -
GO:0015662 ATPase activity, coupled to transmembrane movement of ions, phosphorylative mechanism IEA -
GO:0015077 monovalent inorganic cation transmembrane transporter activity IEA -
GO:0030955 potassium ion binding IEA -
GO:0031402 sodium ion binding IEA -
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0002026 regulation of the force of heart contraction IEA -
去：0008217 regulation of blood pressure IEA -
去：0008152 metabolic process IEA -
GO:0006814 sodium ion transport IEA -
GO:0006812 cation transport IEA -
GO:0006813 钾离子运输 IEA -
去：0006810 transport IEA -
GO：0042493 对药物的反应 IEA -
GO:0030317 精子运动 ISS -
GO:0030641 细胞pH的调节 ISS -
GO:0031947 negative regulation of glucocorticoid biosynthetic process IEA -
GO:0045822 negative regulation of heart contraction IEA -
GO:0045823 positive regulation of heart contraction IEA -
GO：0045989 positive regulation of striated muscle contraction IEA -
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005792 微型体 IEA -
GO:0005624 膜分数 塔斯 1975705
GO:0016020 膜 IEA -
GO:0016021 integral to membrane ISS -
GO:0005890 钠：钾交换ATPase复合物 塔斯 1975705
GO:0016323 basolateral plasma membrane IEA -
GO:0042383 sarcolemma IEA -
GO：0042470 黑色素体 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
add1 adda |MGC3339 |MGC44427 adducin 1 (alpha) - HPRD 10516168
CFL1 CFL cofilin 1 (non-muscle) - HPRD 11139403
EZH2 ENX-1 |ezh1 |KMT6 |MGC9169 enhancer of zeste homolog 2 (Drosophila) 两个杂交 BioGRID 16169070
FXYD1 MGC44983 |PLM FXYD domain containing ion transport regulator 1 - HPRD，Biogrid 14597563
FXYD7 FLJ25096 FXYD domain containing ion transport regulator 7 - HPRD 12093728
MAPK1 ERK | ERK2 | ERT1 | MAPK2 | P42MAPK | PRKM1 | PRKM2 | p38 | p40 | p41 | p41mapk mitogen-activated protein kinase 1 Biochemical Activity BioGRID 15069082
MAPK3 ERK1 | HS44KDAP | HUMKER1A | MGC20180 | P44ERK1 | P44MAPK | PRKM3 mitogen-activated protein kinase 3 - HPRD，Biogrid 15069082
PRKCA AAG6 | MGC129900 | MGC129901 | PKC-alpha | PKCA | PRKACA 蛋白激酶C，α Biochemical Activity BioGRID 15069082
TNFRSF1A CD120a | FPF | MGC19588 | TBP1 | TNF-R | TNF-R-I | TNF-R55 | TNFAR | TNFR1 | TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 肿瘤坏死因子受体超家族，成员1a - HPRD 14743216
TNFRSF1B CD120B |tbpii |TNF-R-II |TNF-R75 |tnfbr |tnfr1b |TNFR2 |TNFR80 |P75 |P75TNFR 肿瘤坏死因子受体超家族，成员1b - HPRD 14743216
TPT1 FLJ27337 |HRF |TCTP |P02 tumor protein, translationally-controlled 1 - HPRD 15383549
TRADD Hs.89862 | MGC11078 通过死亡域与TNFRSF1A相关 - HPRD 14743216


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
Kegg心肌收缩 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ALDOSTERONE REGULATED SODIUM REABSORPTION 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG近端小管碳酸氢盐开垦 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSMEMBRANE TRANSPORT OF SMALL MOLECULES 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ION TRANSPORT BY P TYPE ATPASES 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ION CHANNEL TRANSPORT 55 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WATANABE RECTAL CANCER RADIOTHERAPY RESPONSIVE UP 108 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER BASAL VS MESENCHYMAL UP 121 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer Pthlh靶向 112 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEBOTAEV GR TARGETS UP 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL TGFB1 TARGETS UP 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN UP 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALCALA APOPTOSIS 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 12HR UP 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori小型BII淋巴细胞DN 76 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD BMYB MORPHOLINO DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD BMYB TARGETS 74 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JECHLINGER EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION DN 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合的Zhang目标 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THEILGAARD NEUTROPHIL AT SKIN WOUND UP 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 1 UP 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU CREBBP TARGETS DN 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELASERNA MYOD TARGETS UP 89 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zamora NOS2靶向DN 96 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG AGING CEREBRAL CORTEX DN 54 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克拉斯的iwanaga致癌作用 170 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR UP 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOOTHA PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI PSEUDOPODIA CHEMOTAXIS DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS PROLIFERATION UP 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS UNANNOTATED DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇7的时间反应7 76 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PANGAS TUMOR SUPPRESSION BY SMAD1 AND SMAD5 DN 157 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 UP 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILANGES SERUM SENSITIVE VIA TSC2 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOLLEMAN DAUNORUBICIN B ALL UP 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL UP 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因