基因页：CNOT2
概括？
| 基因 | 4848 |
| 象征 | CNOT2 |
| 同义词 | cdc36 | hspc131 | not2 | not2h |
| 描述 | CCR4-NOT转录复合物亚基2 |
| 参考 | MIM：604909|HGNC：HGNC：7878|Ensembl：ENSG00000111596|HPRD：05367|Vega：Otthumg00000169481 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2015年第12季度 |
| Pascal P值 | 0.002 |
| Sherlock P值 | 0.798 |
| 胎儿β | 1.395 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 海马 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG16322581 | 12 | 70636648 | CNOT2 | 3.293E-4 | -0.204 | 0.041 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | CNOT2 | 4848 | 0.01 | 反式 | ||
| RS6128541 | CHR20 | 57917688 | CNOT2 | 4848 | 0.07 | 反式 | ||
| RS1964825 | CHR20 | 57919515 | CNOT2 | 4848 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KeGG RNA降解 | 59 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| mRNA的反应元素化 | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome deadenylation依赖mRNA衰减 | 48 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| hahtola兄弟姐妹fungoides CD4 DN | 116 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vanharanta子宫肌瘤带有7Q删除 | 67 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向神经上皮DN | 164 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌12q13 Q21 Amplicon | 46 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标 | 126 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cromer转移 | 79 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Munshi多发性骨髓瘤DN | 11 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Calorie限制性新皮层 | 83 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard对UV SCC DN的响应 | 123 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard UV响应集群G6 | 153 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦响应集群D3 | 61 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bernard PPAPDC1B目标 | 40 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |