基因页:NOS1
概括?
基因 | 4842 |
象征 | NOS1 |
同义词 | ihps1 | n-nos | nc-nos | nos | bnos | nnos |
描述 | 一氧化氮合酶1 |
参考 | MIM:163731|HGNC:HGNC:7872|Ensembl:ENSG00000089250|HPRD:01226|Vega:Otthumg00000137376 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12Q24.22 |
Pascal P值 | 5.53e-6 |
胎儿β | -0.854 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 皮质 海马 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS g2cdb.human_pocklingtonh1 G2CDB.HUMANNRC g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21273407 | 12 | 117799447 | NOS1 | 3.537E-4 | -0.428 | 0.042 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NOS1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005506 | 铁离子结合 | IEA | - | |
去:0005516 | 钙调蛋白结合 | IEA | - | |
去:0004517 | 一氧化物合酶活性 | IEA | - | |
GO:0020037 | 血红素结合 | IEA | - | |
GO:0010181 | FMN结合 | IEA | - | |
去:0009055 | 电子载体活动 | IEA | - | |
GO:0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
GO:0034617 | 四氢无生物蛋白蛋白结合 | nas | 7488039 | |
GO:0034618 | 精氨酸结合 | 塔斯 | 17029414 | |
GO:0046870 | 镉离子结合 | ISS | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
GO:0050660 | 时尚结合 | IEA | - | |
去:0050661 | NADP结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0042136 | 神经递质生物合成过程 | 塔斯 | 神经元,轴突,突触,神经递质(GO术语级别:9) | 7545544 |
去:0001666 | 对缺氧的反应 | IEP | 16276418 | |
去:0006527 | 精氨酸分解代谢过程 | 我知道了 | 7545544 | |
GO:0010523 | 钙离子转运到细胞质的负调控 | 塔斯 | 17568574 | |
去:0009408 | 对热的反应 | 艾达 | 18048451 | |
去:0007520 | 肌细胞融合 | 塔斯 | 7545544 | |
去:0006809 | 一氧化氮生物合成过程 | IEA | - | |
GO:0033555 | 多细胞生物对胁迫的反应 | 小鬼 | 18391107 | |
GO:0045909 | 血管舒张的阳性调节 | 艾达 | 18048451 | |
GO:0045909 | 血管舒张的阳性调节 | 小鬼 | 18391107 | |
GO:0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
GO:0055117 | 心肌收缩的调节 | 塔斯 | 9892689 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0042995 | 细胞投影 | IEA | Axon(GO术语级别:4) | - |
去:0001917 | 感光器内部段 | ISS | 17027776 | |
去:0005856 | 细胞骨架 | ISS | 7545544 | |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 17892502 | |
GO:0048471 | 细胞质的核周区 | ISS | 17027776 | |
GO:0042383 | 肌膜 | 艾达 | 7545544 | |
GO:0016529 | 肌质网 | 艾达 | 9892689 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
arg1 | - | 精氨酸酶,肝脏 | - | HPRD | 11849441 |
BDKRB2 | b2r |BK-2 |BK2 |BKR2 |brb2 |DKFZP686O088 | Bradykinin受体B2 | - | HPRD,Biogrid | 10681501 |
cav3 | lgmd1c |LQT9 |MGC126100 |MGC126101 |MGC126129 |VIP-21 |VIP21 | 小窝林3 | - | HPRD | 9353265 |
DLG2 | DKFZP781D1854 |DKFZP781E0954 |FLJ37266 |MGC131811 |PSD-93 | 圆盘,大型同源物2,Chapsyn-1110(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 8625413 |
DLG4 | FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 | 圆盘,大型同源物4(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 8625413 |
dynll1 | DLC1 |DLC8 |DNCL1 |DNClc1 |LC8 |LC8A |MGC126137 |MGC126138 |PIN |HDLC1 | Dynein,轻链,LC8型1 | - | HPRD | 8864115 |
HMOX1 | HO-1 |HSP32 |BK286B10 | 血红素氧合酶(Deycling)1 | - | HPRD,Biogrid | 11849436 |
nos1ap | 6330408p19rik |Capon |MGC138500 | 一氧化氮合酶1(神经元)衔接蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 9459447 |
nosip | CGI-25 | 一氧化氮合酶相互作用蛋白 | - | HPRD | 15548660 |
PTPN6 | HCP |HCPH |HPTP1C |PTP-1C |SH-PTP1 |SHP-1 |SHP-1L |SHP1 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体6型 | - | HPRD,Biogrid | 11511520 |
ptprn | FLJ16131 |IA-2 |IA-2/PTP |IA2 |ICA512 |R-PTP-N | 蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,N | - | HPRD | 11043403 |
PUM2 | FLJ36528 |KIAA0235 |MGC138251 |MGC138253 |pumh2 |PUML2 | Pumilio同源2(果蝇) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12690449 |
rasd1 | AGS1 |dexras1 |MGC:26290 | 拉斯,地塞米松诱导的1 | 重构的复合物 | Biogrid | 11086993 |
SNTA1 | SNT1 |tacip1 |DJ1187J4.5 | Syntrophin,Alpha 1(肌营养不良蛋白相关的蛋白A1,59KDA,酸性成分) | - | HPRD | 11747091 |
SNTA1 | SNT1 |tacip1 |DJ1187J4.5 | Syntrophin,Alpha 1(肌营养不良蛋白相关的蛋白A1,59KDA,酸性成分) | 重构的复合物 | Biogrid | 9412493 |
SYN1 | Syn1a |SYN1B |Syni | 突触i | 重构的复合物 | Biogrid | 11867766 |
ZDHHC23 | MGC42530 |nidd | 锌指,DHHC型包含23 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 15105416 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg精氨酸和脯氨酸代谢 | 54 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG长期抑郁症 | 70 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg阿尔茨海默氏病 | 169 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG肌萎缩性侧索硬化症ALS | 53 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta NOS1途径 | 24 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组的潜在感染与结核分枝杆菌的智人感染 | 33 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组一氧化氮刺激鸟苷酸环化酶 | 25 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板稳态 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌C | 113 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞的发育 | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1外源目标 | 85 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Smarca4目标 | 64 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk早期腹部卵泡 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHO NR4A1目标 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冬季缺氧metagene | 242 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS HCP与H3未甲基化 | 80 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES HCP与H3未甲基化 | 63 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 | 228 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |