概括
基因 4856
象征 十一月
同义词 CCN3 | IBP-9 | IGFBP-9 | IGFBP9 | Novh
描述 肾细胞瘤过表达
参考 MIM:164958|HGNC:HGNC:7885|Ensembl:ENSG00000136999|HPRD:01291|Vega:Otthumg00000164984
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q24.1
Pascal P值 0.653
胎儿β -0.95
主持人 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17535450 CHR2 39900012 十一月 4856 0.01 反式
RS11706314 CHR3 45309716 十一月 4856 3.461E-5 反式
RS11706394 CHR3 45309907 十一月 4856 0 反式
RS2922180 CHR3 125280472 十一月 4856 0.05 反式
RS2976809 CHR3 125451738 十一月 4856 0.02 反式
RS17090446 CHR4 62255221 十一月 4856 0.03 反式
RS7668550 CHR4 104384355 十一月 4856 0.07 反式
RS17034860 CHR4 135177933 十一月 4856 0.13 反式
RS16894149 CHR5 61013724 十一月 4856 0.02 反式
RS6449550 CHR5 61034312 十一月 4856 0.01 反式
RS4489051 CHR5 147954484 十一月 4856 0.04 反式
RS17056435 CHR5 158453782 十一月 4856 0.02 反式
RS9313797 CHR5 158465457 十一月 4856 0.01 反式
RS17056474 CHR5 158468105 十一月 4856 0.01 反式
RS2294262 CHR6 16108966 十一月 4856 0.06 反式
RS9321275 CHR6 131493217 十一月 4856 0.07 反式
RS6593322 CHR7 51048058 十一月 4856 0.17 反式
RS2199402 CHR8 9201002 十一月 4856 0.04 反式
RS7841407 CHR8 9243427 十一月 4856 0 反式
RS9325776 CHR8 15817555 十一月 4856 0.19 反式
RS16929424 CHR8 63608389 十一月 4856 0.15 反式
RS16908622 CHR8 139231604 十一月 4856 0.06 反式
RS2066720 Chr9 107554068 十一月 4856 0.02 反式
RS9423711 Chr10 2574802 十一月 4856 0.04 反式
RS4514358 Chr10 43861923 十一月 4856 0.01 反式
RS822083 Chr10 108713231 十一月 4856 0.11 反式
RS11820030 Chr11 76133564 十一月 4856 0 反式
RS17134872 Chr11 76139845 十一月 4856 2.289E-4 反式
RS10751255 0 十一月 4856 0.02 反式
RS11236774 Chr11 76234952 十一月 4856 2.289E-4 反式
RS9532792 CHR13 41912654 十一月 4856 0.05 反式
RS9590586 CHR13 41913130 十一月 4856 0.02 反式
RS7358856 CHR13 41931609 十一月 4856 0.02 反式
RS7358853 CHR13 41931685 十一月 4856 0.01 反式
RS8002343 CHR13 41952090 十一月 4856 0.02 反式
RS9315839 CHR13 41952872 十一月 4856 0.04 反式
RS4349050 CHR13 41958722 十一月 4856 0 反式
RS7982172 CHR13 41969697 十一月 4856 7.174E-4 反式
RS4942043 CHR13 41978218 十一月 4856 9.529E-4 反式
RS4402447 CHR13 41984741 十一月 4856 0 反式
RS1750009 CHR13 42657093 十一月 4856 0.09 反式
RS9529974 CHR13 72821935 十一月 4856 0.06 反式
RS17720221 CHR13 75182377 十一月 4856 0.05 反式
RS10149864 CHR14 86719683 十一月 4856 0.15 反式
RS2093759 CHR14 97171024 十一月 4856 0.13 反式
RS17244419 CHR14 97171074 十一月 4856 0.06 反式
RS11073814 CHR15 89378883 十一月 4856 0.1 反式
RS7165622 CHR15 93979910 十一月 4856 0.02 反式
RS17294918 CHR16 52717122 十一月 4856 0.09 反式
RS16941390 CHR17 45050984 十一月 4856 0.07 反式
RS4987765 CHR18 60905021 十一月 4856 0.01 反式
RS11873703 CHR18 61448702 十一月 4856 4.187E-4 反式
RS17191809 CHR21 36444778 十一月 4856 0.19 反式
RS6000401 CHR22 37149335 十一月 4856 0.03 反式
RS5991662 Chrx 43335796 十一月 4856 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Tapt1 0.60 0.58
C1QL1 0.60 0.66
CPNE8 0.59 0.69
FGF14 0.59 0.63
L3MBTL4 0.57 0.56
syde2 0.57 0.65
CBLN2 0.55 0.63
necab1 0.54 0.65
NDST3 0.54 0.57
PGBD5 0.53 0.59
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Impa2 -0.27 -0.36
Rab13 -0.27 -0.36
GNG5 -0.27 -0.34
AC098691.2 -0.27 -0.29
rfxank -0.25 -0.32
Rab34 -0.25 -0.24
C1orf61 -0.25 -0.25
H2AFJ -0.24 -0.31
GRTP1 -0.23 -0.25
IRF7 -0.23 -0.32

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
西肾上腺皮质标记DN 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血髓样DN 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
igarashi atf4靶向dn 90 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
帕帕斯帕斯帕贝多诺斯不稳定的动脉粥样硬化斑块DN 43 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2A DN 141 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Seitz肿瘤转化通过8p删除 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ETS1和SP100 DN的Yordy倒数调节 87 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
鲍德温·普拉奇(Baldwin Prkci)瞄准 35 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF的反应 223 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON 157 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向DN 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 77 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布鲁诺造血 66 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时DN 148 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Delta FOSB目标2WK 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Simbulan Parp1靶向 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kang氟尿嘧啶抵抗 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向 100 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 222 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Burton脂肪形成峰在0hr 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YIH对砷C3的反应 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stearman肿瘤场效应 36 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stearman肺癌早期与晚期DN 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
泰勒在急性淋巴细胞白血病中甲基化 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Vav3前列腺致癌作用 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇1的时间反应1 68 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAE BRCA1靶向 75 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
plasari nfic目标基础DN 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 1小时信号传导 33 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM糖蛋白 196 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因