基因页:NME2
概括?
基因 | 4831 |
象征 | NME2 |
同义词 | ndkb | ndpk-b | ndpkb | nm23-h2 | nm23b | puf |
描述 | NME/NM23核苷双磷酸激酶2 |
参考 | MIM:156491|HGNC:HGNC:7850|ENSEMBL:ENSG00000011052|ENSEMBL:ENSG00000243678|HPRD:01132|Vega:Otthumg00000154062 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q21.3 |
Pascal P值 | 0.031 |
Sherlock P值 | 0.968 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 细胞代谢 G2CDB.HUMAN_CLATHRIN g2cdb.human_synaptosom g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0283 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS9966136 | CHR18 | 74881659 | NME2 | 4831 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NME2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Rap1gap | 0.81 | 0.87 |
SLC35F3 | 0.80 | 0.83 |
rasgef1a | 0.77 | 0.85 |
SLC12A8 | 0.77 | 0.81 |
CPNE5 | 0.77 | 0.75 |
PDE2A | 0.77 | 0.82 |
DRP2 | 0.76 | 0.80 |
Stim1 | 0.76 | 0.82 |
一只蝙蝠 | 0.76 | 0.76 |
NGEF | 0.76 | 0.79 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
snrpg | -0.41 | -0.53 |
RPL38 | -0.41 | -0.54 |
RPL34 | -0.41 | -0.49 |
RPL31 | -0.40 | -0.43 |
RPS20 | -0.40 | -0.50 |
RPL35A | -0.40 | -0.48 |
RPL27 | -0.40 | -0.42 |
RPL24 | -0.40 | -0.43 |
HEBP2 | -0.39 | -0.54 |
RPL13AP22 | -0.39 | -0.56 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
去:0003700 | 转录因子活性 | 塔斯 | 8392752 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | nas | - | |
去:0004550 | 核苷双磷酸激酶活性 | IEA | - | |
去:0004550 | 核苷双磷酸激酶活性 | 塔斯 | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0016301 | 激酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0009117 | 核苷酸代谢过程 | IEA | - | |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | 塔斯 | 8392752 | |
去:0007155 | 细胞粘附 | 塔斯 | 11919189 | |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
去:0006241 | CTP生物合成过程 | IEA | - | |
去:0006228 | UTP生物合成过程 | IEA | - | |
去:0006183 | GTP生物合成过程 | IEA | - | |
去:0008285 | 细胞增殖的阴性调节 | 塔斯 | - | |
去:0009142 | 核苷三磷酸生物合成过程 | nas | - | |
去:0043066 | 凋亡的负调节 | 小鬼 | 16862176 | |
GO:0045618 | 角质形成细胞分化的阳性调节 | 小鬼 | 16862176 | |
去:0050679 | 上皮细胞增殖的阳性调节 | 小鬼 | 16862176 | |
GO:0045786 | 细胞周期的负调控 | IEA | - | |
GO:0045682 | 表皮发展的调节 | 小鬼 | 16862176 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001726 | 荷叶边 | 艾达 | 11919189 | |
去:0005634 | 核 | nas | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
GO:0030027 | 薄片 | 艾达 | 11919189 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
阿克利 | ACL |ATPCL |clatp | ATP柠檬酸裂解酶 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
AKAP13 | AKAP-LBC |brx |FLJ11952 |FLJ43341 |ha-3 |HT31 |LBC |原始-LB |原始-LBC |C-LBC | 激酶(PRKA)锚蛋白13 | LBC与NM23-H2相互作用。 | 绑定 | 15249197 |
atic | aicar |aicarft |FLJ93545 |损失|purh | 5-氨基咪唑-4-羧酰胺核糖核苷酸甲基转移酶/IMP环丙基水解酶 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
DNM1 | DNM | Dynamin 1 | - | HPRD | 11872741 |
Dync1H1 | DHC1 |DHC1A |DKFZP686P2245 |dnch1 |DNCL |dnecl |dyhc |DNCHC1 |HL-3 |KIAA0325 | p22 | 动力蛋白,细胞质1,重链1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
eppk1 | Epipl |EPIPL1 | Epiplakin 1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
Hist1H2BC | H2B.1 |H2B/L |H2BFL |MGC104246 |DJ221C16.3 | 组蛋白簇1,H2BC | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
Htr1b | 5-HT1B |5-HT1DB |htr1d2 |htr1db |S12 | 5-羟色胺(5-羟色胺)受体1B | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
ITGB1BP1 | DKFZP686K08158 |ICAP-1A |ICAP-1B |ICAP-1Alpha |ICAP1 |ICAP1A |ICAP1B | 整合素β1结合蛋白1 | ICAP-1-Alpha与NM23-H2相互作用。 | 绑定 | 11919189 |
kif5b | Kinh |KNS |KNS1 |UKHC | 动机家庭成员5B | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
莱兹 | lzm | 溶菌酶(肾脏淀粉样变性) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
mobkl3 | 2c4d |CGI-95 |MGC12264 |mob1 |mob3 |prei3 | MOB1,MPS一个粘合激酶激活剂样3(酵母) | - | HPRD | 11872741 |
NME2 | MGC111212 |NDPK-B |NDPKB |NM23-H2 |NM23B |puf | 非转移细胞2,蛋白质(NM23B)在 | - | HPRD,Biogrid | 7658474 |
NME3 | dr-nm23 |KIAA0516 |NDPK-C |NDPKC |NM23-H3 |C371H6.2 | 非转移细胞3,蛋白质在 | - | HPRD,Biogrid | 11042679 |
PDIA6 | ERP5 |P5 |TXNDC7 | 蛋白质二硫化物异构酶家族A,成员6 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
polr2h | RPABC3 |RPB17 |RPB8 |HSRPB8 | 聚合酶(RNA)II(定向DNA)多肽H | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
PPP1R7 | SDS22 | 蛋白质磷酸酶1,调节(抑制剂)亚基7 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
PPP1R8 | ard-1 |ard1 |nipp-1 |nipp1 |Pro2047 | 蛋白质磷酸酶1,调节(抑制剂)亚基8 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
PSMA2 | HC3 |Mu |PMSA2 |PSC2 | 蛋白酶体(Prosome,宏观)亚基,Alpha型,2 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
PSMA7 | C6 |HSPC |MGC3755 |RC6-1 |XAPC7 | 蛋白酶体(Prosome,宏观)亚基,α类型,7 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
罗拉 | DKFZP686M2414 |MGC119326 |MGC119329 |NR1F1 |ROR1 |ROR2 |ROR3 |rzr-alpha |rzra | RAR相关的孤儿受体A | - | HPRD | 8858107 |
RPL38 | - | 核糖体蛋白L38 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
ruvbl2 | CGI-46 |ECP51 |ino80j |reptin |RVB2 |tih2 |TIP48 |TIP49B | ruvb样2(大肠杆菌) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
stip1 | 跳|IEF-SSP-3521 |p60 |sti1 |sti1l | 应力诱导的磷蛋白1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
terf1 | FLJ41416 |PIN2 |trbf1 |trf |trf1 |htrf1-as |T-TRF1 | 端粒重复结合因子(NIMA相互作用)1 | - | HPRD | 9480811 |
terf1 | FLJ41416 |PIN2 |trbf1 |trf |trf1 |htrf1-as |T-TRF1 | 端粒重复结合因子(NIMA相互作用)1 | TRF1与NM23-H2相互作用。 | 绑定 | 9480811 |
vim | FLJ36605 | 波形蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 11082283 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Purine代谢 | 159 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG嘧啶代谢 | 98 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta ndkdynamin途径 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID MYC活动途径 | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
核苷酸的反应组代谢 | 72 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
核苷酸DI和三磷酸的反应组合成和互转换 | 19 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王食道癌与正常 | 121 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LI在肺癌中扩增 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗里德曼衰老 | 77 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bhattacharya胚胎干细胞 | 89 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kaab失败的心房DN | 141 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
村上紫外线响应6小时 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张增殖与静止 | 51 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verrecchia对TGFB1的早期反应 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HNE和TBH的Weigel氧化应激 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab失败心室DN | 41 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verrecchia对TGFB1 C3的响应 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1目标 | 90 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿隆索转移 | 198 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 | 163 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iritani mad1靶向DN | 47 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dang myc的目标 | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
村上紫外线响应1小时 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
替代孕激素靶标 | 36 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙雷帕霉素通过TSC1和TSC2敏感 | 73 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |