基因页:CNOT4
概括?
基因 | 4850 |
象征 | CNOT4 |
同义词 | clone243 | not4 | not4h |
描述 | CCR4不转录复合物亚基4 |
参考 | MIM:604911|HGNC:HGNC:7880|ENSEMBL:ENSG00000080802|HPRD:05369|Vega:Otthumg00000155568 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q33 |
Pascal P值 | 0.037 |
Sherlock P值 | 0.844 |
胎儿β | 0.053 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG06145308 | 7 | 135195101 | CNOT4 | -0.028 | 0.25 | DMG:Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CNOT4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
sema3g | 0.79 | 0.77 |
工程 | 0.77 | 0.74 |
mmrn2 | 0.75 | 0.77 |
CD34 | 0.75 | 0.73 |
她 | 0.73 | 0.76 |
ptrf | 0.72 | 0.76 |
EPAS1 | 0.71 | 0.73 |
ABCB1 | 0.70 | 0.69 |
DOCK6 | 0.69 | 0.70 |
Smad6 | 0.69 | 0.69 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NDUFAF2 | -0.56 | -0.64 |
PPP2R3C | -0.55 | -0.60 |
Znf32 | -0.53 | -0.60 |
FRG1 | -0.53 | -0.61 |
OXSM | -0.53 | -0.57 |
C18orf21 | -0.53 | -0.55 |
TCTEX1D2 | -0.52 | -0.60 |
FAM92A1 | -0.51 | -0.53 |
Med19 | -0.51 | -0.54 |
C17orf42 | -0.51 | -0.56 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KeGG RNA降解 | 59 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应元素化 | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome deadenylation依赖mRNA衰减 | 48 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rodrigues NTN1靶向DN | 158 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对UV SCC DN的响应 | 123 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard UV响应集群G6 | 153 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |