基因页：NHLH1
概括？
| 基因 | 4807 |
| 象征 | NHLH1 |
| 同义词 | Hen1 | NSCL | NSCL1 | BHLHA35 |
| 描述 | Nescient Helix-Loop-helix 1 |
| 参考 | MIM：162360|HGNC：HGNC：7817|ENSEMBL：ENSG00000171786|HPRD：01212|Vega：Otthumg0000000033121 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q22 |
| 胎儿β | 0.584 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC022532.3 | 0.96 | 0.95 |
| MMP25 | 0.76 | 0.72 |
| CLN3 | 0.73 | 0.71 |
| RAMP2 | 0.72 | 0.73 |
| PVRL2 | 0.72 | 0.68 |
| AC100793.2 | 0.71 | 0.70 |
| isyna1 | 0.71 | 0.77 |
| Stra6 | 0.71 | 0.73 |
| MOSPD3 | 0.70 | 0.70 |
| CPNE2 | 0.70 | 0.64 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GBP2 | -0.52 | -0.62 |
| Rapgef4 | -0.52 | -0.61 |
| 9月8日 | -0.51 | -0.59 |
| BCl2L2 | -0.51 | -0.59 |
| chn1 | -0.50 | -0.54 |
| CCNI2 | -0.50 | -0.56 |
| HLA-F | -0.50 | -0.51 |
| 我的天啊 | -0.49 | -0.61 |
| anxa11 | -0.49 | -0.60 |
| FBXO2 | -0.49 | -0.53 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
| GO：0030528 | 转录调节器活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007417 | 中枢神经系统发展 | 塔斯 | 大脑（GO期限：6） | 1328219 |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| 去：0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee神经Crest干细胞向上 | 146 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP DN | 35 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典DN | 59 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pomeroy髓母细胞瘤预后 | 47 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙槽横纹肌肉瘤 | 98 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU GH1外源目标 | 85 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Cerebellum标记 | 85 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生 | 104 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF LCP带有H3K27ME3 | 70 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta EBNA1反相关 | 173 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124/506 | 668 | 674 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 1283 | 1289 | M8 | HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu |
| HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
| HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
| HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
| HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
| HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||