基因页：nfix
概括？
| 基因 | 4784 |
| 象征 | nfix |
| 同义词 | MRSHSS | NF1A | SOTOS2 |
| 描述 | 核因子I/X（CCAAT结合转录因子） |
| 参考 | MIM：164005|HGNC：HGNC：7788|ENSEMBL：ENSG00000008441|HPRD：01234|Vega：Otthumg00000180726 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19p13.3 |
| Pascal P值 | 1.375E-5 |
| Sherlock P值 | 3.606E-4 |
| 胎儿β | -0.199 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 4 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08317284 | 19 | 13106037 | nfix | 2.26e-5 | 0.991 | 0.017 | DMG：Wockner_2014 |
| CG22824635 | 19 | 13112283 | nfix | 5.69e-5 | 0.813 | 0.022 | DMG：Wockner_2014 |
| CG18299835 | 19 | 13207445 | nfix | 1.145E-4 | 0.247 | 0.029 | DMG：Wockner_2014 |
| CG13649253 | 19 | 13198798 | nfix | 2.123E-4 | 0.477 | 0.036 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS791272 | CHR1 | 147235594 | nfix | 4784 | 0.18 | 反式 | ||
| RS4947464 | CHR7 | 50878410 | nfix | 4784 | 0.11 | 反式 | ||
| RS4607971 | Chr10 | 19407890 | nfix | 4784 | 0.16 | 反式 | ||
| RS2358472 | Chr10 | 19963002 | nfix | 4784 | 0.05 | 反式 | ||
| RS2358473 | Chr10 | 19963065 | nfix | 4784 | 0.05 | 反式 | ||
| RS1409742 | Chr10 | 19965438 | nfix | 4784 | 0.05 | 反式 | ||
| RS4366501 | Chr11 | 133380324 | nfix | 4784 | 0.13 | 反式 | ||
| RS9637082 | CHR21 | 21213235 | nfix | 4784 | 0 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 马尔 | 0.96 | 0.93 |
| dbndd2 | 0.96 | 0.93 |
| PLLP | 0.94 | 0.93 |
| GJB1 | 0.94 | 0.94 |
| RNase1 | 0.93 | 0.92 |
| CMTM5 | 0.93 | 0.92 |
| elovl1 | 0.92 | 0.91 |
| PPAP2C | 0.91 | 0.89 |
| TSPAN15 | 0.91 | 0.90 |
| EVI2A | 0.90 | 0.90 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| nkiras2 | -0.57 | -0.68 |
| KIAA1949 | -0.55 | -0.72 |
| tubb2b | -0.55 | -0.76 |
| CRMP1 | -0.54 | -0.65 |
| ZBTB8A | -0.54 | -0.68 |
| HMGB3 | -0.54 | -0.71 |
| 珀格 | -0.54 | -0.66 |
| SH3BP2 | -0.54 | -0.74 |
| DPYSL3 | -0.53 | -0.66 |
| YBX1 | -0.53 | -0.73 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Markey RB1慢性洛夫 | 115 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房5 6WK DN | 137 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房6 7WK UP | 197 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| riz红细胞分化 | 77 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RIZ红细胞分化CCNE1 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rashi对电离辐射3的响应3 | 48 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rashi对电离辐射5的响应5 | 147 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发和癌症Box1 | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer Sox9在前列腺发展中的目标DN | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 考夫曼DNA复制基因 | 147 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 公园HSC vs多能祖先 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Magrangeas多发性骨髓瘤Igll vs Iglk | 42 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| zamora nos2靶向 | 69 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Weigel氧化应激反应 | 35 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔老化的肾脏没有血液 | 222 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伯顿成生成11 | 57 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦克道尔急性肺损伤DN | 48 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 尼古斯基在乳腺癌中过度连接 | 22 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bredemeyer抹布通过ATM而不是通过NFKB向上发出信号 | 49 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤D | 89 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 | 102 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| figueroa aml甲基化簇3 | 170 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| figueroa aml甲基化簇6 | 140 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 | 134 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |