概括
基因 4838
象征 节点
同义词 HTX5
描述 节点生长分化因子
参考 MIM:601265|HGNC:HGNC:7865|HPRD:08370|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q22.1
Pascal P值 0.101
胎儿β 0.193
主持人 尾状基底神经节
伏隔核基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
hnrnpc 0.95 0.93
NAP1L1 0.94 0.93
CPSF3 0.94 0.92
tinp1 0.94 0.91
mki67ip 0.93 0.94
DCAF13 0.93 0.87
haus1 0.93 0.81
CCT2 0.92 0.91
RBMX 0.92 0.92
EIF3E 0.92 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.60 -0.74
AC018755.7 -0.60 -0.72
SLC9A3R2 -0.59 -0.60
AF347015.33 -0.59 -0.79
MT-CO2 -0.59 -0.77
mt-cyb -0.58 -0.77
AF347015.31 -0.57 -0.75
tinagl1 -0.57 -0.74
AF347015.27 -0.57 -0.75
ifi27 -0.57 -0.77

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg tgf beta信号通路 86 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
淋巴结的反应组信号传导 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tesar Alk靶向人ES 5D DN 7 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kohoutek CCNT2目标 58 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WARTERS对IR皮肤的反应 83 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因