概括
基因 4850
象征 CNOT4
同义词 clone243 | not4 | not4h
描述 CCR4不转录复合物亚基4
参考 MIM:604911|HGNC:HGNC:7880|ENSEMBL:ENSG00000080802|HPRD:05369|Vega:Otthumg00000155568
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7Q33
Pascal P值 0.037
Sherlock P值 0.844
胎儿β 0.053
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06145308 7 135195101 CNOT4 -0.028 0.25 DMG:Nishioka_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
sema3g 0.79 0.77
工程 0.77 0.74
mmrn2 0.75 0.77
CD34 0.75 0.73
0.73 0.76
ptrf 0.72 0.76
EPAS1 0.71 0.73
ABCB1 0.70 0.69
DOCK6 0.69 0.70
Smad6 0.69 0.69
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NDUFAF2 -0.56 -0.64
PPP2R3C -0.55 -0.60
Znf32 -0.53 -0.60
FRG1 -0.53 -0.61
OXSM -0.53 -0.57
C18orf21 -0.53 -0.55
TCTEX1D2 -0.52 -0.60
FAM92A1 -0.51 -0.53
Med19 -0.51 -0.54
C17orf42 -0.51 -0.56

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KeGG RNA降解 59 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mRNA的反应元素化 22 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mRNA的反应组代谢 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome deadenylation依赖mRNA衰减 48 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues NTN1靶向DN 158 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对UV SCC DN的响应 123 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因