基因页:CNOT3
概括?
基因 | 4849 |
象征 | CNOT3 |
同义词 | leng2 | not3 | not3h |
描述 | CCR4-NOT转录复合物亚基3 |
参考 | MIM:604910|HGNC:HGNC:7879|ENSEMBL:ENSG00000088038|HPRD:05368|Vega:Otthumg0000000066468 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.4 |
Pascal P值 | 0.039 |
Sherlock P值 | 0.639 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Cend1 | 0.83 | 0.85 |
AC068580.3 | 0.78 | 0.84 |
clec2l | 0.77 | 0.84 |
PPAPDC3 | 0.76 | 0.79 |
ankrd9 | 0.76 | 0.75 |
ALKBH6 | 0.76 | 0.81 |
RPS6KA4 | 0.75 | 0.82 |
Tom1 | 0.75 | 0.79 |
PGP | 0.75 | 0.83 |
PRRT3 | 0.74 | 0.82 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RBMX2 | -0.49 | -0.60 |
ZNF435 | -0.47 | -0.43 |
KIAA1949 | -0.47 | -0.39 |
pde9a | -0.47 | -0.52 |
tubb2b | -0.47 | -0.50 |
carhsp1 | -0.46 | -0.54 |
ZNF300 | -0.46 | -0.34 |
ZNF311 | -0.46 | -0.38 |
mycn | -0.46 | -0.25 |
TTC28 | -0.45 | -0.35 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KeGG RNA降解 | 59 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应元素化 | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome deadenylation依赖mRNA衰减 | 48 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Provenzani转移DN | 136 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房5 6WK DN | 137 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP | 197 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA XPRSS INT网络 | 168 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA中心网络 | 117 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
faelt b cll与VH3 21 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍林引用1个目标1 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HIF1A和FOXA2的Qi缺氧靶标 | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |