概括
基因 4831
象征 NME2
同义词 ndkb | ndpk-b | ndpkb | nm23-h2 | nm23b | puf
描述 NME/NM23核苷双磷酸激酶2
参考 MIM:156491|HGNC:HGNC:7850|ENSEMBL:ENSG00000011052|ENSEMBL:ENSG00000243678|HPRD:01132|Vega:Otthumg00000154062
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q21.3
Pascal P值 0.031
Sherlock P值 0.968
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞代谢
G2CDB.HUMAN_CLATHRIN
g2cdb.human_synaptosom
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0283

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9966136 CHR18 74881659 NME2 4831 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Rap1gap 0.81 0.87
SLC35F3 0.80 0.83
rasgef1a 0.77 0.85
SLC12A8 0.77 0.81
CPNE5 0.77 0.75
PDE2A 0.77 0.82
DRP2 0.76 0.80
Stim1 0.76 0.82
一只蝙蝠 0.76 0.76
NGEF 0.76 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
snrpg -0.41 -0.53
RPL38 -0.41 -0.54
RPL34 -0.41 -0.49
RPL31 -0.40 -0.43
RPS20 -0.40 -0.50
RPL35A -0.40 -0.48
RPL27 -0.40 -0.42
RPL24 -0.40 -0.43
HEBP2 -0.39 -0.54
RPL13AP22 -0.39 -0.56

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0000287 镁离子结合 IEA -
去:0003700 转录因子活性 塔斯 8392752
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 nas -
去:0004550 核苷双磷酸激酶活性 IEA -
去:0004550 核苷双磷酸激酶活性 塔斯 -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0016301 激酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0009117 核苷酸代谢过程 IEA -
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 塔斯 8392752
去:0007155 细胞粘附 塔斯 11919189
去:0006350 转录 IEA -
去:0006241 CTP生物合成过程 IEA -
去:0006228 UTP生物合成过程 IEA -
去:0006183 GTP生物合成过程 IEA -
去:0008285 细胞增殖的阴性调节 塔斯 -
去:0009142 核苷三磷酸生物合成过程 nas -
去:0043066 凋亡的负调节 小鬼 16862176
GO:0045618 角质形成细胞分化的阳性调节 小鬼 16862176
去:0050679 上皮细胞增殖的阳性调节 小鬼 16862176
GO:0045786 细胞周期的负调控 IEA -
GO:0045682 表皮发展的调节 小鬼 16862176
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001726 荷叶边 艾达 11919189
去:0005634 nas -
去:0005737 细胞质 IEA -
GO:0030027 薄片 艾达 11919189

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
阿克利 ACL |ATPCL |clatp ATP柠檬酸裂解酶 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
AKAP13 AKAP-LBC |brx |FLJ11952 |FLJ43341 |ha-3 |HT31 |LBC |原始-LB |原始-LBC |C-LBC 激酶(PRKA)锚蛋白13 LBC与NM23-H2相互作用。 绑定 15249197
atic aicar |aicarft |FLJ93545 |损失|purh 5-氨基咪唑-4-羧酰胺核糖核苷酸甲基转移酶/IMP环丙基水解酶 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
DNM1 DNM Dynamin 1 - HPRD 11872741
Dync1H1 DHC1 |DHC1A |DKFZP686P2245 |dnch1 |DNCL |dnecl |dyhc |DNCHC1 |HL-3 |KIAA0325 | p22 动力蛋白,细胞质1,重链1 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
eppk1 Epipl |EPIPL1 Epiplakin 1 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
Hist1H2BC H2B.1 |H2B/L |H2BFL |MGC104246 |DJ221C16.3 组蛋白簇1,H2BC 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
Htr1b 5-HT1B |5-HT1DB |htr1d2 |htr1db |S12 5-羟色胺(5-羟色胺)受体1B 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
ITGB1BP1 DKFZP686K08158 |ICAP-1A |ICAP-1B |ICAP-1Alpha |ICAP1 |ICAP1A |ICAP1B 整合素β1结合蛋白1 ICAP-1-Alpha与NM23-H2相互作用。 绑定 11919189
kif5b Kinh |KNS |KNS1 |UKHC 动机家庭成员5B 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
莱兹 lzm 溶菌酶(肾脏淀粉样变性) 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
mobkl3 2c4d |CGI-95 |MGC12264 |mob1 |mob3 |prei3 MOB1,MPS一个粘合激酶激活剂样3(酵母) - HPRD 11872741
NME2 MGC111212 |NDPK-B |NDPKB |NM23-H2 |NM23B |puf 非转移细胞2,蛋白质(NM23B)在 - HPRD,Biogrid 7658474
NME3 dr-nm23 |KIAA0516 |NDPK-C |NDPKC |NM23-H3 |C371H6.2 非转移细胞3,蛋白质在 - HPRD,Biogrid 11042679
PDIA6 ERP5 |P5 |TXNDC7 蛋白质二硫化物异构酶家族A,成员6 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
polr2h RPABC3 |RPB17 |RPB8 |HSRPB8 聚合酶(RNA)II(定向DNA)多肽H 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
PPP1R7 SDS22 蛋白质磷酸酶1,调节(抑制剂)亚基7 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
PPP1R8 ard-1 |ard1 |nipp-1 |nipp1 |Pro2047 蛋白质磷酸酶1,调节(抑制剂)亚基8 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
PSMA2 HC3 |Mu |PMSA2 |PSC2 蛋白酶体(Prosome,宏观)亚基,Alpha型,2 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
PSMA7 C6 |HSPC |MGC3755 |RC6-1 |XAPC7 蛋白酶体(Prosome,宏观)亚基,α类型,7 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
罗拉 DKFZP686M2414 |MGC119326 |MGC119329 |NR1F1 |ROR1 |ROR2 |ROR3 |rzr-alpha |rzra RAR相关的孤儿受体A - HPRD 8858107
RPL38 - 核糖体蛋白L38 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
ruvbl2 CGI-46 |ECP51 |ino80j |reptin |RVB2 |tih2 |TIP48 |TIP49B ruvb样2(大肠杆菌) 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
stip1 跳|IEF-SSP-3521 |p60 |sti1 |sti1l 应力诱导的磷蛋白1 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
terf1 FLJ41416 |PIN2 |trbf1 |trf |trf1 |htrf1-as |T-TRF1 端粒重复结合因子(NIMA相互作用)1 - HPRD 9480811
terf1 FLJ41416 |PIN2 |trbf1 |trf |trf1 |htrf1-as |T-TRF1 端粒重复结合因子(NIMA相互作用)1 TRF1与NM23-H2相互作用。 绑定 9480811
vim FLJ36605 波形蛋白 - HPRD,Biogrid 11082283


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Purine代谢 159 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG嘧啶代谢 98 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta ndkdynamin途径 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MYC活动途径 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
核苷酸的反应组代谢 72 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
核苷酸DI和三磷酸的反应组合成和互转换 19 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王食道癌与正常 121 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Myc放大靶向 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗里德曼衰老 77 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhattacharya胚胎干细胞 89 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kaab失败的心房DN 141 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
村上紫外线响应6小时 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张增殖与静止 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1的早期反应 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HNE和TBH的Weigel氧化应激 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab失败心室DN 41 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C3的响应 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1目标 90 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿隆索转移 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iritani mad1靶向DN 47 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dang myc的目标 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
村上紫外线响应1小时 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向 295 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
替代孕激素靶标 36 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙雷帕霉素通过TSC1和TSC2敏感 73 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因