概括
基因 4810
象征 NHS
同义词 ctrct40 | cxn | scml1
描述 NHS肌动蛋白重塑调节器
参考 MIM:300457|HGNC:HGNC:7820|ENSEMBL:ENSG00000188158|HPRD:02351|Vega:Otthumg0000000022799
基因类型 蛋白质编码
地图位置 XP22.13
Sherlock P值 0.173
TADA P值 0.021
胎儿β -0.126
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:McCarthy_2014 整个外显子组测序分析 57个三重奏的整个外显子组测序,具有零星或家族性精神分裂症。
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
NHS Chrx 17744090 G 一个 NM_198270 P.D601N 错过SNV C d 精神分裂症 DNM:McCarthy_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16979498 CHR20 54771303 NHS 4810 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KDM1 0.98 0.98
FUBP1 0.98 0.98
RBMX 0.98 0.95
XRN2 0.98 0.97
KHDRBS1 0.97 0.98
DHX9 0.97 0.97
USP3 0.97 0.89
ODC1 0.96 0.90
EIF4B 0.96 0.93
MSH6 0.96 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.72 -0.82
C5orf53 -0.71 -0.78
AIFM3 -0.70 -0.79
AF347015.27 -0.69 -0.92
AF347015.31 -0.69 -0.92
S100B -0.68 -0.86
pth1r -0.68 -0.74
AF347015.33 -0.68 -0.92
MT-CO2 -0.68 -0.93
FBXO2 -0.68 -0.67

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移DN 161 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因