基因页:节点
概括?
基因 | 4838 |
象征 | 节点 |
同义词 | HTX5 |
描述 | 节点生长分化因子 |
参考 | MIM:601265|HGNC:HGNC:7865|HPRD:08370| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q22.1 |
Pascal P值 | 0.101 |
胎儿β | 0.193 |
主持人 | 尾状基底神经节 伏隔核基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NODAL_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
hnrnpc | 0.95 | 0.93 |
NAP1L1 | 0.94 | 0.93 |
CPSF3 | 0.94 | 0.92 |
tinp1 | 0.94 | 0.91 |
mki67ip | 0.93 | 0.94 |
DCAF13 | 0.93 | 0.87 |
haus1 | 0.93 | 0.81 |
CCT2 | 0.92 | 0.91 |
RBMX | 0.92 | 0.92 |
EIF3E | 0.92 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.60 | -0.74 |
AC018755.7 | -0.60 | -0.72 |
SLC9A3R2 | -0.59 | -0.60 |
AF347015.33 | -0.59 | -0.79 |
MT-CO2 | -0.59 | -0.77 |
mt-cyb | -0.58 | -0.77 |
AF347015.31 | -0.57 | -0.75 |
tinagl1 | -0.57 | -0.74 |
AF347015.27 | -0.57 | -0.75 |
ifi27 | -0.57 | -0.77 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg tgf beta信号通路 | 86 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
淋巴结的反应组信号传导 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tesar Alk靶向人ES 5D DN | 7 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kohoutek CCNT2目标 | 58 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WARTERS对IR皮肤的反应 | 83 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |