SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

GeneID	4781
Symbol	NFIB
同义词	CTF\|HMGIC/NFIB\|NF-I/B\|NF1-B\|NFI-B\|NFI-RED\|NFIB2\|NFIB3
描述	nuclear factor I/B
参考	MIM：600728\|HGNC:HGNC:7785\|ENSEMBL：ENSG00000147862\|HPRD:09008\|Vega:OTTHUMG00000021027
Gene type	protein-coding
地图位置	9p24.1
Pascal P值	0.026
Sherlock P值	0.367
Fetal beta	2.162
DMG	2 (# studies)
eGene	迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因

Gene set name	基因组方法	描述	Info
简历：PGCNP	Genome-wide Association Study	GWAS
DMG:Jaffe_2016	Genome-wide DNA methylation analysis	This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05.	2
DMG:Wockner_2014	Genome-wide DNA methylation analysis	This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24).	2
PMID:cooccur	高通量文献搜索	系统的搜索in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学	高通量文献搜索	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症	Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

Differentially methylated gene

探测	Chromosome	Position	Nearest gene	P (dis)	beta（dis）	FDR (dis)	Study
cg10565589	9	14314066	NFIB	5.076E-4	-0.391	0.047	DMG:Wockner_2014
cg12484370	9	14314970	NFIB	7.13E-8	-0.01	1.72E-5	DMG:Jaffe_2016

eQTL annotation

SNP ID	Chromosome	Position	eGene	Gene Entrez ID	pvalue	qvalue	TSS distance	eQTL type
RS516349		0	NFIB	4781		0.17		trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
PID HNF3A PATHWAY	44	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME RNA POL III TRANSCRIPTION	33	18	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSCRIPTION	210	127	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol I RNA Pol III和线粒体转录	122	80	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME RNA POL III TRANSCRIPTION TERMINATION	19	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PICCALUGA ANGIOIMMUNOBLASTIC LYMPHOMA UP	205	140	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOLLMANN APOPTOSIS VIA CD40 UP	201	125	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN	526	357	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WATANABE COLON CANCER MSI VS MSS DN	81	42	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 DN	391	222	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG RESPONSE TO AZACITIDINE AND TSA DN	70	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURASHVILI BREAST DUCTAL CARCINOMA VS DUCTAL NORMAL DN	198	110	该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与小叶正常DN	69	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN	663	425	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES NTN1 TARGETS UP	17	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAEGER METASTASIS DN	258	141	该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞	275	168	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOEBEKE LYMPHOID STEM CELL DN	86	59	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向	456	228	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 AND HDAC2 TARGETS DN	232	139	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC2 TARGETS DN	133	77	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIDUS METASTASIS UP	214	134	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAMUNYOKOLI OVARIAN CANCER LMP DN	199	124	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAHTOLA MYCOSIS FUNGOIDES SKIN UP	177	113	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN	508	354	该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANHARANTA UTERINE FIBROID DN	67	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN DN	172	112	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN	1781年	1082	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN	770	415	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G	238	135	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN	394	258	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 5 6WK DN	137	97	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP	197	135	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAMAI APOPTOSIS VIA TRAIL UP	584	356	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL TGFB1 TARGETS UP	169	127	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TANAKA METHYLATED IN ESOPHAGEAL CARCINOMA	103	58	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 TTD DN	84	63	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER BASAL VS LULMINAL	330	215	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN	855	609	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 COMMON DN	483	336	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌DN	203	134	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN	1024	594	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES核心九相关	100	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 40 HELA	42	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GEORGES CELL CYCLE MIR192 TARGETS	62	46	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GEORGES TARGETS OF MIR192 AND MIR215	893	528	该途径中的所有SZGR 2.0基因
考夫曼DNA复制基因	147	87	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF SIGNALING DN	90	57	该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝克莫昔芬抵抗DN	52	37	该途径中的所有SZGR 2.0基因
克莱因原发性积液淋巴瘤	51	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RADMACHER AML PROGNOSIS	78	52	该途径中的所有SZGR 2.0基因
IGLESIAS E2F TARGETS UP	151	103	该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS LATE PROGENITOR	544	307	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5 TARGETS UP	203	135	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP	1691年	1088	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 48HR DN	504	323	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE	261	166	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1	528	324	该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEARMAN LUNG CANCER EARLY VS LATE UP	125	89	该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON POOR SURVIVAL AFTER GAMMA RADIATION 8G	95	62	该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON POOR SURVIVAL AFTER GAMMA RADIATION 2G	171	96	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS DN	543	317	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN	593	372	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS DN	591	366	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER CANCER WITH H3K27ME3 UP	295	149	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER RELAPSE IN BONE DN	315	197	该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌萧述三腔的DN	564	326	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL UP	648	398	该途径中的所有SZGR 2.0基因
IZADPANAH STEM CELL ADIPOSE VS BONE DN	108	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP	425	298	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG TUMOR INVASIVENESS DN	210	128	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN	238	145	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN	435	289	该途径中的所有SZGR 2.0基因
COLINA TARGETS OF 4EBP1 AND 4EBP2	356	214	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO HOUSEKEEPING GENES	389	245	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3	1069	729	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI PSEUDOPODIA CHEMOTAXIS DN	457	302	该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn	668	419	该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标	442	263	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML WITH INV 16 TRANSLOCATION	422	277	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S3	266	180	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ADULT TISSUE STEM MODULE	721	492	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAYAMA SOFT TISSUE TUMORS PCA1 DN	74	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 9	76	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS LOW SERUM	100	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GABRIELY MIR21 TARGETS	289	187	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5a靶向DN	213	127	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION UP	570	339	该途径中的所有SZGR 2.0基因
IKEDA MIR30 TARGETS UP	116	87	该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D	882	506	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 TARGETS 1HR DN	6	5	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN	244	157	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 SIGNALING VIA NFIC 1HR DN	106	77	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 SIGNALING VIA NFIC 10HR UP	54	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELACROIX RAR BOUND ES	462	273	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN	784	464	该途径中的所有SZGR 2.0基因
因宗乳腺干细胞向上	146	75	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL UP	289	184	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY LUMINAL MATURE DN	99	74	该途径中的所有SZGR 2.0基因

Gene Page:NFIB