基因页：Notch4
Summary？
| 基因ID | 4855 |
| Symbol | Notch4 |
| 同义词 | INT3 |
| 描述 | Notch 4 |
| 参考 | MIM:164951|HGNC：HGNC：7884|Ensembl：ENSG00000204301|HPRD:01290|Vega：Otthumg00000031044 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.3 |
| Pascal P值 | 1E-12 |
| Sherlock P值 | 0.15 |
| 胎儿beta | -0.546 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 耶和华 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | This data set includes 560 SNPs associated with schizophrenia. A total of 486 genes were mapped to these SNPs within 50kb. | |
| CV:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136例对照。 | 1 |
| PMID：COOCCUR | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 一个组合比值比方法（Sun等。2008), association studies | 2 | 链接到Szgene |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG26950898 | 6 | 32164380 | Notch4 | 9.49e-8 | -0.007 | 2.14e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7132043 | CHR12 | 80968399 | Notch4 | 4855 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共同表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NPY5R | 0.76 | 0.86 |
| PROM1 | 0.75 | 0.63 |
| npnt | 0.75 | 0.62 |
| grap2 | 0.74 | 0.59 |
| 3月1日 | 0.74 | 0.82 |
| ARHGAP15 | 0.73 | 0.60 |
| LMO4 | 0.73 | 0.84 |
| AC079061.1 | 0.72 | 0.84 |
| GRM7 | 0.72 | 0.79 |
| RBM24 | 0.72 | 0.83 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| REEP6 | -0.50 | -0.47 |
| UBTD1 | -0.48 | -0.59 |
| HSD17B14 | -0.47 | -0.63 |
| RHBDL3 | -0.46 | -0.59 |
| AIFM3 | -0.46 | -0.57 |
| TSC22D4 | -0.45 | -0.58 |
| S100B | -0.45 | -0.59 |
| BDH2 | -0.44 | -0.59 |
| ACSF2 | -0.44 | -0.64 |
| Renbp | -0.44 | -0.52 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004872 | 受体活性 | tas | 11823422 | |
| 去：0005509 | calcium ion binding | IEA | - | |
| 去：0005509 | calcium ion binding | tas | 11823422 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 7671825 | |
| 去：0046982 | 蛋白质异构化活性 | tas | 8681805 | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
| GO:0001569 | patter | ISS | - | |
| 去：0001709 | 细胞命运确定 | tas | 11823422 | |
| 去：0001763 | morphogenesis of a branching structure | ISS | - | |
| GO:0006350 | 转录 | IEA | - | |
| GO:0007219 | Notch信号通路 | IEA | - | |
| 去：0009790 | embryonic development | ISS | - | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| 去：0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
| 去：0030879 | mammary gland development | 艾达 | 9576833 | |
| 去：0050793 | 发育过程的调节 | IEA | - | |
| 去：0030097 | 血压 | tas | 11532344 | |
| GO：0045602 | 内皮细胞分化的负调控 | ISS | - | |
| 去：0045893 | 转录，DNA依赖性的阳性调节 | tas | 11823422 | |
| 细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | tas | 8681805 | |
| GO:0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| GO:0009986 | 细胞表面 | 艾达 | 11823422 | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | tas | 11823422 |