基因页:NHS
概括?
基因 | 4810 |
象征 | NHS |
同义词 | ctrct40 | cxn | scml1 |
描述 | NHS肌动蛋白重塑调节器 |
参考 | MIM:300457|HGNC:HGNC:7820|ENSEMBL:ENSG00000188158|HPRD:02351|Vega:Otthumg0000000022799 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XP22.13 |
Sherlock P值 | 0.173 |
TADA P值 | 0.021 |
胎儿β | -0.126 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:McCarthy_2014 | 整个外显子组测序分析 | 57个三重奏的整个外显子组测序,具有零星或家族性精神分裂症。 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NHS | Chrx | 17744090 | G | 一个 | NM_198270 | P.D601N | 错过SNV | C | d | 精神分裂症 | DNM:McCarthy_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16979498 | CHR20 | 54771303 | NHS | 4810 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NHS_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KDM1 | 0.98 | 0.98 |
FUBP1 | 0.98 | 0.98 |
RBMX | 0.98 | 0.95 |
XRN2 | 0.98 | 0.97 |
KHDRBS1 | 0.97 | 0.98 |
DHX9 | 0.97 | 0.97 |
USP3 | 0.97 | 0.89 |
ODC1 | 0.96 | 0.90 |
EIF4B | 0.96 | 0.93 |
MSH6 | 0.96 | 0.95 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.72 | -0.82 |
C5orf53 | -0.71 | -0.78 |
AIFM3 | -0.70 | -0.79 |
AF347015.27 | -0.69 | -0.92 |
AF347015.31 | -0.69 | -0.92 |
S100B | -0.68 | -0.86 |
pth1r | -0.68 | -0.74 |
AF347015.33 | -0.68 | -0.92 |
MT-CO2 | -0.68 | -0.93 |
FBXO2 | -0.68 | -0.67 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移DN | 161 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |