基因页:十一月
概括?
基因 | 4856 |
象征 | 十一月 |
同义词 | CCN3 | IBP-9 | IGFBP-9 | IGFBP9 | Novh |
描述 | 肾细胞瘤过表达 |
参考 | MIM:164958|HGNC:HGNC:7885|Ensembl:ENSG00000136999|HPRD:01291|Vega:Otthumg00000164984 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q24.1 |
Pascal P值 | 0.653 |
胎儿β | -0.95 |
主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17535450 | CHR2 | 39900012 | 十一月 | 4856 | 0.01 | 反式 | ||
RS11706314 | CHR3 | 45309716 | 十一月 | 4856 | 3.461E-5 | 反式 | ||
RS11706394 | CHR3 | 45309907 | 十一月 | 4856 | 0 | 反式 | ||
RS2922180 | CHR3 | 125280472 | 十一月 | 4856 | 0.05 | 反式 | ||
RS2976809 | CHR3 | 125451738 | 十一月 | 4856 | 0.02 | 反式 | ||
RS17090446 | CHR4 | 62255221 | 十一月 | 4856 | 0.03 | 反式 | ||
RS7668550 | CHR4 | 104384355 | 十一月 | 4856 | 0.07 | 反式 | ||
RS17034860 | CHR4 | 135177933 | 十一月 | 4856 | 0.13 | 反式 | ||
RS16894149 | CHR5 | 61013724 | 十一月 | 4856 | 0.02 | 反式 | ||
RS6449550 | CHR5 | 61034312 | 十一月 | 4856 | 0.01 | 反式 | ||
RS4489051 | CHR5 | 147954484 | 十一月 | 4856 | 0.04 | 反式 | ||
RS17056435 | CHR5 | 158453782 | 十一月 | 4856 | 0.02 | 反式 | ||
RS9313797 | CHR5 | 158465457 | 十一月 | 4856 | 0.01 | 反式 | ||
RS17056474 | CHR5 | 158468105 | 十一月 | 4856 | 0.01 | 反式 | ||
RS2294262 | CHR6 | 16108966 | 十一月 | 4856 | 0.06 | 反式 | ||
RS9321275 | CHR6 | 131493217 | 十一月 | 4856 | 0.07 | 反式 | ||
RS6593322 | CHR7 | 51048058 | 十一月 | 4856 | 0.17 | 反式 | ||
RS2199402 | CHR8 | 9201002 | 十一月 | 4856 | 0.04 | 反式 | ||
RS7841407 | CHR8 | 9243427 | 十一月 | 4856 | 0 | 反式 | ||
RS9325776 | CHR8 | 15817555 | 十一月 | 4856 | 0.19 | 反式 | ||
RS16929424 | CHR8 | 63608389 | 十一月 | 4856 | 0.15 | 反式 | ||
RS16908622 | CHR8 | 139231604 | 十一月 | 4856 | 0.06 | 反式 | ||
RS2066720 | Chr9 | 107554068 | 十一月 | 4856 | 0.02 | 反式 | ||
RS9423711 | Chr10 | 2574802 | 十一月 | 4856 | 0.04 | 反式 | ||
RS4514358 | Chr10 | 43861923 | 十一月 | 4856 | 0.01 | 反式 | ||
RS822083 | Chr10 | 108713231 | 十一月 | 4856 | 0.11 | 反式 | ||
RS11820030 | Chr11 | 76133564 | 十一月 | 4856 | 0 | 反式 | ||
RS17134872 | Chr11 | 76139845 | 十一月 | 4856 | 2.289E-4 | 反式 | ||
RS10751255 | 0 | 十一月 | 4856 | 0.02 | 反式 | |||
RS11236774 | Chr11 | 76234952 | 十一月 | 4856 | 2.289E-4 | 反式 | ||
RS9532792 | CHR13 | 41912654 | 十一月 | 4856 | 0.05 | 反式 | ||
RS9590586 | CHR13 | 41913130 | 十一月 | 4856 | 0.02 | 反式 | ||
RS7358856 | CHR13 | 41931609 | 十一月 | 4856 | 0.02 | 反式 | ||
RS7358853 | CHR13 | 41931685 | 十一月 | 4856 | 0.01 | 反式 | ||
RS8002343 | CHR13 | 41952090 | 十一月 | 4856 | 0.02 | 反式 | ||
RS9315839 | CHR13 | 41952872 | 十一月 | 4856 | 0.04 | 反式 | ||
RS4349050 | CHR13 | 41958722 | 十一月 | 4856 | 0 | 反式 | ||
RS7982172 | CHR13 | 41969697 | 十一月 | 4856 | 7.174E-4 | 反式 | ||
RS4942043 | CHR13 | 41978218 | 十一月 | 4856 | 9.529E-4 | 反式 | ||
RS4402447 | CHR13 | 41984741 | 十一月 | 4856 | 0 | 反式 | ||
RS1750009 | CHR13 | 42657093 | 十一月 | 4856 | 0.09 | 反式 | ||
RS9529974 | CHR13 | 72821935 | 十一月 | 4856 | 0.06 | 反式 | ||
RS17720221 | CHR13 | 75182377 | 十一月 | 4856 | 0.05 | 反式 | ||
RS10149864 | CHR14 | 86719683 | 十一月 | 4856 | 0.15 | 反式 | ||
RS2093759 | CHR14 | 97171024 | 十一月 | 4856 | 0.13 | 反式 | ||
RS17244419 | CHR14 | 97171074 | 十一月 | 4856 | 0.06 | 反式 | ||
RS11073814 | CHR15 | 89378883 | 十一月 | 4856 | 0.1 | 反式 | ||
RS7165622 | CHR15 | 93979910 | 十一月 | 4856 | 0.02 | 反式 | ||
RS17294918 | CHR16 | 52717122 | 十一月 | 4856 | 0.09 | 反式 | ||
RS16941390 | CHR17 | 45050984 | 十一月 | 4856 | 0.07 | 反式 | ||
RS4987765 | CHR18 | 60905021 | 十一月 | 4856 | 0.01 | 反式 | ||
RS11873703 | CHR18 | 61448702 | 十一月 | 4856 | 4.187E-4 | 反式 | ||
RS17191809 | CHR21 | 36444778 | 十一月 | 4856 | 0.19 | 反式 | ||
RS6000401 | CHR22 | 37149335 | 十一月 | 4856 | 0.03 | 反式 | ||
RS5991662 | Chrx | 43335796 | 十一月 | 4856 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NOV_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Tapt1 | 0.60 | 0.58 |
C1QL1 | 0.60 | 0.66 |
CPNE8 | 0.59 | 0.69 |
FGF14 | 0.59 | 0.63 |
L3MBTL4 | 0.57 | 0.56 |
syde2 | 0.57 | 0.65 |
CBLN2 | 0.55 | 0.63 |
necab1 | 0.54 | 0.65 |
NDST3 | 0.54 | 0.57 |
PGBD5 | 0.53 | 0.59 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Impa2 | -0.27 | -0.36 |
Rab13 | -0.27 | -0.36 |
GNG5 | -0.27 | -0.34 |
AC098691.2 | -0.27 | -0.29 |
rfxank | -0.25 | -0.32 |
Rab34 | -0.25 | -0.24 |
C1orf61 | -0.25 | -0.25 |
H2AFJ | -0.24 | -0.31 |
GRTP1 | -0.23 | -0.25 |
IRF7 | -0.23 | -0.32 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
西肾上腺皮质标记DN | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血髓样DN | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
igarashi atf4靶向dn | 90 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
帕帕斯帕斯帕贝多诺斯不稳定的动脉粥样硬化斑块DN | 43 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 | 329 | 219 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2A DN | 141 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Seitz肿瘤转化通过8p删除 | 73 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ETS1和SP100 DN的Yordy倒数调节 | 87 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
鲍德温·普拉奇(Baldwin Prkci)瞄准 | 35 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON | 157 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向DN | 35 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 | 77 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
布鲁诺造血 | 66 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染24小时DN | 148 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Delta FOSB目标2WK | 48 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Simbulan Parp1靶向 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kang氟尿嘧啶抵抗 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 | 222 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Burton脂肪形成峰在0hr | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YIH对砷C3的反应 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stearman肿瘤场效应 | 36 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stearman肺癌早期与晚期DN | 61 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
泰勒在急性淋巴细胞白血病中甲基化 | 77 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Vav3前列腺致癌作用 | 89 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇1的时间反应1 | 68 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BAE BRCA1靶向 | 75 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
plasari nfic目标基础DN | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1通过NFIC 1小时信号传导 | 33 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM糖蛋白 | 196 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |