基因页：npy
Summary？
| 基因ID | 4852 |
| Symbol | npy |
| 同义词 | pyy4 |
| 描述 | 神经肽y |
| 参考 | MIM:162640|HGNC：HGNC：7955|ENSEMBL：ENSG00000122585|HPRD：01214|Vega：Otthumg0000000022973 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7p15.1 |
| Pascal P值 | 0.361 |
| Sherlock P值 | 0.254 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | NEUROTROPHIN SIGNALING |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008), association studies | 2 | 链接到Szgene |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 3 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG02484210 | 7 | 24325371 | npy | 3.124e-4 | -0.534 | 0.04 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10006027 | CHR4 | 21631107 | npy | 4852 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf23 | 0.97 | 0.92 |
| Sox5 | 0.90 | 0.89 |
| FEZF2 | 0.90 | 0.86 |
| nfib | 0.87 | 0.86 |
| XPR1 | 0.86 | 0.86 |
| NAB1 | 0.85 | 0.73 |
| PCSK5 | 0.85 | 0.84 |
| PELI2 | 0.85 | 0.74 |
| RBPSUH | 0.84 | 0.70 |
| AL512631.1 | 0.83 | 0.74 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| serpinb6 | -0.45 | -0.72 |
| SUOX | -0.44 | -0.02 |
| TNFSF12 | -0.44 | -0.59 |
| SLC9A3R2 | -0.43 | -0.47 |
| LGI4 | -0.43 | -0.35 |
| HDDC2 | -0.42 | -0.51 |
| C19orf66 | -0.42 | -0.35 |
| NOL3 | -0.41 | -0.48 |
| TMEM54 | -0.40 | -0.47 |
| RAMP3 | -0.40 | -0.21 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005184 | 神经肽激素活性 | 塔斯 | 轴突，突触，大脑，神经递质（GO期限：6） | 2427515 |
| 去：0001664 | G蛋白偶联受体结合 | IEA | - | |
| 去：0004930 | G蛋白偶联受体活性 | 塔斯 | 1321422 | |
| 去：0005246 | 钙通道调节剂活性 | 塔斯 | 8132547 | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | 10557353 |
| 去：0007218 | 神经肽信号通路 | IEA | 神经递质（GO期限：8） | - |
| 去：0007187 | G-protein signaling, coupled to cyclic nucleotide second messenger | 塔斯 | 8132547 | |
| 去：0008217 | 血压调节 | IEA | - | |
| 去：0008283 | 细胞增殖 | 塔斯 | 10488139 | |
| 去：0008343 | 成人喂养行为 | ISS | - | |
| 去：0007586 | 消化 | nas | 8421707 | |
| 去：0006816 | 钙离子传输 | 塔斯 | 8132547 | |
| GO:0006928 | 细胞运动 | 塔斯 | 10488139 | |
| GO：0032100 | 食欲的积极调节 | ISS | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| 去：0005615 | 细胞外空间 | ISS | - | |
| 去：0005623 | 细胞 | 塔斯 | 2444979 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-33 | 83 | 89 | M8 | HSA-MIR-33 | Gugcauuguuguugcauug |
| HSA-MIR-33b | Gugcauugcuguugcauugca | ||||
| mir-381 | 134 | 140 | 1a | HSA-MIR-381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |