基因页：ATP1A2
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| 基因ID | 477 |
| Symbol | ATP1A2 |
| 同义词 | FHM2 | MHP2 |
| 描述 | ATPase Na+/K+运输亚基Alpha 2 |
| 参考 | MIM:182340|HGNC:HGNC:800|Ensembl：ENSG0000000018625|HPRD：01665|Vega：Otthumg00000024080 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q23.2 |
| Sherlock P值 | 0.692 |
| 胎儿β | -1.285 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | ION BALANCE G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_CLATHRIN G2Cdb.human_mGluR5 G2Cdb.human_Synaptosome CompositeSet Darnell FMRP目标 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | This data set includes 560 SNPs associated with schizophrenia. A total of 486 genes were mapped to these SNPs within 50kb. | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | eQTL type |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS13395823 | CHR2 | 225743518 | ATP1A2 | 477 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| BTG2 | 0.60 | 0.33 |
| fos | 0.60 | 0.44 |
| FOXF1 | 0.59 | 0.28 |
| ZFP36 | 0.58 | 0.33 |
| Junb | 0.57 | 0.40 |
| fosb | 0.56 | 0.50 |
| GADD45B | 0.54 | 0.35 |
| apold1 | 0.54 | 0.25 |
| ZC3H12A | 0.53 | 0.16 |
| PRDM1 | 0.53 | 0.24 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RP9P | -0.25 | -0.27 |
| AC007216.4 | -0.25 | -0.30 |
| AGAP4 | -0.23 | -0.27 |
| F8A1 | -0.23 | -0.30 |
| kif21b | -0.23 | -0.19 |
| nkapl | -0.21 | -0.14 |
| klhl1 | -0.21 | -0.16 |
| IL32 | -0.21 | -0.18 |
| EIF5B | -0.21 | -0.19 |
| Stra13 | -0.21 | -0.20 |
第三节。基因本体论注释
| Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | 我知道了 | 12539047 | |
| 去：0005391 | 钠：钾交换ATPase活性 | IMP | 12539047 | |
| GO：0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
| GO:0016820 | 水解酶活性，作用在酸酐上，催化物质的跨膜运动 | IEA | - | |
| GO：0015077 | 单价无机阳离子跨膜转运蛋白活性 | IEA | - | |
| 去：0030955 | 钾离子结合 | IEA | - | |
| GO:0031402 | 钠离子结合 | IEA | - | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
| 去：0006814 | 钠离子运输 | nas | 10642400 | |
| 去：0006813 | 钾离子运输 | nas | 10642400 | |
| 去：0006942 | 调节条纹肌肉收缩 | nas | 10642400 | |
| GO:0030317 | 精子运动 | ISS | - | |
| 去：0030641 | 细胞pH的调节 | ISS | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005737 | cytoplasm | 艾达 | 12539047 | |
| GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | 艾达 | 12539047 | |
| 去：0005890 | sodium:potassium-exchanging ATPase complex | 我知道了 | 12539047 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| 米尔NA family | 目标位置 | 米尔NA ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 2080 | 2087 | 1A，M8 | HSA-MIR-17-5P | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
| HSA-MIR-20A脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
| HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
| HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
| hsa-miR-519d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
| mir-26 | 2218 | 2225 | 1A，M8 | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
| HSA-MIR-26BSZ | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||